The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Alfoeldi Jessica) > Sharpe Ted > Searle Steve > The genomic substra...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Brawand, David (författare)

The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish

Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2014-09-03
Springer Science and Business Media LLC,2014
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-235066
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-235066URI
https://doi.org/10.1038/nature13726DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

De tre sista författarna delar sistaförfattarskapet.
Cichlid fishes are famous for large, diverse and replicated adaptive radiations in the Great Lakes of East Africa. To understand themolecular mechanisms underlying cichlid phenotypic diversity, we sequenced the genomes and transcriptomes of five lineages of African cichlids: the Nile tilapia (Oreochromis niloticus), an ancestral lineage with low diversity; and four members of the East African lineage: Neolamprologus brichardi/pulcher (older radiation, Lake Tanganyika), Metriaclima zebra (recent radiation, Lake Malawi), Pundamilia nyererei (very recent radiation, Lake Victoria), and Astatotilapia burtoni (riverine species around Lake Tanganyika). We found an excess of gene duplications in the East African lineage compared to tilapia and other teleosts, an abundance of non-coding element divergence, accelerated coding sequence evolution, expression divergence associated with transposable element insertions, and regulation by novel microRNAs. In addition, we analysed sequence data from sixty individuals representing six closely related species from Lake Victoria, and show genome-wide diversifying selection on coding and regulatory variants, some of which were recruited from ancient polymorphisms. We conclude that a number of molecular mechanisms shaped East African cichlid genomes, and that amassing of standing variation during periods of relaxed purifying selection may have been important in facilitating subsequent evolutionary diversification.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Wagner, Catherine E. (författare)
Li, Yang I. (författare)
Malinsky, Milan (författare)
Keller, Irene (författare)
Fan, Shaohua (författare)
Simakov, Oleg (författare)
Ng, Alvin Y. (författare)
Lim, Zhi Wei (författare)
Bezault, Etienne (författare)
Turner-Maier, Jason (författare)
Johnson, Jeremy (författare)
Alcazar, Rosa (författare)
Noh, Hyun Ji (författare)
Russell, Pamela (författare)
Aken, Bronwen (författare)
Alfoeldi, Jessica (författare)
Amemiya, Chris (författare)
Azzouzi, Naoual (författare)
Baroiller, Jean-Francois (författare)
Barloy-Hubler, Frederique (författare)
Berlin, Aaron (författare)
Bloomquist, Ryan (författare)
Carleton, Karen L. (författare)
Conte, Matthew A. (författare)
D'Cotta, Helena (författare)
Eshel, Orly (författare)
Gaffney, Leslie (författare)
Galibert, Francis (författare)
Gante, Hugo F. (författare)
Gnerre, Sante (författare)
Greuter, Lucie (författare)
Guyon, Richard (författare)
Haddad, Natalie S. (författare)
Haerty, Wilfried (författare)
Harris, Rayna M. (författare)
Hofmann, Hans A. (författare)
Hourlier, Thibaut (författare)
Hulata, Gideon (författare)
Jaffe, David B. (författare)
Lara, Marcia (författare)
Lee, Alison P. (författare)
MacCallum, Iain (författare)
Mwaiko, Salome (författare)
Nikaido, Masato (författare)
Nishihara, Hidenori (författare)
Ozouf-Costaz, Catherine (författare)
Penman, David J. (författare)
Przybylski, Dariusz (författare)
Rakotomanga, Michaelle (författare)
Renn, Suzy C. P. (författare)
Ribeiro, Filipe J. (författare)
Ron, Micha (författare)
Salzburger, Walter (författare)
Sanchez-Pulido, Luis (författare)
Santos, M. Emilia (författare)
Searle, Steve (författare)
Sharpe, Ted (författare)
Swofford, Ross (författare)
Tan, Frederick J. (författare)
Williams, Louise (författare)
Young, Sarah (författare)
Yin, Shuangye (författare)
Okada, Norihiro (författare)
Kocher, Thomas D. (författare)
Miska, Eric A. (författare)
Lander, Eric S. (författare)
Venkatesh, Byrappa (författare)
Fernald, Russell D. (författare)
Meyer, Axel (författare)
Ponting, Chris P. (författare)
Streelman, J. Todd (författare)
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)kerli865 (författare)
Seehausen, Ole (författare)
Di Palma, Federica (författare)
Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC513:7518, s. 375-3810028-08361476-4687

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Brawand, David; Wagner, Catherin ...; Li, Yang I.; Malinsky, Milan; Keller, Irene; Fan, Shaohua; visa fler...; Simakov, Oleg; Ng, Alvin Y.; Lim, Zhi Wei; Bezault, Etienne; Turner-Maier, Ja ...; Johnson, Jeremy; Alcazar, Rosa; Noh, Hyun Ji; Russell, Pamela; Aken, Bronwen; Alfoeldi, Jessic ...; Amemiya, Chris; Azzouzi, Naoual; Baroiller, Jean- ...; Barloy-Hubler, F ...; Berlin, Aaron; Bloomquist, Ryan; Carleton, Karen ...; Conte, Matthew A ...; D'Cotta, Helena; Eshel, Orly; Gaffney, Leslie; Galibert, Franci ...; Gante, Hugo F.; Gnerre, Sante; Greuter, Lucie; Guyon, Richard; Haddad, Natalie ...; Haerty, Wilfried; Harris, Rayna M.; Hofmann, Hans A.; Hourlier, Thibau ...; Hulata, Gideon; Jaffe, David B.; Lara, Marcia; Lee, Alison P.; MacCallum, Iain; Mwaiko, Salome; Nikaido, Masato; Nishihara, Hiden ...; Ozouf-Costaz, Ca ...; Penman, David J.; Przybylski, Dari ...; Rakotomanga, Mic ...; Renn, Suzy C. P.; Ribeiro, Filipe ...; Ron, Micha; Salzburger, Walt ...; Sanchez-Pulido, ...; Santos, M. Emili ...; Searle, Steve; Sharpe, Ted; Swofford, Ross; Tan, Frederick J ...; Williams, Louise; Young, Sarah; Yin, Shuangye; Okada, Norihiro; Kocher, Thomas D ...; Miska, Eric A.; Lander, Eric S.; Venkatesh, Byrap ...; Fernald, Russell ...; Meyer, Axel; Ponting, Chris P ...; Streelman, J. To ...; Lindblad-Toh, Ke ...; Seehausen, Ole; Di Palma, Federi ...; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Mikrobiologi ino ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Evolutionsbiolog ...

Artiklar i publikationen: Nature

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se