SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Baumann Tycho)
 

Sökning: WFRF:(Baumann Tycho) > The proliferative h...

  • Duran-Ferrer, MartiInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain. (författare)

The proliferative history shapes the DNA methylome of B-cell tumors and predicts clinical outcome

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-11-02
  • Springer Nature,2020
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-436028
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-436028URI
  • https://doi.org/10.1038/s43018-020-00131-2DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We report a systematic analysis of the DNA methylation variability in 1,595 samples of normal cell subpopulations and 14 tumor subtypes spanning the entire human B-cell lineage. Differential methylation among tumor entities relates to differences in cellular origin and to de novo epigenetic alterations, which allowed us to build an accurate machine learning-based diagnostic algorithm. We identify extensive individual-specific methylation variability in silenced chromatin associated with the proliferative history of normal and neoplastic B cells. Mitotic activity generally leaves both hyper- and hypomethylation imprints, but some B-cell neoplasms preferentially gain or lose DNA methylation. We construct a DNA-methylation-based mitotic clock, called epiCMIT, whose lapse magnitude represents a strong independent prognostic variable in B-cell tumors and is associated with particular driver genetic alterations. Our findings reveal DNA methylation as a holistic tracer of B-cell tumor developmental history, with implications in differential diagnosis and the prediction of clinical outcome. Martin-Subero and colleagues analyze DNA methylation patterns in B-cell tumors and their normal cells of origin, and develop epiCMIT, a methylation-based mitotic clock with prognostic relevance.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Clot, GuillemInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain. (författare)
  • Nadeu, FerranInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain. (författare)
  • Beekman, ReneeInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain. (författare)
  • Baumann, TychoCIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (författare)
  • Nordlund, JessicaUppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)jesno775 (författare)
  • Marincevic-Zuniga, YanaraUppsala universitet,Molekylär medicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)yanma214 (författare)
  • Lönnerholm, Gudmar,1941-Uppsala universitet,Barnneurologi/Barnonkologi(Swepub:uu)gudmarlh (författare)
  • Rivas-Delgado, AlfredoInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (författare)
  • Martin, SilviaInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain. (författare)
  • Ordonez, RaquelCIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDISNA, Ctr Invest Med Aplicada CIMA, Pamplona, Spain. (författare)
  • Castellano, GiancarloInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain. (författare)
  • Kulis, MartaInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain. (författare)
  • Queiros, Ana C.Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain. (författare)
  • Lee, Seung-TaeYonsei Univ, Coll Med, Dept Lab Med, Seoul, South Korea. (författare)
  • Wiemels, JosephUniv Southern Calif, Ctr Genet Epidemiol, Los Angeles, CA 90007 USA. (författare)
  • Royo, RominaUniv Barcelona, Spanish Natl Bioinformat Inst, Inst Recerca Biomed IRB, Programa Conjunto Biol Computac,Barcelona Superco, Barcelona, Spain. (författare)
  • Puiggros, MontserratUniv Barcelona, Spanish Natl Bioinformat Inst, Inst Recerca Biomed IRB, Programa Conjunto Biol Computac,Barcelona Superco, Barcelona, Spain. (författare)
  • Lu, JunyanEuropean Mol Biol Lab EMBL, Heidelberg, Germany. (författare)
  • Gine, EvaInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (författare)
  • Bea, SilviaInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Ohio State Univ, Dept Internal Med, Div Hematol, Columbus, OH 43210 USA. (författare)
  • Jares, PedroInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Ohio State Univ, Dept Internal Med, Div Hematol, Columbus, OH 43210 USA. (författare)
  • Agirre, XabierCIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDISNA, Ctr Invest Med Aplicada CIMA, Pamplona, Spain. (författare)
  • Prosper, FelipeCIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDISNA, Ctr Invest Med Aplicada CIMA, Pamplona, Spain.;Univ Navarra, Clin Univ Navarra, Hematol & Cell Therapy Dept, Pamplona, Spain. (författare)
  • Lopez-Otin, CarlosCIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Univ Oviedo, Inst Univ Oncol IUOPA, Dept Bioquim & Biol Mol, Oviedo, Spain. (författare)
  • Puente, Xose S.CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Univ Oviedo, Inst Univ Oncol IUOPA, Dept Bioquim & Biol Mol, Oviedo, Spain. (författare)
  • Oakes, Christopher C.Ohio State Univ, Dept Internal Med, Div Hematol, Columbus, OH 43210 USA. (författare)
  • Zenz, ThorstenOhio State Univ, Dept Internal Med, Div Hematol, Columbus, OH 43210 USA.;Univ Hosp Zurich, Dept Med Oncol & Hematol, Zurich, Switzerland.;Univ Zurich, Zurich, Switzerland. (författare)
  • Delgado, JulioInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (författare)
  • Lopez-Guillermo, ArmandoInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (författare)
  • Campo, EliasInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Univ Barcelona, Fac Med, Dept Fonaments Clin, Barcelona, Spain. (författare)
  • Ignacio Martin-Subero, JoseInst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;Univ Barcelona, Fac Med, Dept Fonaments Clin, Barcelona, Spain.;Inst Catalana Recerca & Estudis Avancats ICREA, Barcelona, Spain. (författare)
  • Inst Invest Biomed August Pi & Sunyer IDIBAPS, Barcelona, Spain.;CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.CIBERONC, Ctr Invest Biomed Red Canc, Madrid, Spain.;IDIBAPS, Hosp Clin, Serv Hematol, Barcelona, Spain. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:NATURE CANCER: Springer Nature1:11, s. 1066-10812662-1347

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy