SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Jackson William)
 

Sökning: WFRF:(Jackson William) > The evolution of mu...

  • Hong, Nan-SookAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)

The evolution of multiple active site configurations in a designed enzyme

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2018-09-25
  • Nature Publishing Group,2018
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-363422
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-363422URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-018-06305-yDOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Developments in computational chemistry, bioinformatics, and laboratory evolution have facilitated the de novo design and catalytic optimization of enzymes. Besides creating useful catalysts, the generation and iterative improvement of designed enzymes can provide valuable insight into the interplay between the many phenomena that have been suggested to contribute to catalysis. In this work, we follow changes in conformational sampling, electrostatic preorganization, and quantum tunneling along the evolutionary trajectory of a designed Kemp eliminase. We observe that in the Kemp Eliminase KE07, instability of the designed active site leads to the emergence of two additional active site configurations. Evolutionary conformational selection then gradually stabilizes the most efficient configuration, leading to an improved enzyme. This work exemplifies the link between conformational plasticity and evolvability and demonstrates that residues remote from the active sites of enzymes play crucial roles in controlling and shaping the active site for efficient catalysis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Petrovic, DusanUppsala universitet,Biokemi(Swepub:uu)duspe724 (författare)
  • Lee, RichmondAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Gryn'ova, GannaAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia;Ecole Polytech Fed Lausanne, Inst Sci & Ingn Chim, CH-1015 Lausanne, Switzerland (författare)
  • Purg, MihaUppsala universitet,Biokemi(Swepub:uu)mihpu392 (författare)
  • Saunders, JakeAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Bauer, PaulUppsala universitet,Biokemi(Swepub:uu)pauba337 (författare)
  • Carr, Paul D.Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Lin, Ching-YehAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Mabbitt, Peter D.Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Zhang, WilliamAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Altamore, TimothyAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Easton, ChrisAustralian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Coote, Michelle L.Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Kamerlin, Shina C. Lynn,1981-Uppsala universitet,Biokemi(Swepub:uu)lynka392 (författare)
  • Jackson, Colin J.Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, Australia (författare)
  • Australian Natl Univ, Res Sch Chem, Canberra, ACT 2601, AustraliaBiokemi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Nature Publishing Group92041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy