SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Keränen Henrik)
 

Sökning: WFRF:(Keränen Henrik) > (2020) > X-Ray Crystallograp...

  • Jespers, WillemUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik (författare)

X-Ray Crystallography and Free Energy Calculations Reveal the Binding Mechanism of A(2A) Adenosine Receptor Antagonists

  • Artikel/kapitelEngelska2020

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2020-07-22
  • WILEY-V C H VERLAG GMBH,2020
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-439264
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-439264URI
  • https://doi.org/10.1002/anie.202003788DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We present a robust protocol based on iterations of free energy perturbation (FEP) calculations, chemical synthesis, biophysical mapping and X-ray crystallography to reveal the binding mode of an antagonist series to the A(2A) adenosine receptor (AR). Eight A(2A)AR binding site mutations from biophysical mapping experiments were initially analyzed with sidechain FEP simulations, performed on alternate binding modes. The results distinctively supported one binding mode, which was subsequently used to design new chromone derivatives. Their affinities for the A(2A)AR were experimentally determined and investigated through a cycle of ligand-FEP calculations, validating the binding orientation of the different chemical substituents proposed. Subsequent X-ray crystallography of the A(2A)AR with a low and a high affinity chromone derivative confirmed the predicted binding orientation. The new molecules and structures here reported were driven by free energy calculations, and provide new insights on antagonist binding to the A(2A)AR, an emerging target in immunooncology.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Verdon, GregorySosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Azuaje, JhonnyUniv Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain. (författare)
  • Majellaro, MariaUniv Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain. (författare)
  • Keränen, Henrik,1983-Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi,Uppsala Univ, Biomed Ctr, Dept Cell & Mol Biol, BMC, Box 596, Uppsala, Sweden.;H Lundbeck & Co AS, Ottiliavej 9, DK-2500 Valby, Denmark.(Swepub:uu)henke383 (författare)
  • Garcia-Mera, XerardoUniv Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain. (författare)
  • Congreve, MilesSosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Deflorian, FrancescaSosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • de Graaf, ChrisSosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Zhukov, AndreiSosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Dore, Andrew S.Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Mason, Jonathan S.Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Åqvist, JohanUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräkningsbiologi och bioinformatik(Swepub:uu)johanaq (författare)
  • Cooke, Robert M.Sosei Heptares, Steinmetz Granta Pk, Cambridge CB21 6DG, England. (författare)
  • Sotelo, EddyUniv Santiago de Compostela, Fac Farmacy, Dept Organ Chem, Santiago De Compostela, Spain.;Univ Santiago de Compostela, Ctr Singular Invest Quim Biol & Mat Mol CIQUS, Santiago De Compostela, Spain. (författare)
  • Gutiérrez-de-Terán, HugoUppsala universitet,Beräkningsbiologi och bioinformatik,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)hugut367 (författare)
  • Uppsala universitetBeräkningsbiologi och bioinformatik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Angewandte Chemie International Edition: WILEY-V C H VERLAG GMBH59:38, s. 16536-165431433-78511521-3773

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy