Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-23881" >
Comparison of real-...
-
Storm, MartinUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper
(författare)
Comparison of real-time PCR and pyrosequencing for typing Bordetella pertussis toxin subunit 1 variants
- Artikel/kapitelEngelska2006
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
Elsevier BV,2006
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-23881
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-23881URI
-
https://doi.org/10.1016/j.mimet.2005.07.002DOI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
We describe two newly developed methods for rapid typing of the pertussis toxin subunit 1 gene (ptxS1). A real-time PCR assay based on hybridization probes and a Pyrosequencing assay were developed and the specificity, sensitivity, cost, hands-on time and post-assay data processing were compared to Sanger sequencing. Both methods enabled discrimination of all four allelic variants, correctly identified all ptxS1 alleles of 143 strains tested and proved suitable for large-scale screening of B. pertussis strains.
Ämnesord och genrebeteckningar
-
Alleles
-
Bordetella pertussis/classification/*genetics
-
DNA; Bacterial/chemistry/genetics
-
Humans
-
Pertussis Toxin/chemistry/*genetics
-
Pertussis Vaccine/genetics
-
Polymerase Chain Reaction
-
Polymorphism; Single Nucleotide
-
Sequence Analysis; DNA
-
Whooping Cough/microbiology
-
MEDICINE
-
MEDICIN
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Advani, Abdolreza
(författare)
-
Pettersson, Monica
(författare)
-
Hallander, Hans O
(författare)
-
Bondeson, KåreUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper(Swepub:uu)karebond
(författare)
-
Uppsala universitetInstitutionen för medicinska vetenskaper
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Journal of Microbiological Methods: Elsevier BV65:1, s. 153-1580167-70121872-8359
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas