Sökning: L773:1548 7091 OR L773:1548 7105 >
Time-resolved imagi...
Time-resolved imaging-based CRISPRi screening
-
- Camsund, Daniel, 1980- (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär systembiologi
-
- Lawson, Michael J. (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,CALTECH, Div Biol & Biol Engn, Pasadena, CA 91125 USA
-
- Larsson, Jimmy, 1977- (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
visa fler...
-
- Jones, Daniel (författare)
- Uppsala universitet,Molekylär systembiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
-
- Zikrin, Spartak (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär systembiologi
-
- Fange, David, 1978- (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär systembiologi
-
- Elf, Johan (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Molekylär systembiologi
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2019-11-18
- 2020
- Engelska.
-
Ingår i: Nature Methods. - : NATURE PUBLISHING GROUP. - 1548-7091 .- 1548-7105. ; 17:1, s. 86-92
- Relaterad länk:
-
https://authors.libr...
-
visa fler...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- DuMPLING (dynamic mu-fluidic microscopy phenotyping of a library before in situ genotyping) enables screening of dynamic phenotypes in strain libraries and was used here to study genes that coordinate replication and cell division in Escherichia coli. Our ability to connect genotypic variation to biologically important phenotypes has been seriously limited by the gap between live-cell microscopy and library-scale genomic engineering. Here, we show how in situ genotyping of a library of strains after time-lapse imaging in a microfluidic device overcomes this problem. We determine how 235 different CRISPR interference knockdowns impact the coordination of the replication and division cycles of Escherichia coli by monitoring the location of replication forks throughout on average >500 cell cycles per knockdown. Subsequent in situ genotyping allows us to map each phenotype distribution to a specific genetic perturbation to determine which genes are important for cell cycle control. The single-cell time-resolved assay allows us to determine the distribution of single-cell growth rates, cell division sizes and replication initiation volumes. The technology presented in this study enables genome-scale screens of most live-cell microscopy assays.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
- MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Camsund, Daniel, ...
-
Lawson, Michael ...
-
Larsson, Jimmy, ...
-
Jones, Daniel
-
Zikrin, Spartak
-
Fange, David, 19 ...
-
visa fler...
-
Elf, Johan
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Methods
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet