SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Fendrich Volker)
 

Sökning: WFRF:(Fendrich Volker) > Identification of t...

  • Lehmann-Werman, RoniHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)

Identification of tissue-specific cell death using methylation patterns of circulating DNA

  • Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-03-14
  • Proceedings of the National Academy of Sciences,2016
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-294301
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-294301URI
  • https://doi.org/10.1073/pnas.1519286113DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:133272788URI
  • https://gup.ub.gu.se/publication/234717URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Minimally invasive detection of cell death could prove an invaluable resource in many physiologic and pathologic situations. Cell-free circulating DNA (cfDNA) released from dying cells is emerging as a diagnostic tool for monitoring cancer dynamics and graft failure. However, existing methods rely on differences in DNA sequences in source tissues, so that cell death cannot be identified in tissues with a normal genome. We developed a method of detecting tissue-specific cell death in humans based on tissue-specific methylation patterns in cfDNA. We interrogated tissue-specific methylome databases to identify cell type-specific DNA methylation signatures and developed a method to detect these signatures in mixed DNA samples. We isolated cfDNA from plasma or serum of donors, treated the cfDNA with bisulfite, PCR-amplified the cfDNA, and sequenced it to quantify cfDNA carrying the methylation markers of the cell type of interest. Pancreatic beta-cell DNA was identified in the circulation of patients with recently diagnosed type-1 diabetes and islet-graft recipients; oligodendrocyte DNA was identified in patients with relapsing multiple sclerosis; neuronal/glial DNA was identified in patients after traumatic brain injury or cardiac arrest; and exocrine pancreas DNA was identified in patients with pancreatic cancer or pancreatitis. This proof-of-concept study demonstrates that the tissue origins of cfDNA and thus the rate of death of specific cell types can be determined in humans. The approach can be adapted to identify cfDNA derived from any cell type in the body, offering a minimally invasive window for diagnosing and monitoring a broad spectrum of human pathologies as well as providing a better understanding of normal tissue dynamics.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Neiman, DanielHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Zemmour, HaiHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Moss, JoshuaHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Magenheim, JudithHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Vaknin-Dembinsky, AdiHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Neurol, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Rubertsson, StenUppsala universitet,Anestesiologi och intensivvård(Swepub:uu)stenrube (författare)
  • Nellgård, Bengt,1956Sahlgrens Univ Hosp, S-43180 Molndal, Sweden.(Swepub:gu)xnellb (författare)
  • Blennow, Kaj,1958Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry(Swepub:gu)xbleka (författare)
  • Zetterberg, Henrik,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för psykiatri och neurokemi,Institute of Neuroscience and Physiology, Department of Psychiatry and Neurochemistry(Swepub:gu)xzethe (författare)
  • Spalding, KirstyKarolinska Institutet (författare)
  • Haller, Michael J.Univ Florida, Coll Med, Div Endocrinol, Gainesville, FL 32610 USA. (författare)
  • Wasserfall, Clive H.Univ Florida, Coll Med, Div Endocrinol, Gainesville, FL 32610 USA. (författare)
  • Schatz, Desmond A.Univ Florida, Coll Med, Div Endocrinol, Gainesville, FL 32610 USA. (författare)
  • Greenbaum, Carla J.Benaroya Res Inst, Seattle, WA 98101 USA. (författare)
  • Dorrell, CraigOregon Hlth & Sci Univ, Pape Family Pediat Res Inst, Portland, OR 97239 USA. (författare)
  • Grompe, MarkusOregon Hlth & Sci Univ, Pape Family Pediat Res Inst, Portland, OR 97239 USA. (författare)
  • Zick, AviadHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Oncol, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Hubert, AyalaHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Oncol, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Maoz, MyriamHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Oncol, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Fendrich, VolkerUniv Marburg, Dept Surg, D-35037 Marburg, Germany. (författare)
  • Bartsch, Detlef K.Univ Marburg, Dept Surg, D-35037 Marburg, Germany. (författare)
  • Golan, TaliaChaim Sheba Med Ctr, Dept Oncol, IL-52621 Tel Hashomer, Israel. (författare)
  • Ben Sasson, Shmuel A.Hebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Zamir, GideonHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Expt Surg, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Razin, AharonHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Cedar, HowardHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Shapiro, A. M. JamesUniv Alberta, Dept Surg, Edmonton, AB T6G 2R3, Canada.;Univ Alberta, Clin Islet Transplant Program, Edmonton, AB T6G 2R3, Canada. (författare)
  • Glaser, BenjaminHadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Endocrinol & Metab Serv, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Shemer, RuthHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Dor, YuvalHebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel. (författare)
  • Hebrew Univ Jerusalem, Hadassah Med Sch, Inst Med Res Israel Canada, Dept Dev Biol & Canc Res, IL-91120 Jerusalem, Israel.Hadassah Hebrew Univ, Med Ctr, Dept Neurol, IL-91120 Jerusalem, Israel. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America: Proceedings of the National Academy of Sciences113:13, s. E1826-E18340027-84241091-6490

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy