Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Klenk Hans Peter) > (2020) > Roadmap for naming ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Murray, Alison E.Desert Res Inst, Div Earth & Ecosyst Sci, Reno, NV 89512 USA. (författare)

Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria

Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2020-06-08
NATURE PUBLISHING GROUP,2020
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-423700
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-423700URI
https://doi.org/10.1038/s41564-020-0733-xDOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

The assembly of single-amplified genomes (SAGs) and metagenome-assembled genomes (MAGs) has led to a surge in genome-based discoveries of members affiliated with Archaea and Bacteria, bringing with it a need to develop guidelines for nomenclature of uncultivated microorganisms. The International Code of Nomenclature of Prokaryotes (ICNP) only recognizes cultures as 'type material', thereby preventing the naming of uncultivated organisms. In this Consensus Statement, we propose two potential paths to solve this nomenclatural conundrum. One option is the adoption of previously proposed modifications to the ICNP to recognize DNA sequences as acceptable type material; the other option creates a nomenclatural code for uncultivated Archaea and Bacteria that could eventually be merged with the ICNP in the future. Regardless of the path taken, we believe that action is needed now within the scientific community to develop consistent rules for nomenclature of uncultivated taxa in order to provide clarity and stability, and to effectively communicate microbial diversity. In this Consensus Statement, the authors discuss the issue of naming uncultivated prokaryotic microorganisms, which currently do not have a formal nomenclature system due to a lack of type material or cultured representatives, and propose two recommendations including the recognition of DNA sequences as type material.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Freudenstein, JohnOhio State Univ, Dept Evolut Ecol & Organismal Biol, Columbus, OH 43210 USA. (författare)
Gribaldo, SimonettaInst Pasteur, Evolutionary Biol Microbial Cell, Dept Microbiol, Paris, France. (författare)
Hatzenpichler, RolandMontana State Univ, Dept Chem & Biochem, Ctr Biofilm Engn, Bozeman, MT 59717 USA.;Montana State Univ, Thermal Biol Inst, Bozeman, MT 59717 USA. (författare)
Hugenholtz, PhilipUniv Queensland, Australian Ctr Ecogen, Sch Chem & Mol Biosci, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
Kämpfer, PeterJustus Liebig Univ, Dept Appl Microbiol, Giessen, Germany. (författare)
Konstantinidis, Konstantinos T.Georgia Tech, Sch Civil & Environm Engn, Atlanta, GA USA. (författare)
Lane, Christopher E.Univ Rhode Isl, Dept Biol Sci, Kingston, RI 02881 USA. (författare)
Papke, R. ThaneUniv Connecticut, Dept Mol & Cellular Biol, Storrs, CT USA. (författare)
Parks, Donovan H.Univ Queensland, Australian Ctr Ecogen, Sch Chem & Mol Biosci, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
Rossello-Mora, RamonCSIC UIB, Mediterranean Inst Adv Studies, Illes Balears, Spain. (författare)
Stott, Matthew B.Univ Canterbury, Sch Biol Sci, Christchurch, New Zealand. (författare)
Sutcliffe, Iain C.Northumbria Univ, Dept Appl Sci, Newcastle Upon Tyne, Tyne & Wear, England. (författare)
Thrash, J. CameronUniv Southern Calif, Dept Biol Sci, Los Angeles, CA 90007 USA. (författare)
Venter, Stephanus N.Univ Pretoria, Dept Biochem Genet & Microbiol, Pretoria, South Africa. (författare)
Whitman, William B.Univ Georgia, Dept Microbiol, Athens, GA 30602 USA. (författare)
Acinas, Silvia G.CSIC, Dept Marine Biol & Oceanog, Inst Ciences Mar, Barcelona, Spain. (författare)
Amann, Rudolf, IMax Planck Inst Marine Microbiol, Bremen, Germany. (författare)
Anantharaman, KarthikUniv Wisconsin, Dept Bacteriol, Madison, WI 53706 USA. (författare)
Armengaud, JeanCEA Pharmacol & Immunoanal Unit SPI, CEA Technol Innovat Detect & Diag Lab, Bagnols Sur Ceze, France. (författare)
Baker, Brett J.Univ Texas Austin, Dept Marine Sci, Marine Sci Inst, Port Aransas, TX USA. (författare)
Barco, Roman A.Univ Southern Calif, Dept Earth Sci, Los Angeles, CA 90007 USA. (författare)
Bode, Helge B.Goethe Univ Frankfurt, Mol Biotechnol, Dept Biosci, Frankfurt, Germany.;Goethe Univ Frankfurt, Buchmann Inst Mol Life Sci BMLS, Frankfurt, Germany.;Senckenberg Soc Nat Res, Frankfurt, Germany. (författare)
Boyd, Eric S.Montana State Univ, Dept Microbiol & Immunol, Bozeman, MT 59717 USA. (författare)
Brady, Carrie L.Univ West England, Bristol, Avon, England. (författare)
Carini, PaulUniv Arizona, Dept Environm Sci, Tucson, AZ USA. (författare)
Chain, Patrick S. G.Los Alamos Natl Lab, Biosci Div, Los Alamos, NM USA. (författare)
Colman, Daniel R.Montana State Univ, Dept Microbiol & Immunol, Bozeman, MT 59717 USA. (författare)
DeAngelis, Kristen M.Univ Massachusetts, Dept Microbiol, Amherst, MA 01003 USA. (författare)
de los Rios, Maria AsuncionCSIC, Natl Museum Nat Sci, Madrid, Spain. (författare)
Estrada-de los Santos, PaulinaInst Politecn Nacl, Escuela Nacl Ciencias Biol, Mexico City, DF, Mexico. (författare)
Dunlap, Christopher A.Natl Ctr Agr Utilizat Res, Crop Bioprotect Res Unit, Peoria, IL USA. (författare)
Eisen, Jonathan A.Univ Calif Davis, Dept Evolut & Ecol, Dept Med Microbiol & Immunol, Davis, CA 95616 USA. (författare)
Emerson, DavidBigelow Lab Ocean Sci, East Boothbay, ME USA. (författare)
Ettema, Thijs J. G.Wageningen Univ & Res, Lab Microbiol, Wageningen, Netherlands. (författare)
Eveillard, DamienUniv Nantes, CNRS, LS2N, Nantes, France. (författare)
Girguis, Peter R.Harvard Univ, Dept Organism & Evolutionary Biol, Cambridge, MA 02138 USA. (författare)
Hentschel, UteGEOMAR Helmholtz Ctr Ocean Res, RU Marine Microbiol, RD3 Marine Ecol, Kiel, Germany. (författare)
Hollibaugh, James T.Univ Georgia, Dept Marine Sci, Athens, GA 30602 USA. (författare)
Hug, Laura A.Univ Waterloo, Dept Biol, Waterloo, ON, Canada. (författare)
Inskeep, William P.Montana State Univ, Dept Land Resources & Environm Sci, Bozeman, MT 59717 USA. (författare)
Ivanova, Elena P.RMIT Univ, Sch Sci, Melbourne, Vic, Australia. (författare)
Klenk, Hans-PeterNewcastle Univ, Sch Nat & Environm Sci, Newcastle Upon Tyne, Tyne & Wear, England. (författare)
Li, Wen-JunSun Yat Sen Univ, Sch Life Sci, Guangzhou, Peoples R China. (författare)
Lloyd, Karen G.Univ Tennessee, Dept Microbiol, Knoxville, TN 37996 USA. (författare)
Löffler, Frank E.Univ Tennessee, Ctr Environm Biotechnol, Dept Microbiol, Knoxville, TN 37932 USA.;Univ Tennessee, Ctr Environm Biotechnol, Dept Civil & Environm Engn, Knoxville, TN 37932 USA.;Oak Ridge Natl Lab, Biosci Div, Oak Ridge, TN USA. (författare)
Makhalanyane, Thulani P.Univ Pretoria, Ctr Microbial Ecol & Genom, Dept Biochem Genet & Microbiol, Pretoria, South Africa. (författare)
Moser, Duane P.Desert Res Inst, Div Hydrol Sci, Las Vegas, NV USA. (författare)
Nunoura, TakuroJapan Agcy Marine Earth Sci & Technol JAMSTEC, Res Ctr Biosci & Nanosci CeBN, Yokosuka, Kanagawa, Japan. (författare)
Palmer, MarikeUniv Nevada, Sch Life Sci, Las Vegas, NV 89154 USA. (författare)
Parro, VictorAstrobiol Ctr CSIC INTA, Madrid, Spain. (författare)
Pedros-Alio, CarlosNatl Biotechnol Ctr, Madrid, Spain. (författare)
Probst, Alexander J.Univ Duisburg Essen, Dept Chem Environm Microbiol & Biotechnol, Essen, Germany. (författare)
Smits, Theo H. M.Zurich Univ Appl Sci ZHAW, Environm Genom & Syst Biol Res Grp, Inst Environm & Nat Resources, Wadenswil, Switzerland. (författare)
Steen, Andrew D.Univ Tennessee, Dept Microbiol, Knoxville, TN 37996 USA.;Univ Tennessee, Dept Earth & Planetary Sci, Knoxville, TN 37996 USA. (författare)
Steenkamp, Emma T.Univ Pretoria, Dept Biochem Genet & Microbiol, Pretoria, South Africa. (författare)
Spang, AnjaUppsala universitet,Molekylär evolution,Royal Netherlands Inst Sea Res, Dept Marine Microbiol & Biogeochem, Den Burg, Netherlands.(Swepub:uu)anjsp250 (författare)
Stewart, Frank J.Montana State Univ, Dept Microbiol & Immunol, Bozeman, MT 59717 USA. (författare)
Tiedje, James M.Michigan State Univ, Ctr Microbial Ecol, Dept Plant Soil & Microbial Sci, E Lansing, MI 48824 USA. (författare)
Vandamme, PeterUniv Ghent, Dept Biochem & Microbiol, Ghent, Belgium. (författare)
Wagner, MichaelUniv Vienna, Ctr Microbiol & Environm Syst Sci, Vienna, Austria. (författare)
Wang, Feng-PingShanghai Jiao Tong Univ, Int Ctr Deep Life Invest, Sch Oceanog, Shanghai, Peoples R China.;Shanghai Jiao Tong Univ, Sch Life Sci & Biotechnol, Shanghai, Peoples R China. (författare)
Hedlund, Brian P.Univ Nevada, Sch Life Sci, Las Vegas, NV 89154 USA. (författare)
Reysenbach, Anna-LouisePortland State Univ, Dept Biol, Portland, OR 97207 USA. (författare)
Desert Res Inst, Div Earth & Ecosyst Sci, Reno, NV 89512 USA.Ohio State Univ, Dept Evolut Ecol & Organismal Biol, Columbus, OH 43210 USA. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Microbiology: NATURE PUBLISHING GROUP5:8, s. 987-9942058-5276

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Microbiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Murray, Alison E ...; Freudenstein, Jo ...; Gribaldo, Simone ...; Hatzenpichler, R ...; Hugenholtz, Phil ...; Kämpfer, Peter; visa fler...; Konstantinidis, ...; Lane, Christophe ...; Papke, R. Thane; Parks, Donovan H ...; Rossello-Mora, R ...; Stott, Matthew B ...; Sutcliffe, Iain ...; Thrash, J. Camer ...; Venter, Stephanu ...; Whitman, William ...; Acinas, Silvia G ...; Amann, Rudolf, I; Anantharaman, Ka ...; Armengaud, Jean; Baker, Brett J.; Barco, Roman A.; Bode, Helge B.; Boyd, Eric S.; Brady, Carrie L.; Carini, Paul; Chain, Patrick S ...; Colman, Daniel R ...; DeAngelis, Krist ...; de los Rios, Mar ...; Estrada-de los S ...; Dunlap, Christop ...; Eisen, Jonathan ...; Emerson, David; Ettema, Thijs J. ...; Eveillard, Damie ...; Girguis, Peter R ...; Hentschel, Ute; Hollibaugh, Jame ...; Hug, Laura A.; Inskeep, William ...; Ivanova, Elena P ...; Klenk, Hans-Pete ...; Li, Wen-Jun; Lloyd, Karen G.; Löffler, Frank E ...; Makhalanyane, Th ...; Moser, Duane P.; Nunoura, Takuro; Palmer, Marike; Parro, Victor; Pedros-Alio, Car ...; Probst, Alexande ...; Smits, Theo H. M ...; Steen, Andrew D.; Steenkamp, Emma ...; Spang, Anja; Stewart, Frank J ...; Tiedje, James M.; Vandamme, Peter; Wagner, Michael; Wang, Feng-Ping; Hedlund, Brian P ...; Reysenbach, Anna ...; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

Artiklar i publikationen: Nature Microbiol ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se