Molecular subgroups of atypical teratoid rhabdoid tumours in children: an integrated genomic and clinicopathological analysis

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-255273" > Molecular subgroups...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Torchia, Jonathon (författare)

Molecular subgroups of atypical teratoid rhabdoid tumours in children : an integrated genomic and clinicopathological analysis

Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2015
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-255273
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-255273URI
https://doi.org/10.1016/S1470-2045(15)70114-2DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background Rhabdoid brain tumours, also called atypical teratoid rhabdoid tumours, are lethal childhood cancers with characteristic genetic alterations of SMARCB1/hSNF5. Lack of biological understanding of the substantial clinical heterogeneity of these tumours restricts therapeutic advances. We integrated genomic and clinicopathological analyses of a cohort of patients with atypical teratoid rhabdoid tumours to find out the molecular basis for clinical heterogeneity in these tumours. Methods We obtained 259 rhabdoid tumours from 37 international institutions and assessed transcriptional profiles in 43 primary tumours and copy number profiles in 38 primary tumours to discover molecular subgroups of atypical teratoid rhabdoid tumours. We used gene and pathway enrichment analyses to discover group-specific molecular markers and did immunohistochemical analyses on 125 primary tumours to evaluate clinicopathological significance of molecular subgroup and ASCL1-NOTCH signalling. Findings Transcriptional analyses identified two atypical teratoid rhabdoid tumour subgroups with differential enrichment of genetic pathways, and distinct clinicopathological and survival features. Expression of ASCL1, a regulator of NOTCH signalling, correlated with supratentorial location (p=0.004) and superior 5-year overall survival (35%, 95% CI 13-57, and 20%, 6-34, for ASCL1-positive and ASCL1-negative tumours, respectively; p=0.033) in 70 patients who received multimodal treatment. ASCL1 expression also correlated with superior 5-year overall survival (34%, 7-61, and 9%, 0-21, for ASCL1-positive and ASCL1-negative tumours, respectively; p=0.001) in 39 patients who received only chemotherapy without radiation. Cox hazard ratios for overall survival in patients with differential ASCL1 enrichment treated with chemotherapy with or without radiation were 2.02 (95% CI 1.04-3.85; p=0.038) and 3.98 (1.71-9.26; p=0.001). Integrated analyses of molecular subgroupings with clinical prognostic factors showed three distinct clinical risk groups of tumours with different therapeutic outcomes. Interpretation An integration of clinical risk factors and tumour molecular groups can be used to identify patients who are likely to have improved long-term radiation-free survival and might help therapeutic stratification of patients with atypical teratoid rhabdoid tumours.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Picard, Daniel (författare)
Lafay-Cousin, Lucie (författare)
Hawkins, Cynthia E. (författare)
Kim, Seung-Ki (författare)
Letourneau, Louis (författare)
Ra, Young-Shin (författare)
Ho, King Ching (författare)
Chan, Tiffany Sin Yu (författare)
Sin-Chan, Patrick (författare)
Dunham, Christopher P. (författare)
Yip, Stephen (författare)
Ng, Ho-Keung (författare)
Lu, Jian-Qiang (författare)
Albrecht, Steffen (författare)
Pimentel, Jose (författare)
Chan, Jennifer A. (författare)
Somers, Gino R. (författare)
Zielenska, Maria (författare)
Faria, Claudia C. (författare)
Roque, Lucia (författare)
Baskin, BerivanUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik(Swepub:uu)berba972 (författare)
Birks, Diane (författare)
Foreman, Nick (författare)
Strother, Douglas (författare)
Klekner, Almos (författare)
Garami, Miklos (författare)
Hauser, Peter (författare)
Hortobagyi, Tibor (författare)
Bognar, Laszlo (författare)
Wilson, Beverly (författare)
Hukin, Juliette (författare)
Carret, Anne-Sophie (författare)
Van Meter, Timothy E. (författare)
Nakamura, Hideo (författare)
Toledano, Helen (författare)
Fried, Iris (författare)
Fults, Daniel (författare)
Wataya, Takafumi (författare)
Fryer, Chris (författare)
Eisenstat, David D. (författare)
Scheineman, Katrin (författare)
Johnston, Donna (författare)
Michaud, Jean (författare)
Zelcer, Shayna (författare)
Hammond, Robert (författare)
Ramsay, David A. (författare)
Fleming, Adam J. (författare)
Lulla, Rishi R. (författare)
Fangusaro, Jason R. (författare)
Sirachainan, Nongnuch (författare)
Larbcharoensub, Noppadol (författare)
Hongeng, Suradej (författare)
Barakzai, Muhammad Abrar (författare)
Montpetit, Alexandre (författare)
Stephens, Derek (författare)
Grundy, Richard G. (författare)
Schueller, Ulrich (författare)
Nicolaides, Theodore (författare)
Tihan, Tarik (författare)
Phillips, Joanna (författare)
Taylor, Michael D. (författare)
Rutka, James T. (författare)
Dirks, Peter (författare)
Bader, Gary D. (författare)
Warmuth-Metz, Monika (författare)
Rutkowski, Stefan (författare)
Pietsch, Torsten (författare)
Judkins, Alexander R. (författare)
Jabado, Nada (författare)
Bouffet, Eric (författare)
Huang, Annie (författare)
Uppsala universitetMedicinsk genetik och genomik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:The Lancet Oncology16:5, s. 569-5821470-20451474-5488

Internetlänk

Hitta via bibliotek

The Lancet Oncology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Torchia, Jonatho ...; Picard, Daniel; Lafay-Cousin, Lu ...; Hawkins, Cynthia ...; Kim, Seung-Ki; Letourneau, Loui ...; visa fler...; Ra, Young-Shin; Ho, King Ching; Chan, Tiffany Si ...; Sin-Chan, Patric ...; Dunham, Christop ...; Yip, Stephen; Ng, Ho-Keung; Lu, Jian-Qiang; Albrecht, Steffe ...; Pimentel, Jose; Chan, Jennifer A ...; Somers, Gino R.; Zielenska, Maria; Faria, Claudia C ...; Roque, Lucia; Baskin, Berivan; Birks, Diane; Foreman, Nick; Strother, Dougla ...; Klekner, Almos; Garami, Miklos; Hauser, Peter; Hortobagyi, Tibo ...; Bognar, Laszlo; Wilson, Beverly; Hukin, Juliette; Carret, Anne-Sop ...; Van Meter, Timot ...; Nakamura, Hideo; Toledano, Helen; Fried, Iris; Fults, Daniel; Wataya, Takafumi; Fryer, Chris; Eisenstat, David ...; Scheineman, Katr ...; Johnston, Donna; Michaud, Jean; Zelcer, Shayna; Hammond, Robert; Ramsay, David A.; Fleming, Adam J.; Lulla, Rishi R.; Fangusaro, Jason ...; Sirachainan, Non ...; Larbcharoensub, ...; Hongeng, Suradej; Barakzai, Muhamm ...; Montpetit, Alexa ...; Stephens, Derek; Grundy, Richard ...; Schueller, Ulric ...; Nicolaides, Theo ...; Tihan, Tarik; Phillips, Joanna; Taylor, Michael ...; Rutka, James T.; Dirks, Peter; Bader, Gary D.; Warmuth-Metz, Mo ...; Rutkowski, Stefa ...; Pietsch, Torsten; Judkins, Alexand ...; Jabado, Nada; Bouffet, Eric; Huang, Annie; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

Artiklar i publikationen: The Lancet Oncol ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se