SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Oskolkov Nikolay)
 

Sökning: WFRF:(Oskolkov Nikolay) > HMGB1 binds to the ...

HMGB1 binds to the rs7903146 locus in TCF7L2 in human pancreatic islets.

Zhou, Yuedan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Oskolkov, Nikolay (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Department of Biology,Faculty of Science
Shcherbina, Liliya (författare)
Lund University,Lunds universitet,Neuroendokrin cellbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neuroendocrine Cell Biology,Lund University Research Groups
visa fler...
Ratti, Joyce (författare)
Kock, Kian-Hong (författare)
Su, Jing (författare)
Martin, Brian (författare)
Zackrisson Oskolkova, Malin (författare)
Lund University,Lunds universitet,Fysikalisk kemi,Enheten för fysikalisk och teoretisk kemi,Kemiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Physical Chemistry,Physical and theoretical chemistry,Department of Chemistry,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Göransson, Olga (författare)
Lund University,Lunds universitet,Proteinfosforylering,Forskargrupper vid Lunds universitet,Protein Phosphorylation,Lund University Research Groups
Bacon, Julie (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Li, Weimin (författare)
Bucciarelli, Saskia (författare)
Cilio, Corrado (författare)
Lund University,Lunds universitet,Diabetes - immunovirologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Immunovirology,Lund University Research Groups
Brazma, Alvis (författare)
Thatcher, Bradley (författare)
Lund University,Lunds universitet,Diabetes - immunovirologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Immunovirology,Lund University Research Groups
Rung, Johan (författare)
Wierup, Nils (författare)
Lund University,Lunds universitet,Neuroendokrin cellbiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Neuroendocrine Cell Biology,Lund University Research Groups
Renström, Erik (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö,Medicinska fakulteten,Diabetes - öpatofysiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Department of Clinical Sciences, Malmö,Faculty of Medicine,Diabetes - Islet Patophysiology,Lund University Research Groups
Groop, Leif (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
Hansson, Ola (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Elsevier BV, 2016
2016
Engelska 8 s.
Ingår i: Molecular and Cellular Endocrinology. - : Elsevier BV. - 1872-8057 .- 0303-7207. ; 430, s. 138-145
Relaterad länk:
http://www.ncbi.nlm....
visa fler...
http://dx.doi.org/10...
https://lup.lub.lu.s...
https://doi.org/10.1...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The intronic SNP rs7903146 in the T-cell factor 7-like 2 gene (TCF7L2) is the common genetic variant most highly associated with Type 2 diabetes known to date. The risk T-allele is located in an open chromatin region specific to human pancreatic islets of Langerhans, thereby accessible for binding of regulatory proteins. The risk T-allele locus exhibits stronger enhancer activity compared to the non-risk C-allele. The aim of this study was to identify transcriptional regulators that bind the open chromatin region in the rs7903146 locus and thereby potentially regulate TCF7L2 expression and activity. Using affinity chromatography followed by Edman sequencing, we identified one candidate regulatory protein, i.e. high-mobility group protein B1 (HMGB1). The binding of HMGB1 to the rs7903146 locus was confirmed in pancreatic islets from human deceased donors, in HCT116 and in HEK293 cell lines using: (i) protein purification on affinity columns followed by Western blot, (ii) chromatin immunoprecipitation followed by qPCR and (iii) electrophoretic mobility shift assay. The results also suggested that HMGB1 might have higher binding affinity to the C-allele of rs7903146 compared to the T-allele, which was supported in vitro using Dynamic Light Scattering, possibly in a tissue-specific manner. The functional consequence of HMGB1 depletion in HCT116 and INS1 cells was reduced insulin and TCF7L2 mRNA expression, TCF7L2 transcriptional activity and glucose stimulated insulin secretion. These findings suggest that the rs7903146 locus might exert its enhancer function by interacting with HMGB1 in an allele dependent manner.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy