The future of metabolomics in ELIXIR.

Metabolomics, the youngest of the major omics technologies, is supported by an active community of researchers and infrastructure developers across Europe. To coordinate and focus efforts around infrastructure building for metabolomics within Europe, a workshop on the "Future of metabolomics in ELIXIR" was organised at Frankfurt Airport in Germany. This one-day strategic workshop involved representatives of ELIXIR Nodes, members of the PhenoMeNal consortium developing an e-infrastructure that supports workflow-based metabolomics analysis pipelines, and experts from the international metabolomics community. The workshop established metabolite identification as the critical area, where a maximal impact of computational metabolomics and data management on other fields could be achieved. In particular, the existing four ELIXIR Use Cases, where the metabolomics community - both industry and academia - would benefit most, and which could be exhaustively mapped onto the current five ELIXIR Platforms were discussed. This opinion article is a call for support for a new ELIXIR metabolomics Use Case, which aligns with and complements the existing and planned ELIXIR Platforms and Use Cases.

NATURVETENSKAP Biologi Bioinformatik och systembiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Bioinformatics and Systems Biology hsv//eng
bioinformatics infrastructure
cloud computing
computational workflows
data standards
databases
metabolomics
multi-omics approaches
training
Bioinformatics
Bioinformatik

Beirnaert, Charlie (författare)
Caron, Christophe (författare)
Cascante, Marta (författare)
Dominguez, Victoria (författare)
Dunn, Warwick B (författare)
Ebbels, Timothy M D (författare)
Giacomoni, Franck (författare)
Gonzalez-Beltran, Alejandra (författare)
Hankemeier, Thomas (författare)
Haug, Kenneth (författare)
Izquierdo-Garcia, Jose L (författare)
Jimenez, Rafael C (författare)
Jourdan, Fabien (författare)
Kale, Namrata (författare)
Klapa, Maria I (författare)
Kohlbacher, Oliver (författare)
Koort, Kairi (författare)
Kultima, Kim (författare)
Le Corguillé, Gildas (författare)
Moschonas, Nicholas K (författare)
Neumann, Steffen (författare)
O'Donovan, Claire (författare)
Reczko, Martin (författare)
Rocca-Serra, Philippe (författare)
Rosato, Antonio (författare)
Salek, Reza M (författare)
Sansone, Susanna-Assunta (författare)
Satagopam, Venkata (författare)
Schober, Daniel (författare)
Shimmo, Ruth (författare)
Spicer, Rachel A (författare)
Spjuth, Ola,1977-Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)olspj499 (författare)
Thévenot, Etienne A (författare)
Viant, Mark R (författare)
Weber, Ralf J M (författare)
Willighagen, Egon L (författare)
Zanetti, Gianluigi (författare)
Steinbeck, Christoph (författare)
Uppsala universitetInstitutionen för farmaceutisk biovetenskap (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: van Rijswijk, Me ...; Beirnaert, Charl ...; Caron, Christoph ...; Cascante, Marta; Dominguez, Victo ...; Dunn, Warwick B; visa fler...; Ebbels, Timothy ...; Giacomoni, Franc ...; Gonzalez-Beltran ...; Hankemeier, Thom ...; Haug, Kenneth; Izquierdo-Garcia ...; Jimenez, Rafael ...; Jourdan, Fabien; Kale, Namrata; Klapa, Maria I; Kohlbacher, Oliv ...; Koort, Kairi; Kultima, Kim; Le Corguillé, Gi ...; Moschonas, Nicho ...; Neumann, Steffen; O'Donovan, Clair ...; Reczko, Martin; Rocca-Serra, Phi ...; Rosato, Antonio; Salek, Reza M; Sansone, Susanna ...; Satagopam, Venka ...; Schober, Daniel; Shimmo, Ruth; Spicer, Rachel A; Spjuth, Ola, 197 ...; Thévenot, Etienn ...; Viant, Mark R; Weber, Ralf J M; Willighagen, Ego ...; Zanetti, Gianlui ...; Steinbeck, Chris ...; visa färre...

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.