SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Lin Weifeng)
 

Sökning: WFRF:(Lin Weifeng) > Rapid Preparation o...

Rapid Preparation of a Large Sulfated Metabolite Library for Structure Validation in Human Samples

Correia, Mario S. P. (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Kemisk biologi för biomarkörer
Lin, Weifeng (författare)
Uppsala universitet,Kemisk biologi för biomarkörer,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Aria, Arash J. (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för läkemedelskemi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa fler...
Jain, Abhishek (författare)
Uppsala universitet,Kemisk biologi för biomarkörer,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Globisch, Daniel (författare)
Uppsala universitet,Kemisk biologi för biomarkörer,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2020-10-16
2020
Engelska.
Ingår i: Metabolites. - : MDPI. - 2218-1989 .- 2218-1989. ; 10:10
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Metabolomics analysis of biological samples is widely applied in medical and natural sciences. Assigning the correct chemical structure in the metabolite identification process is required to draw the correct biological conclusions and still remains a major challenge in this research field. Several metabolite tandem mass spectrometry (MS/MS) fragmentation spectra libraries have been developed that are either based on computational methods or authentic libraries. These libraries are limited due to the high number of structurally diverse metabolites, low commercial availability of these compounds, and the increasing number of newly discovered metabolites. Phase II modification of xenobiotics is a compound class that is underrepresented in these databases despite their importance in diet, drug, or microbiome metabolism. The O-sulfated metabolites have been described as a signature for the co-metabolism of bacteria and their human host. Herein, we have developed a straightforward chemical synthesis method for rapid preparation of sulfated metabolite standards to obtain mass spectrometric fragmentation pattern and retention time information. We report the preparation of 38 O-sulfated alcohols and phenols for the determination of their MS/MS fragmentation pattern and chromatographic properties. Many of these metabolites are regioisomers that cannot be distinguished solely by their fragmentation pattern. We demonstrate that the versatility of this method is comparable to standard chemical synthesis. This comprehensive metabolite library can be applied for co-injection experiments to validate metabolites in different human sample types to explore microbiota-host co-metabolism, xenobiotic, and diet metabolism.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)

Nyckelord

sulfated metabolites
metabolomics
structure validation
chemical synthesis
phase II metabolism
microbiome

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Correia, Mario S ...
Lin, Weifeng
Aria, Arash J.
Jain, Abhishek
Globisch, Daniel
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Biokemi och mole ...
Artiklar i publikationen
Metabolites
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy