Pooled analysis of genome-wide association studies of cervical intraepithelial neoplasia 3 (CIN3) identifies a new susceptibility locus

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-308265" > Pooled analysis of ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Chen, DanUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Shanghai Jiao Tong Univ, Sch Med, Xin Hua Hosp, Minist Educ, Shanghai, Peoples R China.;Shanghai Jiao Tong Univ, Sch Med, Xin Hua Hosp, Shanghai Key Lab Childrens Environm Hlth, Shanghai, Peoples R China. (författare)

Pooled analysis of genome-wide association studies of cervical intraepithelial neoplasia 3 (CIN3) identifies a new susceptibility locus

Artikel/kapitelEngelska2016

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2016-06-07
Impact Journals, LLC,2016
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-308265
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-308265URI
https://doi.org/10.18632/oncotarget.9916DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Recent genome-wide association studies (GWASs) in subjects of European descent have identified associations between cervical cancer risk and three independent loci as well as multiple classical human leukocyte antigen (HLA) alleles at 6p21.3. To search for novel loci associated with development of cervical cancer, we performed a pooled analysis of data from two GWASs by imputing over 10 million genetic variants and 424 classical HLA alleles, for 1,553 intraepithelial neoplasia 3 (CIN3), 81 cervical cancer and 4,442 controls from the Swedish population. Notable findings were validated in an independent study of 961 patients (827 with CIN3 and 123 with cervical cancer) and 1,725 controls. Our data provided increased support for previously identified loci at 6p21.3 (rs9271898, P = 1.2 x 10(-24); rs2516448, 1.1 x 10(-15); and rs3130196, 2.3 x 10(-9), respectively) and also confirmed associations with reported classical HLA alleles including HLA-B*07:02, -B*15:01, -DRB1*13:01, -DRB1*15:01, -DQA1*01:03, -DQB1*06:03 and -DQB1*06:02. In addition, we identified and subsequently replicated an independent signal at rs73730372 at 6p21.3 (odds ratio = 0.60, 95% confidence interval = 0.54-0.67, P = 3.0 x 10(-19)), which was found to be an expression quantitative trait locus (eQTL) of both HLA-DQA1 and HLA-DQB1. This is one of the strongest common genetic protective variants identified so far for CIN3. We also found HLA-C*07:02 to be associated with risk of CIN3. The present study provides new insights into pathogenesis of CIN3.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Cancer och onkologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Cancer and Oncology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Cell- och molekylärbiologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Cell and Molecular Biology hsv//eng
cervical intraepithelial neoplasia 3
genome-wide association study
genetic variants
expression quantitative trait locus
human leukocyte antigen

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Enroth, StefanUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)stenr451 (författare)
Liu, HanShanghai Jiao Tong Univ, Sch Med, Xin Hua Hosp, Minist Educ, Shanghai, Peoples R China.;Shanghai Jiao Tong Univ, Sch Med, Xin Hua Hosp, Shanghai Key Lab Childrens Environm Hlth, Shanghai, Peoples R China. (författare)
Sun, YangYunnan Univ, Sch Life Sci, Lab Biochem & Mol Biol, Kunming, Peoples R China. (författare)
Wang, HuiboNanjing Med Univ, Dept Neurosurg, Affiliated Hosp 1, Nanjing, Jiangsu, Peoples R China. (författare)
Yu, MinYunnan Univ, Sch Life Sci, Lab Biochem & Mol Biol, Kunming, Peoples R China. (författare)
Deng, LianChinese Acad Sci, Key Lab Computat Biol, Max Planck Independent Res Grp Populat Genom, CAS MPG Partner Inst Computat Biol PICB,Shanghai, Shanghai, Peoples R China. (författare)
Xu, ShuhuaChinese Acad Sci, Key Lab Computat Biol, Max Planck Independent Res Grp Populat Genom, CAS MPG Partner Inst Computat Biol PICB,Shanghai, Shanghai, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Beijing, Peoples R China.;Shanghai Tech Univ, Sch Life Sci & Technol, Shanghai, Peoples R China.;Collaborat Innovat Ctr Genet & Dev, Shanghai, Peoples R China. (författare)
Gyllensten, UlfUppsala universitet,Medicinsk genetik och genomik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ulfgyll (författare)
Uppsala universitetMedicinsk genetik och genomik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Oncotarget: Impact Journals, LLC7:27, s. 42216-422241949-2553

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Oncotarget (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Chen, Dan; Enroth, Stefan; Liu, Han; Sun, Yang; Wang, Huibo; Yu, Min; visa fler...; Deng, Lian; Xu, Shuhua; Gyllensten, Ulf; visa färre...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Cancer och onkol ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Cell och molekyl ...

Artiklar i publikationen: Oncotarget

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se