Convergent evolution of the genomes of marine mammals

Marine mammals from different mammalian orders share several phenotypic traits adapted to the aquatic environment and therefore represent a classic example of convergent evolution. To investigate convergent evolution at the genomic level, we sequenced and performed de novo assembly of the genomes of three species of marine mammals (the killer whale, walrus and manatee) from three mammalian orders that share independently evolved phenotypic adaptations to a marine existence. Our comparative genomic analyses found that convergent amino acid substitutions were widespread throughout the genome and that a subset of these substitutions were in genes evolving under positive selection and putatively associated with a marine phenotype. However, we found higher levels of convergent amino acid substitutions in a control set of terrestrial sister taxa to the marine mammals. Our results suggest that, whereas convergent molecular evolution is relatively common, adaptive molecular convergence linked to phenotypic convergence is comparatively rare.

Liu, Yue (författare)
Thomas, Gregg W. C. (författare)
Vinar, Tomas (författare)
Alfoeldi, Jessica (författare)
Deng, Jixin (författare)
Dugan, Shannon (författare)
van Elk, Cornelis E. (författare)
Hunter, Margaret E. (författare)
Joshi, Vandita (författare)
Khan, Ziad (författare)
Kovar, Christie (författare)
Lee, Sandra L. (författare)
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)kerli865 (författare)
Mancia, Annalaura (författare)
Nielsen, Rasmus (författare)
Qin, Xiang (författare)
Qu, Jiaxin (författare)
Raney, Brian J. (författare)
Vijay, NagarjunUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)nagvi316 (författare)
Wolf, Jochen B. W.Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)jocwo442 (författare)
Hahn, Matthew W. (författare)
Muzny, Donna M. (författare)
Worley, Kim C. (författare)
Gilbert, M. Thomas P. (författare)
Gibbs, Richard A. (författare)
Uppsala universitetEvolutionsbiologi (creator_code:org_t)

Ingår i:Nature Genetics: Springer Science and Business Media LLC47:3, s. 272-2751061-40361546-1718

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.