SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-23881"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-23881" > Comparison of real-...

  • Storm, MartinUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper (författare)

Comparison of real-time PCR and pyrosequencing for typing Bordetella pertussis toxin subunit 1 variants

  • Artikel/kapitelEngelska2006

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2006
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-23881
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-23881URI
  • https://doi.org/10.1016/j.mimet.2005.07.002DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We describe two newly developed methods for rapid typing of the pertussis toxin subunit 1 gene (ptxS1). A real-time PCR assay based on hybridization probes and a Pyrosequencing assay were developed and the specificity, sensitivity, cost, hands-on time and post-assay data processing were compared to Sanger sequencing. Both methods enabled discrimination of all four allelic variants, correctly identified all ptxS1 alleles of 143 strains tested and proved suitable for large-scale screening of B. pertussis strains.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • Alleles
  • Bordetella pertussis/classification/*genetics
  • DNA; Bacterial/chemistry/genetics
  • Humans
  • Pertussis Toxin/chemistry/*genetics
  • Pertussis Vaccine/genetics
  • Polymerase Chain Reaction
  • Polymorphism; Single Nucleotide
  • Sequence Analysis; DNA
  • Whooping Cough/microbiology
  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Advani, Abdolreza (författare)
  • Pettersson, Monica (författare)
  • Hallander, Hans O (författare)
  • Bondeson, KåreUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper(Swepub:uu)karebond (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinska vetenskaper (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Microbiological Methods: Elsevier BV65:1, s. 153-1580167-70121872-8359

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy