Sökning: WFRF:(Matuszewski Damian J.) >
PopulationProfiler :
-
Matuszewski, Damian J.Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
(författare)
PopulationProfiler : A Tool for Population Analysis and Visualization of Image-Based Cell Screening Data
- Artikel/kapitelEngelska2016
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2016-03-17
-
Public Library of Science (PLoS),2016
-
printrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-282026
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-282026URI
-
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151554DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:133271817URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Image-based screening typically produces quantitative measurements of cell appearance. Large-scale screens involving tens of thousands of images, each containing hundreds of cells described by hundreds of measurements, result in overwhelming amounts of data. Reducing per-cell measurements to the averages across the image(s) for each treatment leads to loss of potentially valuable information on population variability. We present PopulationProfiler-a new software tool that reduces per-cell measurements to population statistics. The software imports measurements from a simple text file, visualizes population distributions in a compact and comprehensive way, and can create gates for subpopulation classes based on control samples. We validate the tool by showing how PopulationProfiler can be used to analyze the effect of drugs that disturb the cell cycle, and compare the results to those obtained with flow cytometry.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Wählby, CarolinaUppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)cli05194
(författare)
-
Carreras-Puigvert, JordiKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Div Translat Med & Chem Biol, Stockholm, Sweden; ] Sci Life Lab, Stockholm, Sweden(Swepub:uu)jorpu274
(författare)
-
Sintorn, Ida-MariaUppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)idsin102
(författare)
-
Uppsala universitetAvdelningen för visuell information och interaktion
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:PLOS ONE: Public Library of Science (PLoS)11:31932-6203
Internetlänk
Hitta via bibliotek
-
PLOS ONE
(Sök värdpublikationen i LIBRIS)
Till lärosätets databas