SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Säfholm Jesper)
 

Sökning: WFRF:(Säfholm Jesper) > Tissue-specific tra...

  • Mazzurana, LucaKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)

Tissue-specific transcriptional imprinting and heterogeneity in human innate lymphoid cells revealed by full-length single-cell RNA-sequencing

  • Artikel/kapitelEngelska2021

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2021-01-08
  • Springer Science and Business Media LLC,2021
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:research.chalmers.se:32ce0912-aa0e-4245-8bbb-522589d09de1
  • https://doi.org/10.1038/s41422-020-00445-xDOI
  • https://research.chalmers.se/publication/521969URI
  • https://lup.lub.lu.se/record/009c0123-8e47-4fc7-949e-fd2da1a6f9e8URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-450121URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:145614784URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype
  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype

Anmärkningar

  • The impact of the microenvironment on innate lymphoid cell (ILC)-mediated immunity in humans remains largely unknown. Here we used full-length Smart-seq2 single-cell RNA-sequencing to unravel tissue-specific transcriptional profiles and heterogeneity of CD127+ ILCs across four human tissues. Correlation analysis identified gene modules characterizing the migratory properties of tonsil and blood ILCs, and signatures of tissue-residency, activation and modified metabolism in colon and lung ILCs. Trajectory analysis revealed potential differentiation pathways from circulating and tissue-resident naïve ILCs to a spectrum of mature ILC subsets. In the lung we identified both CRTH2+ and CRTH2− ILC2 with lung-specific signatures, which could be recapitulated by alarmin-exposure of circulating ILC2. Finally, we describe unique TCR-V(D)J-rearrangement patterns of blood ILC1-like cells, revealing a subset of potentially immature ILCs with TCR-δ rearrangement. Our study provides a useful resource for in-depth understanding of ILC-mediated immunity in humans, with implications for disease.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Czarnewski, PauloStockholm University,Stockholm Univ, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Sci Life Lab, Dept Biochem & Biophys, Solna, Sweden. (författare)
  • Jonsson, Viktor,1987Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol & Biol Engn, Sci Life Lab, Gothenburg, Sweden.(Swepub:cth)jonssonv (författare)
  • Wigge, Leif,1986Chalmers University of Technology,Chalmers Univ Technol, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol & Biol Engn, Sci Life Lab, Gothenburg, Sweden.(Swepub:cth)varemo (författare)
  • Ringnér, MarkusLund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science,Lund Univ, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Dept Biol, Sci Life Lab, Lund, Sweden.(Swepub:lu)thep-mri (författare)
  • Williams, Teresa C.Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Ravindran, AvinashKarolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Immunol & Allergy Unit, Dept Med Solna,Dept Clin Immunol & Transfus Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Björklund, Åsa K.Uppsala universitet,Uppsala University,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär evolution(Swepub:uu)asbjo172 (författare)
  • Säfholm, JesperKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Ctr Allergy Res, Inst Environm Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Nilsson, GunnarKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Karolinska Univ Hosp, Immunol & Allergy Unit, Dept Med Solna,Dept Clin Immunol & Transfus Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Dahlén, Sven ErikKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Ctr Allergy Res, Inst Environm Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Orre, Ann CharlotteKarolinska universitetssjukhuset,Karolinska University Hospital,Karolinska Univ Hosp, Div Thorac Surg, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Al-Ameri, MamdohKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Univ Hosp, Div Thorac Surg, Stockholm, Sweden.;Karolinska Inst, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Höög, CharlotteKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Hedin, CharlotteKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Med Unit Gastroenterol Dermatovenereol & Rheumato, Div Gastroenterol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Szczegielniak, SylwesterKarolinska Institutet (författare)
  • Almer, SvenKarolinska Institute,Karolinska University Hospital,Karolinska Inst, Dept Med Solna, Stockholm, Sweden.;Karolinska Univ Hosp, Med Unit Gastroenterol Dermatovenereol & Rheumato, Div Gastroenterol, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Mjösberg, JennyKarolinska Institutet,Karolinska Institute,Karolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Karolinska InstituteKarolinska Inst, Dept Med, Ctr Infect Med, Stockholm, Sweden. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Cell Research: Springer Science and Business Media LLC31:5, s. 554-5681748-78381001-0602

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy