Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Tyck till om SwePub Sök här!

Sökning: WFRF:(Yoshinaga Yuko) > Antonarakis Stylianos E. > Identification and ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Birney, Ewan (författare)

Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project

Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Springer Science and Business Media LLC,2007
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-29014
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-29014URI
https://doi.org/10.1038/nature05874DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-50434URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

QC 20111222
We report the generation and analysis of functional data from multiple, diverse experiments performed on a targeted 1% of the human genome as part of the pilot phase of the ENCODE Project. These data have been further integrated and augmented by a number of evolutionary and computational analyses. Together, our results advance the collective knowledge about human genome function in several major areas. First, our studies provide convincing evidence that the genome is pervasively transcribed, such that the majority of its bases can be found in primary transcripts, including non-protein-coding transcripts, and those that extensively overlap one another. Second, systematic examination of transcriptional regulation has yielded new understanding about transcription start sites, including their relationship to specific regulatory sequences and features of chromatin accessibility and histone modification. Third, a more sophisticated view of chromatin structure has emerged, including its inter-relationship with DNA replication and transcriptional regulation. Finally, integration of these new sources of information, in particular with respect to mammalian evolution based on inter- and intra-species sequence comparisons, has yielded new mechanistic and evolutionary insights concerning the functional landscape of the human genome. Together, these studies are defining a path for pursuit of a more comprehensive characterization of human genome function.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
Chromatin/genetics/metabolism
Chromatin Immunoprecipitation
Conserved Sequence/genetics
DNA Replication
Evolution; Molecular
Exons/genetics
Genome; Human/*genetics
Genomics
Heterozygote
Histones/metabolism
Humans
Pilot Projects
Protein Binding
RNA; Messenger/genetics
RNA; Untranslated/genetics
Regulatory Sequences; Nucleic Acid/*genetics
Transcription Factors/metabolism
Transcription Initiation Site
Transcription; Genetic/*genetics
Variation (Genetics)/genetics
MEDICINE
MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Ameur, AdamUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)adame789 (författare)
Dutta, Anindya (författare)
Guigó, Roderic (författare)
Gingeras, Thomas R. (författare)
Margulies, Elliott H. (författare)
Weng, Zhiping (författare)
Snyder, Michael (författare)
Dermitzakis, Emmanouil T. (författare)
Thurman, Robert E. (författare)
Kuehn, Michael S. (författare)
Taylor, Christopher M. (författare)
Neph, Shane (författare)
Koch, Christoph M. (författare)
Asthana, Saurabh (författare)
Malhotra, Ankit (författare)
Adzhubei, Ivan (författare)
Greenbaum, Jason A. (författare)
Andrews, Robert M. (författare)
Flicek, Paul (författare)
Boyle, Patrick J. (författare)
Cao, Hua (författare)
Carter, Nigel P. (författare)
Clelland, Gayle K. (författare)
Davis, Sean (författare)
Day, Nathan (författare)
Dhami, Pawandeep (författare)
Dillon, Shane C. (författare)
Dorschner, Michael O. (författare)
Fiegler, Heike (författare)
Giresi, Paul G. (författare)
Goldy, Jeff (författare)
Hawrylycz, Michael (författare)
Haydock, Andrew (författare)
Humbert, Richard (författare)
James, Keith D. (författare)
Johnson, Brett E. (författare)
Johnson, Ericka M. (författare)
Frum, Tristan T. (författare)
Rosenzweig, Elizabeth R. (författare)
Karnani, Neerja (författare)
Lee, Kirsten (författare)
Lefebvre, Gregory C. (författare)
Navas, Patrick A. (författare)
Neri, Fidencio (författare)
Parker, Stephen C. (författare)
Sabo, Peter J. (författare)
Sandstrom, Richard (författare)
Shafer, Anthony (författare)
Vetrie, David (författare)
Weaver, Molly (författare)
Wilcox, Sarah (författare)
Yu, Man (författare)
Collins, Francis S. (författare)
Dekker, Job (författare)
Lieb, Jason D. (författare)
Tullius, Thomas D. (författare)
Crawford, Gregory E. (författare)
Sunyaev, Shamil (författare)
Noble, William S. (författare)
Dunham, Ian (författare)
Denoeud, France (författare)
Reymond, Alexandre (författare)
Kapranov, Philipp (författare)
Rozowsky, Joel (författare)
Zheng, Deyou (författare)
Castelo, Robert (författare)
Frankish, Adam (författare)
Harrow, Jennifer (författare)
Ghosh, Srinka (författare)
Sandelin, Albin (författare)
Hofacker, Ivo L. (författare)
Baertsch, Robert (författare)
Keefe, Damian (författare)
Dike, Sujit (författare)
Cheng, Jill (författare)
Hirsch, Heather A. (författare)
Sekinger, Edward A. (författare)
Lagarde, Julien (författare)
Abril, Josep F. (författare)
Shahab, Atif (författare)
Flamm, Christoph (författare)
Fried, Claudia (författare)
Hackermüller, Jörg (författare)
Hertel, Jana (författare)
Lindemeyer, Manja (författare)
Missal, Kristin (författare)
Tanzer, Andrea (författare)
Washietl, Stefan (författare)
Korbel, Jan (författare)
Emanuelsson, Olof (författare)
Pedersen, Jakob S. (författare)
Holroyd, Nancy (författare)
Taylor, Ruth (författare)
Swarbreck, David (författare)
Matthews, Nicholas (författare)
Dickson, Mark C. (författare)
Thomas, Daryl J. (författare)
Weirauch, Matthew T. (författare)
Gilbert, James (författare)
Drenkow, Jorg (författare)
Bell, Ian (författare)
Zhao, XiaoDong (författare)
Srinivasan, K. G. (författare)
Sung, Wing-Kin (författare)
Ooi, Hong Sain (författare)
Chiu, Kuo Ping (författare)
Foissac, Sylvain (författare)
Alioto, Tyler (författare)
Brent, Michael (författare)
Pachter, Lior (författare)
Tress, Michael L. (författare)
Valencia, Alfonso (författare)
Choo, Siew Woh (författare)
Choo, Chiou Yu (författare)
Ucla, Catherine (författare)
Manzano, Caroline (författare)
Wyss, Carine (författare)
Cheung, Evelyn (författare)
Clark, Taane G. (författare)
Brown, James B. (författare)
Ganesh, Madhavan (författare)
Patel, Sandeep (författare)
Tammana, Hari (författare)
Chrast, Jacqueline (författare)
Henrichsen, Charlotte N. (författare)
Kai, Chikatoshi (författare)
Kawai, Jun (författare)
Nagalakshmi, Ugrappa (författare)
Wu, Jiaqian (författare)
Lian, Zheng (författare)
Lian, Jin (författare)
Newburger, Peter (författare)
Zhang, Xueqing (författare)
Bickel, Peter (författare)
Mattick, John S. (författare)
Carninci, Piero (författare)
Hayashizaki, Yoshihide (författare)
Weissman, Sherman (författare)
Hubbard, Tim (författare)
Myers, Richard M. (författare)
Rogers, Jane (författare)
Stadler, Peter F. (författare)
Lowe, Todd M. (författare)
Wei, Chia-Lin (författare)
Ruan, Yijun (författare)
Struhl, Kevin (författare)
Gerstein, Mark (författare)
Antonarakis, Stylianos E. (författare)
Fu, Yutao (författare)
Green, Eric D. (författare)
Karaöz, U. (författare)
Siepel, Adam (författare)
Taylor, James (författare)
Liefer, Laura A (författare)
Wetterstrand, Kris A. (författare)
Good, Peter J. (författare)
Feingold, Elise A. (författare)
Guyer, Mark S. (författare)
Cooper, Gregory M. (författare)
Asimenos, George (författare)
Dewey, Colin N. (författare)
Hou, Minmei (författare)
Nikolaev, Sergey (författare)
Montoya-Burgos, Juan I. (författare)
Löytynoja, Ari (författare)
Whelan, Simon (författare)
Pardi, Fabio (författare)
Massingham, Tim (författare)
Huang, Haiyan (författare)
Zhang, Nancy R. (författare)
Holmes, Ian (författare)
Mullikin, James C. (författare)
Ureta-Vidal, Abel (författare)
Paten, Benedict (författare)
Seringhaus, Michael (författare)
Church, Deanna (författare)
Rosenbloom, Kate (författare)
Kent, W. James (författare)
Stone, Eric A. (författare)
Batzoglou, Serafim (författare)
Goldman, Nick (författare)
Hardison, Ross C. (författare)
Haussler, David (författare)
Miller, Webb (författare)
Sidow, Arend (författare)
Trinklein, Nathan D. (författare)
Zhang, Zhengdong D. (författare)
Barrera, Leah (författare)
Stuart, Rhona (författare)
King, David C. (författare)
Ameur, AdamUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)adame789 (författare)
Enroth, StefanUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)stenr451 (författare)
Bieda, Mark C. (författare)
Kim, Jonghwan (författare)
Bhinge, Akshay A. (författare)
Jiang, Nan (författare)
Liu, Jun (författare)
Yao, Fei (författare)
Vega, Vinsensius B. (författare)
Lee, Charlie W. (författare)
Ng, Patrick (författare)
Shahab, Atif (författare)
Yang, Annie (författare)
Moqtaderi, Zarmik (författare)
Zhu, Zhou (författare)
Xu, Xiaoqin (författare)
Squazzo, Sharon (författare)
Oberley, Matthew J. (författare)
Inman, David (författare)
Singer, Michael A. (författare)
Richmond, Todd A. (författare)
Munn, Kyle J. (författare)
Rada-Iglesias, AlvaroUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
Wallerman, OlaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)olwal516 (författare)
Komorowski, JanUppsala universitet,Centrum för bioinformatik(Swepub:uu)jakom133 (författare)
Fowler, Joanna C. (författare)
Couttet, Phillippe (författare)
Bruce, Alexander W. (författare)
Dovey, Oliver M. (författare)
Ellis, Peter D. (författare)
Langford, Cordelia F. (författare)
Nix, David A. (författare)
Euskirchen, Ghia (författare)
Hartman, Stephen (författare)
Urban, Alexander E. (författare)
Kraus, Peter (författare)
Van Calcar, Sara (författare)
Heintzman, Nate (författare)
Kim, Tae Hoon (författare)
Wang, Kun (författare)
Qu, Chunxu (författare)
Hon, Gary (författare)
Luna, Rosa (författare)
Glass, Christopher K. (författare)
Rosenfeld, M. Geoff (författare)
Aldred, Shelley Force (författare)
Cooper, Sara J. (författare)
Halees, Anason (författare)
Lin, Jane M. (författare)
Shulha, Hennady P. (författare)
Zhang, Xiaoling (författare)
Xu, Mousheng (författare)
Haidar, Jaafar N. (författare)
Yu, Yong (författare)
Ruan, Yijun (författare)
Iyer, Vishwanath R. (författare)
Green, Roland D. (författare)
Wadelius, ClaesUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)claeswad (författare)
Farnham, Peggy J. (författare)
Ren, Bing (författare)
Harte, Rachel A. (författare)
Hinrichs, Angie S. (författare)
Trumbower, Heather (författare)
Clawson, Hiram (författare)
Hillman-Jackson, Jennifer (författare)
Zweig, Ann S. (författare)
Smith, Kayla (författare)
Thakkapallayil, Archana (författare)
Barber, Galt (författare)
Kuhn, Robert M. (författare)
Karolchik, Donna (författare)
Armengol, Lluis (författare)
Bird, Christine P. (författare)
de Bakker, Paul I. (författare)
Kern, Andrew D. (författare)
Lopez-Bigas, Nuria (författare)
Martin, Joel D. (författare)
Stranger, Barbara E. (författare)
Woodroffe, Abigail (författare)
Davydov, Eugene (författare)
Dimas, Antigone (författare)
Eyras, Eduardo (författare)
Hallgrímsdóttir, Ingileif B. (författare)
Huppert, Julian (författare)
Zody, Michael C. (författare)
Abecasis, G. R. (författare)
Estivill, Xavier (författare)
Bouffard, Gerard G. (författare)
Guan, Xiaobin (författare)
Hansen, Nancy F. (författare)
Idol, Jacquelyn R. (författare)
Maduro, Valerie V. (författare)
Maskeri, Baishali (författare)
McDowell, Jennifer C. (författare)
Park, Morgan (författare)
Thomas, Pamela J. (författare)
Young, Alice C. (författare)
Blakesley, Robert W. (författare)
Muzny, Donna M. (författare)
Sodergren, Erica (författare)
Wheeler, David A. (författare)
Worley, Kim C. (författare)
Jiang, Huaiyang (författare)
Weinstock, George M. (författare)
Gibbs, Richard A. (författare)
Graves, Tina (författare)
Fulton, Robert (författare)
Mardis, Elaine R. (författare)
Wilson, Richard K. (författare)
Clamp, Michele (författare)
Cuff, James (författare)
Gnerre, Sante (författare)
Jaffe, David B. (författare)
Chang, Jean L. (författare)
Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)kerli865 (författare)
Lander, Eric S. (författare)
Koriabine, Maxim (författare)
Nefedov, Mikhail (författare)
Osoegawa, Kazutoyo (författare)
Yoshinaga, Yuko (författare)
Zhu, Baoli (författare)
de Jong, Pieter J. (författare)
Hallgrímsdóttir, Ingileif B (författare)
Uppsala universitetCentrum för bioinformatik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature: Springer Science and Business Media LLC447:7146, s. 799-8160028-08361476-4687

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Birney, Ewan; Ameur, Adam; Dutta, Anindya; Guigó, Roderic; Gingeras, Thomas ...; Margulies, Ellio ...; visa fler...; Weng, Zhiping; Snyder, Michael; Dermitzakis, Emm ...; Thurman, Robert ...; Kuehn, Michael S ...; Taylor, Christop ...; Neph, Shane; Koch, Christoph ...; Asthana, Saurabh; Malhotra, Ankit; Adzhubei, Ivan; Greenbaum, Jason ...; Andrews, Robert ...; Flicek, Paul; Boyle, Patrick J ...; Cao, Hua; Carter, Nigel P.; Clelland, Gayle ...; Davis, Sean; Day, Nathan; Dhami, Pawandeep; Dillon, Shane C.; Dorschner, Micha ...; Fiegler, Heike; Giresi, Paul G.; Goldy, Jeff; Hawrylycz, Micha ...; Haydock, Andrew; Humbert, Richard; James, Keith D.; Johnson, Brett E ...; Johnson, Ericka ...; Frum, Tristan T.; Rosenzweig, Eliz ...; Karnani, Neerja; Lee, Kirsten; Lefebvre, Gregor ...; Navas, Patrick A ...; Neri, Fidencio; Parker, Stephen ...; Sabo, Peter J.; Sandstrom, Richa ...; Shafer, Anthony; Vetrie, David; Weaver, Molly; Wilcox, Sarah; Yu, Man; Collins, Francis ...; Dekker, Job; Lieb, Jason D.; Tullius, Thomas ...; Crawford, Gregor ...; Sunyaev, Shamil; Noble, William S ...; Dunham, Ian; Denoeud, France; Reymond, Alexand ...; Kapranov, Philip ...; Rozowsky, Joel; Zheng, Deyou; Castelo, Robert; Frankish, Adam; Harrow, Jennifer; Ghosh, Srinka; Sandelin, Albin; Hofacker, Ivo L.; Baertsch, Robert; Keefe, Damian; Dike, Sujit; Cheng, Jill; Hirsch, Heather ...; Sekinger, Edward ...; Lagarde, Julien; Abril, Josep F.; Shahab, Atif; Flamm, Christoph; Fried, Claudia; Hackermüller, Jö ...; Hertel, Jana; Lindemeyer, Manj ...; Missal, Kristin; Tanzer, Andrea; Washietl, Stefan; Korbel, Jan; Emanuelsson, Olo ...; Pedersen, Jakob ...; Holroyd, Nancy; Taylor, Ruth; Swarbreck, David; Matthews, Nichol ...; Dickson, Mark C.; Thomas, Daryl J.; Weirauch, Matthe ...; Gilbert, James; Drenkow, Jorg; Bell, Ian; Zhao, XiaoDong; Srinivasan, K. G ...; Sung, Wing-Kin; Ooi, Hong Sain; Chiu, Kuo Ping; Foissac, Sylvain; Alioto, Tyler; Brent, Michael; Pachter, Lior; Tress, Michael L ...; Valencia, Alfons ...; Choo, Siew Woh; Choo, Chiou Yu; Ucla, Catherine; Manzano, Carolin ...; Wyss, Carine; Cheung, Evelyn; Clark, Taane G.; Brown, James B.; Ganesh, Madhavan; Patel, Sandeep; Tammana, Hari; Chrast, Jacqueli ...; Henrichsen, Char ...; Kai, Chikatoshi; Kawai, Jun; Nagalakshmi, Ugr ...; Wu, Jiaqian; Lian, Zheng; Lian, Jin; Newburger, Peter; Zhang, Xueqing; Bickel, Peter; Mattick, John S.; Carninci, Piero; Hayashizaki, Yos ...; Weissman, Sherma ...; Hubbard, Tim; Myers, Richard M ...; Rogers, Jane; Stadler, Peter F ...; Lowe, Todd M.; Wei, Chia-Lin; Ruan, Yijun; Struhl, Kevin; Gerstein, Mark; Antonarakis, Sty ...; Fu, Yutao; Green, Eric D.; Karaöz, U.; Siepel, Adam; Taylor, James; Liefer, Laura A; Wetterstrand, Kr ...; Good, Peter J.; Feingold, Elise ...; Guyer, Mark S.; Cooper, Gregory ...; Asimenos, George; Dewey, Colin N.; Hou, Minmei; Nikolaev, Sergey; Montoya-Burgos, ...; Löytynoja, Ari; Whelan, Simon; Pardi, Fabio; Massingham, Tim; Huang, Haiyan; Zhang, Nancy R.; Holmes, Ian; Mullikin, James ...; Ureta-Vidal, Abe ...; Paten, Benedict; Seringhaus, Mich ...; Church, Deanna; Rosenbloom, Kate; Kent, W. James; Stone, Eric A.; Batzoglou, Seraf ...; Goldman, Nick; Hardison, Ross C ...; Haussler, David; Miller, Webb; Sidow, Arend; Trinklein, Natha ...; Zhang, Zhengdong ...; Barrera, Leah; Stuart, Rhona; King, David C.; Enroth, Stefan; Bieda, Mark C.; Kim, Jonghwan; Bhinge, Akshay A ...; Jiang, Nan; Liu, Jun; Yao, Fei; Vega, Vinsensius ...; Lee, Charlie W.; Ng, Patrick; Yang, Annie; Moqtaderi, Zarmi ...; Zhu, Zhou; Xu, Xiaoqin; Squazzo, Sharon; Oberley, Matthew ...; Inman, David; Singer, Michael ...; Richmond, Todd A ...; Munn, Kyle J.; Rada-Iglesias, A ...; Wallerman, Ola; Komorowski, Jan; Fowler, Joanna C ...; Couttet, Phillip ...; Bruce, Alexander ...; Dovey, Oliver M.; Ellis, Peter D.; Langford, Cordel ...; Nix, David A.; Euskirchen, Ghia; Hartman, Stephen; Urban, Alexander ...; Kraus, Peter; Van Calcar, Sara; Heintzman, Nate; Kim, Tae Hoon; Wang, Kun; Qu, Chunxu; Hon, Gary; Luna, Rosa; Glass, Christoph ...; Rosenfeld, M. Ge ...; Aldred, Shelley ...; Cooper, Sara J.; Halees, Anason; Lin, Jane M.; Shulha, Hennady ...; Zhang, Xiaoling; Xu, Mousheng; Haidar, Jaafar N ...; Yu, Yong; Iyer, Vishwanath ...; Green, Roland D.; Wadelius, Claes; Farnham, Peggy J ...; Ren, Bing; Harte, Rachel A.; Hinrichs, Angie ...; Trumbower, Heath ...; Clawson, Hiram; Hillman-Jackson, ...; Zweig, Ann S.; Smith, Kayla; Thakkapallayil, ...; Barber, Galt; Kuhn, Robert M.; Karolchik, Donna; Armengol, Lluis; Bird, Christine ...; de Bakker, Paul ...; Kern, Andrew D.; Lopez-Bigas, Nur ...; Martin, Joel D.; Stranger, Barbar ...; Woodroffe, Abiga ...; Davydov, Eugene; Dimas, Antigone; Eyras, Eduardo; Hallgrímsdóttir ...; Huppert, Julian; Zody, Michael C.; Abecasis, G. R.; Estivill, Xavier; Bouffard, Gerard ...; Guan, Xiaobin; Hansen, Nancy F.; Idol, Jacquelyn ...; Maduro, Valerie ...; Maskeri, Baishal ...; McDowell, Jennif ...; Park, Morgan; Thomas, Pamela J ...; Young, Alice C.; Blakesley, Rober ...; Muzny, Donna M.; Sodergren, Erica; Wheeler, David A ...; Worley, Kim C.; Jiang, Huaiyang; Weinstock, Georg ...; Gibbs, Richard A ...; Graves, Tina; Fulton, Robert; Mardis, Elaine R ...; Wilson, Richard ...; Clamp, Michele; Cuff, James; Gnerre, Sante; Jaffe, David B.; Chang, Jean L.; Lindblad-Toh, Ke ...; Lander, Eric S.; Koriabine, Maxim; Nefedov, Mikhail; Osoegawa, Kazuto ...; Yoshinaga, Yuko; Zhu, Baoli; de Jong, Pieter ...; Hallgrímsdóttir, ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Biokemi och mole ...

Artiklar i publikationen: Nature

Av lärosätet: Uppsala universitet; Kungliga Tekniska Högskolan

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se