SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-326237"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-326237" > Targeted sequencing...

  • Bersani, CinziaKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)

Targeted sequencing of tonsillar and base of tongue cancer and human papillomavirus positive unknown primary of the head and neck reveals prognostic effects of mutated FGFR3

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2017-02-09
  • IMPACT JOURNALS LLC,2017
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-326237
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-326237URI
  • https://doi.org/10.18632/oncotarget.15240DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-136333URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:135897246URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • BACKGROUND: Human papillomavirus positive (HPV+) tonsillar cancer (TSCC), base of tongue cancer (BOTSCC) and unknown primary cancer of the head and neck (HNCUP) have better outcome than corresponding HPV- cancers. To find predictive markers for response to treatment, and correlations and differences in mutated oncogenes and suppressor genes between HPV+ TSCC/BOTSSCC and HPV+ HNCUP and HPV- TSCC/BOTSCC targeted next-generation sequencing was performed of frequently mutated regions in 50 cancer related genes.PATIENTS AND METHODS: DNA from 348 TSCC/BOTSCC and 20 HNCUP from patients diagnosed 2000-2011, was sequenced by the Ion Proton sequencing platform using the Ion AmpliSeq Cancer Hotspot Panel v2 to identify frequently mutated regions in 50 cancer related genes. Ion Torrent Variant Caller software was used to call variants.RESULTS: 279 HPV+ TSCC/BOTSCC, 46 HPV- TSCC/BOTSCC and 19 HPV+ HNCUP samples qualified for further analysis. Mutations/tumor were fewer in HPV+ TSCC/BOTSCC and HNCUP, compared to HPV- tumors (0.92 vs. 1.32 vs. 1.68). Differences in mutation frequency of TP53 and PIK3CA were found between HPV+ TSCC/BOTSCC and HNCUP and HPV- TSCC/BOTSCC. In HPV+ TSCC/BOTSCC presence of FGFR3 mutations correlated to worse prognosis. Other correlations to survival within the groups were not disclosed.CONCLUSIONS: In HPV+ TSCC/BOTSCC mutation of PIK3CA was most frequently observed, while TP53 mutations dominated in HPV- TSCC/BOTSCC. In HPV+ TSCC/ BOTSCC and HNCUP, mutations/tumor were similar in frequency and fewer compared to that in HPV- TSCC/BOTSCC. Notably, FGFR3 mutations in HPV+ TSCC/BOTSCC indicated worse prognosis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Sivars, LarsKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Haeggblom, LinneaKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • DiLorenzo, SebastianUppsala universitet,Institutionen för medicinska vetenskaper,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)sebdi127 (författare)
  • Mints, MichaelKarolinska Institutet,Umeå universitet,Institutionen för kirurgisk och perioperativ vetenskap,Department of Medicine, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden,Karolinska Inst, Dept Med, Stockholm, Sweden.;Umea Univ, Dept Surg & Perioperat Sci, Umea, Sweden.(Swepub:umu)mimi0028 (författare)
  • Ährlund-Richter, AndreasKarolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Tertipis, NikolaosKarolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Munck-Wikland, EvaKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Clin Sci & Technol, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Dept Otorhinolaryngol Head & Neck Surg, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Näsman, AndersKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Ramqvist, TorbjörnKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Dalianis, TinaKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Karolinska InstitutetKarolinska Inst, Dept Oncol Pathol, Stockholm, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Oncotarget: IMPACT JOURNALS LLC8:21, s. 35339-353501949-2553

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy