SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-276274"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-276274" > The Selective Advan...

The Selective Advantage of Synonymous Codon Usage Bias in Salmonella

Brandis, Gerrit (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
Hughes, Diarmaid (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi
 (creator_code:org_t)
2016-03-10
2016
Engelska.
Ingår i: PLOS Genetics. - : Public Library of Science (PLoS). - 1553-7390 .- 1553-7404. ; 12:3
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The genetic code in mRNA is redundant, with 61 sense codons translated into 20 different amino acids. Individual amino acids are encoded by up to six different codons but within codon families some are used more frequently than others. This phenomenon is referred to as synonymous codon usage bias. The genomes of free-living unicellular organisms such as bacteria have an extreme codon usage bias and the degree of bias differs between genes within the same genome. The strong positive correlation between codon usage bias and gene expression levels in many microorganisms is attributed to selection for translational efficiency. However, this putative selective advantage has never been measured in bacteria and theoretical estimates vary widely. By systematically exchanging optimal codons for synonymous codons in the tuf genes we quantified the selective advantage of biased codon usage in highly expressed genes to be in the range 0.2–4.2 x 10−4 per codon per generation. These data quantify for the first time the potential for selection on synonymous codon choice to drive genome-wide sequence evolution in bacteria, and in particular to optimize the sequences of highly expressed genes. This quantification may have predictive applications in the design of synthetic genes and for heterologous gene expression in biotechnology.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Mikrobiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)

Nyckelord

EF-Tu
Synonymous codon usage bias
Biology with specialization in Microbiology
Biologi med inriktning mot mikrobiologi

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Brandis, Gerrit
Hughes, Diarmaid
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Evolutionsbiolog ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Mikrobiologi
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Genetik
Artiklar i publikationen
PLOS Genetics
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy