SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Hart Michael P)
 

Sökning: WFRF:(Hart Michael P) > High-Resolution CRI...

  • Hart, TraverDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada. (författare)

High-Resolution CRISPR Screens Reveal Fitness Genes and Genotype-Specific Cancer Liabilities

  • Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2015
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-272070
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-272070URI
  • https://doi.org/10.1016/j.cell.2015.11.015DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • The ability to perturb genes in human cells is crucial for elucidating gene function and holds great potential for finding therapeutic targets for diseases such as cancer. To extend the catalog of human core and context-dependent fitness genes, we have developed a high-complexity second-generation genome-scale CRISPR-Cas9 gRNA library and applied it to fitness screens in five human cell lines. Using an improved Bayesian analytical approach, we consistently discover 5-fold more fitness genes than were previously observed. We present a list of 1,580 human core fitness genes and describe their general properties. Moreover, we demonstrate that context-dependent fitness genes accurately recapitulate pathway-specific genetic vulnerabilities induced by known oncogenes and reveal cell-type-specific dependencies for specific receptor tyrosine kinases, even in oncogenic KRAS backgrounds. Thus, rigorous identification of human cell line fitness genes using a high-complexity CRISPR-Cas9 library affords a high-resolution view of the genetic vulnerabilities of a cell.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Chandrashekhar, MeghaDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Aregger, MichaelDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada. (författare)
  • Steinhart, ZacharyUniv Toronto, Dept Pharmaceut Sci, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Leslie Dan Fac Pharm, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Brown, Kevin R.Donnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada. (författare)
  • MacLeod, GrahamUniv Toronto, Dept Pharmaceut Sci, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Leslie Dan Fac Pharm, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Mis, MonikaUniv Toronto, Dept Pharmaceut Sci, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Leslie Dan Fac Pharm, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Zimmermann, MichalMt Sinai Hosp, Lunenfeld Tanenbaum Res Inst, Toronto, ON M5G 1X5, Canada. (författare)
  • Fradet-Turcotte, AmelieMt Sinai Hosp, Lunenfeld Tanenbaum Res Inst, Toronto, ON M5G 1X5, Canada. (författare)
  • Sun, SongUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Donnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Dept Comp Sci, Toronto, ON M5G 1X8, Canada.(Swepub:uu)sunso767 (författare)
  • Mero, PatriciaDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada. (författare)
  • Dirks, PeterUniv Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Hosp Sick Children, Div Neurosurg, Program Dev & Stem Cell Biol, Toronto, ON M5G 1X8, Canada. (författare)
  • Sidhu, SachdevDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Roth, Frederick P.Donnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Mt Sinai Hosp, Lunenfeld Tanenbaum Res Inst, Toronto, ON M5G 1X5, Canada.;Univ Toronto, Dept Comp Sci, Toronto, ON M5G 1X8, Canada.;Canadian Inst Adv Res, Toronto, ON M5G 1Z8, Canada.;Dana Farber Canc Inst, Ctr Canc Syst Biol, Boston, MA 02215 USA. (författare)
  • Rissland, Olivia S.Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Hosp Sick Children, Res Inst, Mol Struct & Funct Program, Toronto, ON M5G 0A4, Canada. (författare)
  • Durocher, DanielUniv Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Mt Sinai Hosp, Lunenfeld Tanenbaum Res Inst, Toronto, ON M5G 1X5, Canada. (författare)
  • Angers, StephaneUniv Toronto, Dept Pharmaceut Sci, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Leslie Dan Fac Pharm, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Univ Toronto, Dept Biochem, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (författare)
  • Moffat, JasonDonnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada.;Canadian Inst Adv Res, Toronto, ON M5G 1Z8, Canada. (författare)
  • Donnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.Donnelly Ctr, Toronto, ON M5S 3E1, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON M5S 1A1, Canada. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Cell: Elsevier BV163:60092-86741097-4172

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Cell (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy