Towards automated multiscale imaging and analysis in TEM: Glomerulus detection by fusion of CNN and LBP maps

Wetzer, ElisabethUppsala universitet,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Avdelningen för visuell information och interaktion,Methods in Image Data Analysis (författare)

Towards automated multiscale imaging and analysis in TEM : Glomerulus detection by fusion of CNN and LBP maps

Glomerulal structures in kidney tissue have to be analysed at a nanometer scale for several medical diagnoses. They are therefore commonly imaged using Transmission Electron Microscopy. The high resolution produces large amounts of data and requires long acquisition time, which makes automated imaging and glomerulus detection a desired option. This paper presents a deep learning approach for Glomerulus detection, using two architectures, VGG16 (with batch normalization) and ResNet50. To enhance the performance over training based only on intensity images, multiple approaches to fuse the input with texture information encoded in local binary patterns of different scales have been evaluated. The results show a consistent improvement in Glomerulus detection when fusing texture-based trained networks with intensity-based ones at a late classification stage.

Lindblad, JoakimUppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Mathematical Institute of Serbian Academy of Sciences and Arts, Belgrade, Serbia,Methods in Image Data Analysis(Swepub:uu)joali534 (författare)
Sintorn, Ida-Maria,1976-Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Vironova AB, Stockholm, Sweden,Quantitative Microscopy(Swepub:uu)idsin102 (författare)
Hultenby, KjellKarolinska Institute (författare)
Sladoje, NatasaUppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion,Mathematical Institute of Serbian Academy of Sciences and Arts, Belgrade, Serbia,Methods in Image Data Analysis(Swepub:uu)namat934 (författare)
Uppsala universitetBildanalys och människa-datorinteraktion (creator_code:org_t)

Av författaren/redakt...: Wetzer, Elisabet ...; Lindblad, Joakim; Sintorn, Ida-Mar ...; Hultenby, Kjell; Sladoje, Natasa

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Data och informa ...; och Datorseende och ...

TEKNIK OCH TEKNOLOGIER: TEKNIK OCH TEKNO ...; och Medicinteknik; och Medicinsk bildbe ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.