CTCF counter-regulates cardiomyocyte development and maturation programs in the embryonic heart

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-335243" > CTCF counter-regula...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Gomez-Velazquez, MelisaCNIC, Madrid, Spain. (författare)

CTCF counter-regulates cardiomyocyte development and maturation programs in the embryonic heart

Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2017-08-28
PUBLIC LIBRARY SCIENCE,2017
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-335243
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-335243URI
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006985DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Cardiac progenitors are specified early in development and progressively differentiate and mature into fully functional cardiomyocytes. This process is controlled by an extensively studied transcriptional program. However, the regulatory events coordinating the progression of such program from development to maturation are largely unknown. Here, we show that the genome organizer CTCF is essential for cardiogenesis and that it mediates genomic interactions to coordinate cardiomyocyte differentiation and maturation in the developing heart. Inactivation of Ctcf in cardiac progenitor cells and their derivatives in vivo during development caused severe cardiac defects and death at embryonic day 12.5. Genome wide expression analysis in Ctcf mutant hearts revealed that genes controlling mitochondrial function and protein production, required for cardiomyocyte maturation, were upregulated. However, mitochondria from mutant cardiomyocytes do not mature properly. In contrast, multiple development regulatory genes near predicted heart enhancers, including genes in the IrxA cluster, were downregulated in Ctcf mutants, suggesting that CTCF promotes cardiomyocyte differentiation by facilitating enhancer-promoter interactions. Accordingly, loss of CTCF disrupts gene expression and chromatin interactions as shown by chromatin conformation capture followed by deep sequencing. Furthermore, CRISPR-mediated deletion of an intergenic CTCF site within the IrxA cluster alters gene expression in the developing heart. Thus, CTCF mediates local regulatory interactions to coordinate transcriptional programs controlling transitions in morphology and function during heart development.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Utvecklingsbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Developmental Biology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Kardiologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Cardiac and Cardiovascular Systems hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Badia-Careaga, ClaudioCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Victoria Lechuga-Vieco, AnaCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Nieto-Arellano, RocioCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Tena, Juan J.Univ Pablo de Olavide Junta de Andalucia, CSIC, CABD, Seville, Spain. (författare)
Rollan, IsabelCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Alvarez, AlbaCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Torroja, CarlosCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Caceres, Eva F.Uppsala universitet,Molekylär evolution,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,CNIC, Madrid, Spain.(Swepub:uu)evafe848 (författare)
Roy, AnnaHosp Sick Children, Translat Med, Toronto, ON, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON, Canada. (författare)
Galjart, NielsErasmus MC, Dept Cell Biol & Genet, Rotterdam, Netherlands. (författare)
Delgado-Olguin, PaulHosp Sick Children, Translat Med, Toronto, ON, Canada.;Univ Toronto, Dept Mol Genet, Toronto, ON, Canada.;Heart & Stroke Richard Lewar Ctr Excellence, Toronto, ON, Canada. (författare)
Sanchez-Cabo, FatimaCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Antonio Enriquez, JoseCNIC, Madrid, Spain. (författare)
Luis Gomez-Skarmeta, JoseUniv Pablo de Olavide Junta de Andalucia, CSIC, CABD, Seville, Spain. (författare)
Manzanares, MiguelCNIC, Madrid, Spain. (författare)
CNIC, Madrid, Spain.Univ Pablo de Olavide Junta de Andalucia, CSIC, CABD, Seville, Spain. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:PLOS Genetics: PUBLIC LIBRARY SCIENCE13:81553-73901553-7404

Internetlänk

Hitta via bibliotek

PLOS Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Gomez-Velazquez, ...; Badia-Careaga, C ...; Victoria Lechuga ...; Nieto-Arellano, ...; Tena, Juan J.; Rollan, Isabel; visa fler...; Alvarez, Alba; Torroja, Carlos; Caceres, Eva F.; Roy, Anna; Galjart, Niels; Delgado-Olguin, ...; Sanchez-Cabo, Fa ...; Antonio Enriquez ...; Luis Gomez-Skarm ...; Manzanares, Migu ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Utvecklingsbiolo ...

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Kardiologi

Artiklar i publikationen: PLOS Genetics

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se