Guidelines for microbiome studies in renal physiology

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: L773:0363 6127 OR L773:1522 1466 OR L773:1931 857X > (2020-2024) > Guidelines for micr...

Muralitharan, Rikeish R.Monash Univ, Fac Sci, Sch Biol Sci, Hypertens Res Lab, Melbourne, Vic, Australia.;Minist Hlth Malaysia, Inst Med Res, Kuala Lumpur, Malaysia. (författare)

Guidelines for microbiome studies in renal physiology

Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

American Physiological Society,2023
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-513125
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-513125URI
https://doi.org/10.1152/ajprenal.00072.2023DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:for swepub-publicationtype

Anmärkningar

Gut microbiome research has increased dramatically in the last decade, including in renal health and disease. The field is moving from experiments showing mere association to causation using both forward and reverse microbiome approaches, leveraging tools such as germ-free animals, treatment with antibiotics, and fecal microbiota transplantations. However, we are still seeing a gap between discovery and translation that needs to be addressed, so that patients can benefit from microbiome-based therapies. In this guideline paper, we discuss the key considerations that affect the gut microbiome of animals and clinical studies assessing renal function, many of which are often overlooked, resulting in false-positive results. For animal studies, these include suppliers, acclimatization, baseline microbiota and its normalization, littermates and cohort/cage effects, diet, sex differences, age, circadian differences, antibiotics and sweeteners, and models used. Clinical studies have some unique considerations, which include sampling, gut transit time, dietary records, medication, and renal phenotypes. We provide best-practice guidance on sampling, storage, DNA extraction, and methods for microbial DNA sequencing (both 16S rRNA and shotgun metagenome). Finally, we discuss follow-up analyses, including tools available, metrics, and their interpretation, and the key challenges ahead in the microbiome field. By standardizing study designs, methods, and reporting, we will accelerate the findings from discovery to translation and result in new microbiome-based therapies that may improve renal health.

Ämnesord och genrebeteckningar

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper Mikrobiologi inom det medicinska området hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Basic Medicine Microbiology in the medical area hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Mikrobiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Microbiology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Endokrinologi och diabetes hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Endocrinology and Diabetes hsv//eng
16S
germ-free
kidney
metagenome
microbiome

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Snelson, MatthewMonash Univ, Cent Clin Sch, Dept Diabet, Melbourne, Vic, Australia. (författare)
Meric, GuillaumeUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Baker Heart & Diabet Inst, Cambridge Baker Syst Genom Initiat, Melbourne, Vic, Australia.;Univ Melbourne, Dept Cardiometab Hlth, Melbourne, Vic, Australia.;La Trobe Univ, Dept Cardiovasc Res Translat & Implementat, Melbourne, Vic, Australia.(Swepub:uu)guime146 (författare)
Coughlan, Melinda T.Monash Univ, Cent Clin Sch, Dept Diabet, Melbourne, Vic, Australia.;Monash Inst Pharmaceut Sci, Drug Discovery Biol, Parkville, Vic, Australia. (författare)
Marques, Francine Z.Monash Univ, Fac Sci, Sch Biol Sci, Hypertens Res Lab, Melbourne, Vic, Australia.;Baker Heart & Diabet Inst, Heart Failure Res Grp, Melbourne, Vic, Australia.;Monash Univ, Victorian Heart Inst, Melbourne, Vic, Australia. (författare)
Monash Univ, Fac Sci, Sch Biol Sci, Hypertens Res Lab, Melbourne, Vic, Australia.;Minist Hlth Malaysia, Inst Med Res, Kuala Lumpur, Malaysia.Monash Univ, Cent Clin Sch, Dept Diabet, Melbourne, Vic, Australia. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:American Journal of Physiology - Renal Physiology: American Physiological Society325:3, s. F345-F3621931-857X1522-1466

Internetlänk

Hitta via bibliotek

American Journal of Physiology - Renal Physiology (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Muralitharan, Ri ...; Snelson, Matthew; Meric, Guillaume; Coughlan, Melind ...; Marques, Francin ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Medicinska och f ...; och Mikrobiologi ino ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Mikrobiologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Endokrinologi oc ...

Artiklar i publikationen: American Journal ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se