SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Gelfman Sahar)
 

Sökning: WFRF:(Gelfman Sahar) > (2019) > Exome-Based Rare-Va...

  • Cameron-Christie, SophiaAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)

Exome-Based Rare-Variant Analyses in CKD

  • Artikel/kapitelEngelska2019

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • AMER SOC NEPHROLOGY,2019
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-390637
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-390637URI
  • https://doi.org/10.1681/ASN.2018090909DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background Studies have identified many common genetic associations that influence renal function and all-cause CKD, but these explain only a small fraction of variance in these traits. The contribution of rare variants has not been systematically examined. Methods We performed exome sequencing of 3150 individuals, who collectively encompassed diverse CKD subtypes, and 9563 controls. To detect causal genes and evaluate the contribution of rare variants we used collapsing analysis, in which we compared the proportion of cases and controls carrying rare variants per gene. Results The analyses captured five established monogenic causes of CKD: variants in PKD1, PKD2, and COL4A5 achieved study-wide significance, and we observed suggestive case enrichment for COL4A4 and COL4A3. Beyond known disease-associated genes, collapsing analyses incorporating regional variant intolerance identified suggestive dominant signals in CPT2 and several other candidate genes. Biallelic mutations in CPT2 cause carnitine palmitoyltransferase II deficiency, sometimes associated with rhabdomyolysis and acute renal injury. Genetic modifier analysis among cases with APOL1 risk genotypes identified a suggestive signal in AHDC1, implicated in Xia-Gibbs syndrome, which involves intellectual disability and other features. On the basis of the observed distribution of rare variants, we estimate that a two-to three-fold larger cohort would provide 80% power to implicate new genes for all-cause CKD. Conclusions This study demonstrates that rare-variant collapsing analyses can validate known genes and identify candidate genes and modifiers for kidney disease. In so doing, these findings provide a motivation for larger-scale investigation of rare-variant risk contributions across major clinical CKD categories.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Wolock, Charles J.Columbia Univ, Dept Genet & Dev, New York, NY USA (författare)
  • Groopman, EmilyColumbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA (författare)
  • Petrovski, SlaveAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)
  • Kamalakaran, SitharthanColumbia Univ, Dept Genet & Dev, New York, NY USA (författare)
  • Povysil, GundulaAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England;Columbia Univ, Med Ctr, Inst Genom Med, New York, NY USA (författare)
  • Vitsios, DimitriosAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)
  • Zhang, MengqiColumbia Univ, Med Ctr, Inst Genom Med, New York, NY USA;Duke Univ, Dept Biostatist & Bioinformat, Durham, NC USA (författare)
  • Fleckner, JanAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)
  • March, Ruth E.AstraZeneca, R&D Oncol, Precis Med, Cambridge, England (författare)
  • Gelfman, SaharColumbia Univ, Dept Genet & Dev, New York, NY USA (författare)
  • Marasa, MaddalenaColumbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA (författare)
  • Li, YifuColumbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA (författare)
  • Sanna-Cherchi, SimoneColumbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA (författare)
  • Kiryluk, KrzysztofColumbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA (författare)
  • Allen, Andrew S.Columbia Univ, Med Ctr, Inst Genom Med, New York, NY USA;Duke Univ, Dept Biostatist & Bioinformat, Durham, NC USA (författare)
  • Fellström, Bengt,1947-Uppsala universitet,Njurmedicin(Swepub:uu)bengfell (författare)
  • Haefliger, CarolinaAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)
  • Platt, AdamAstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England (författare)
  • Goldstein, David B.AstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, England;Columbia Univ, Dept Genet & Dev, New York, NY USA;Columbia Univ, Med Ctr, Inst Genom Med, New York, NY USA (författare)
  • Gharavi, Ali G.Columbia Univ, Dept Med, Div Nephrol, New York, NY USA;Columbia Univ, Med Ctr, Inst Genom Med, New York, NY USA (författare)
  • AstraZeneca, R&D BioPharmaceut, Discovery Sci, AstraZeneca Ctr Genom Res, Cambridge, EnglandColumbia Univ, Dept Genet & Dev, New York, NY USA (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of the American Society of Nephrology: AMER SOC NEPHROLOGY30:6, s. 1109-11221046-66731533-3450

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy