SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Andreasson A)
 

Sökning: WFRF:(Andreasson A) > (2020-2024) > An advanced workflo...

An advanced workflow for single-particle imaging with the limited data at an X-ray free-electron laser

Assalauova, Dameli (författare)
DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany
Kim, Young Yong (författare)
DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany
Bobkov, Sergey (författare)
Natl Res Ctr, Kurchatov Inst, Akad Kurchatova Pl 1, Moscow 123182, Russia
visa fler...
Khubbutdinov, Ruslan (författare)
DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany; Natl Res Nucl Univ MEPhI, Moscow Engn Phys Inst, Kashirskoe Sh 31, Moscow 115409, Russia
Rose, Max (författare)
DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany
Alvarez, Roberto (författare)
Arizona State Univ, Dept Phys, Tempe, AZ 85287 USA; Arizona State Univ, Sch Math & Stat Sci, Tempe, AZ 85287 USA
Andreasson, Jakob (författare)
Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, CZ-18221 Prague, Czech Republic
Balaur, Eugeniu (författare)
La Trobe Univ, Australian Res Council, La Trobe Inst Mol Sci LIMS, Dept Chem & Phys,Ctr Excellence Adv Mol Imaging, Melbourne, Vic 3086, Australia
Contreras, Alice (författare)
Arizona State Univ, Sch Life Sci, Tempe, AZ 85287 USA; Arizona State Univ, Biodesign Inst Ctr Immunotherapy Vaccines & Virot, Tempe, AZ 85287 USA
DeMirci, Hasan (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, Stanford Pulse Inst, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA; Koc Univ, Dept Mol Biol & Genet, TR-34450 Istanbul, Turkey
Gelisio, Luca (författare)
DESY, Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany
Hajdu, Janos (författare)
Uppsala universitet,Molekylär biofysik,Acad Sci Czech Republ, ELI Beamlines, Inst Phys, CZ-18221 Prague, Czech Republic
Hunter, Mark S. (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA
Kurta, Ruslan P. (författare)
European XFEL, Holzkoppel 4, D-22869 Schenefeld, Germany
Li, Haoyuan (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA; Stanford Univ, Phys Dept, 450 Jane Stanford Way, Stanford, CA 94305 USA
McFadden, Matthew (författare)
Arizona State Univ, Biodesign Inst Ctr Immunotherapy Vaccines & Virot, Tempe, AZ 85287 USA
Nazari, Reza (författare)
Arizona State Univ, Dept Phys, Tempe, AZ 85287 USA; Arizona State Univ, Sch Engn Matter Transport & Energy, Tempe, AZ 85287 USA
Schwander, Peter (författare)
Univ Wisconsin, Milwaukee, WI 53211 USA
Teslyuk, Anton (författare)
Natl Res Ctr, Kurchatov Inst, Akad Kurchatova Pl 1, Moscow 123182, Russia; Moscow Inst Phys & Technol, Moscow 141700, Russia
Walter, Peter (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA
Xavier, P. Lourdu (författare)
DESY, Ctr Free Electron Laser Sci CFEL, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany; SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA; Max Planck Inst Struct & Dynam Matter, Luruper Chaussee 149, D-22761 Hamburg, Germany
Yoon, Chun Hong (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA
Zaare, Sahba (författare)
Arizona State Univ, Dept Phys, Tempe, AZ 85287 USA; SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA
Ilyin, Viacheslav A. (författare)
Natl Res Ctr, Kurchatov Inst, Akad Kurchatova Pl 1, Moscow 123182, Russia; Moscow Inst Phys & Technol, Moscow 141700, Russia
Kirian, Richard A. (författare)
Arizona State Univ, Dept Phys, Tempe, AZ 85287 USA
Hogue, Brenda G. (författare)
Arizona State Univ, Sch Life Sci, Tempe, AZ 85287 USA; Arizona State Univ, Biodesign Inst Ctr Immunotherapy Vaccines & Virot, Tempe, AZ 85287 USA; Arizona State Univ, Ctr Appl Struct Discovery, Biodesign Inst, Tempe, AZ 85287 USA
Aquila, Andrew (författare)
SLAC Natl Accelerator Lab, 2575 Sand Hill Rd, Menlo Pk, CA 94025 USA
Vartanyants, Ivan A. (författare)
DESY, Notkestr 85, D-22607 Hamburg, Germany; Natl Res Nucl Univ MEPhI, Moscow Engn Phys Inst, Kashirskoe Sh 31, Moscow 115409, Russia
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2020
2020
Engelska.
Ingår i: IUCrJ. - 2052-2525. ; 7, s. 1102-1113
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • An improved analysis for single-particle imaging (SPI) experiments, using the limited data, is presented here. Results are based on a study of bacteriophage PR772 performed at the Atomic, Molecular and Optical Science instrument at the Linac Coherent Light Source as part of the SPI initiative. Existing methods were modified to cope with the shortcomings of the experimental data: inaccessibility of information from half of the detector and a small fraction of single hits. The general SPI analysis workflow was upgraded with the expectation-maximization based classification of diffraction patterns and mode decomposition on the final virus-structure determination step. The presented processing pipeline allowed us to determine the 3D structure of bacteriophage PR772 without symmetry constraints with a spatial resolution of 6.9 nm. The obtained resolution was limited by the scattering intensity during the experiment and the relatively small number of single hits.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Kemi -- Materialkemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences -- Materials Chemistry (hsv//eng)

Nyckelord

single-particle imaging
three-dimensional virus reconstruction
bacteriophage PR772
XFELs

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • IUCrJ (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy