id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-435237"
Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-435237" > The bacterial iron ...
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
- Marcos-Torres, Francisco JavierUppsala universitet,Strukturbiologi (författare)
The bacterial iron sensor IdeR recognizes its DNA targets by indirect readout
- Artikel/kapitelEngelska2021
Förlag, utgivningsår, omfång ...
- 2021-08-20
- Oxford University Press,2021
- electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
- LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-435237
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-435237URI
- https://doi.org/10.1093/nar/gkab711DOI
Kompletterande språkuppgifter
- Språk:engelska
- Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
- SwePubSwePub
Klassifikation
Anmärkningar
- Francisco Javier Marcos-Torres and Dirk Maurer contributed equally to this work.List of authors in preprint: Francisco Javier Marcos-Torres, Dirk Maurer, Julia J. Griese
- The iron-dependent regulator IdeR is the main transcriptional regulator controlling iron homeostasis genes in Actinobacteria, including species from the Corynebacterium, Mycobacterium and Streptomyces genera, as well as the erythromycin-producing bacterium Saccharopolyspora erythraea. Despite being a well-studied transcription factor since the identification of the Diphtheria toxin repressor DtxR three decades ago, the details of how IdeR proteins recognize their highly conserved 19-bp DNA target remain to be elucidated. IdeR makes few direct contacts with DNA bases in its target sequence, and we show here that these contacts are not required for target recognition. The results of our structural and mutational studies support a model wherein IdeR mainly uses an indirect readout mechanism, identifying its targets via the sequence-dependent DNA backbone structure rather than through specific contacts with the DNA bases. Furthermore, we show that IdeR efficiently recognizes a shorter palindromic sequence corresponding to a half binding site as compared to the full 19-bp target previously reported, expanding the number of potential target genes controlled by IdeR proteins.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
- Maurer, Dirk,1985-Uppsala universitet,Strukturbiologi(Swepub:uu)maudi347 (författare)
- Juniar, LindaUppsala universitet,Strukturbiologi(Swepub:uu)linju896 (författare)
- Griese, Julia J.Uppsala universitet,Strukturbiologi(Swepub:uu)julgr393 (författare)
- Uppsala universitetStrukturbiologi (creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
- Ingår i:Nucleic Acids Research: Oxford University Press0305-10481362-4962
Internetlänk
- https://doi.org/10.1093/nar/gkab711Fulltext
- https://doi.org/10.1101/2021.02.12.430932Preprint in bioRxiv
- https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1530526/FULLTEXT01.pdffulltext:preprint
- https://uu.diva-portal.org/smash/get/diva2:1530526/FULLTEXT02.pdffulltext:print
- https://doi.org/10.1093/nar/gkab711
- https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-435237
- https://doi.org/10.1093/nar/gkab711
- 1 av 1
- Föregående post
- Nästa post
- Till träfflistan
Hitta mer i SwePub
- Av författaren/redakt...
- Marcos-Torres, F ...
- Maurer, Dirk, 19 ...
- Juniar, Linda
- Griese, Julia J.
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
- NATURVETENSKAP
- och Biologi
- och Strukturbiologi
- Artiklar i publikationen
- Nucleic Acids Re ...
- Av lärosätet
- Uppsala universitet
Sök utanför SwePub
- Sök vidare i:
- Google Book Search
- Google Scholar
Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.
- Copyright © LIBRIS - Nationella bibliotekssystem
- LIBRIS.kb.se
