SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Hoffmann Steen)
 

Sökning: WFRF:(Hoffmann Steen) > Order Parameters an...

Order Parameters and Algorithmic Approaches for Detection and Demarcation of Interfaces in Hydrate-Fluid and Ice-Fluid Systems

Saethre, Bjorn Steen (författare)
Hoffmann, Alex C. (författare)
van der Spoel, David (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
 (creator_code:org_t)
2014-11-04
2014
Engelska.
Ingår i: Journal of Chemical Theory and Computation. - : American Chemical Society (ACS). - 1549-9618 .- 1549-9626. ; 10:12, s. 5606-5615
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Some aspects of the use of order parameter fields in molecular dynamics simulations to delimit solid phases containing water, namely ice and hydrate, in both hydrophilic and hydrophobic fluids are examined; this includes the influences of rectangular meshes and of filtering on the quality of these parameters. Three order parameters are studied: the mass density, rho; an angular tetrahedrality measure, Sg (Chau and Hardwick, Mol. Phys. 1998, 93, 511); and the water-dimer dihedral angle, F-4 (Rodger et al. Fluid Phase Equilib. 1996, 116, 326). The parameters are studied to find their ability to distinguish between bulk phases, their consistency in different environments, their noise susceptibility, and their ability to demarcate the interface region. Spatial sampling and filtering are covered in detail, and some temporal features are illustrated by using autocorrelation maps. The parameters are employed to determine the position of interfaces as functions of time and, with the capillary wave fluctuation method (Hoyt et al. Phys. Rev. Lett. 2001, 86, 5530; Math. Comput. Simul. 2010, 80, 1382), to estimate solid-fluid interfacial stiffnesses, with partial success for the hydrophilic/hydrophobic-type interfaces.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Fysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Physical Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Saethre, Bjorn S ...
Hoffmann, Alex C ...
van der Spoel, D ...
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Kemi
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Fysik
Artiklar i publikationen
Journal of Chemi ...
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy