SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Haglöf Jakob)
 

Sökning: WFRF:(Haglöf Jakob) > Oceanographic setti...

Oceanographic setting influences the prokaryotic community and metabolome in deep-sea sponges

Steffen, Karin, 1989- (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap,Farmakognosi
Indraningrat, Anak Agung Gede (författare)
Erngren, Ida, 1989- (författare)
Uppsala universitet,Analytisk farmaceutisk kemi
visa fler...
Haglöf, Jakob (författare)
Uppsala universitet,Analytisk farmaceutisk kemi
Becking, Leontine E. (författare)
Smidt, Hauke (författare)
Yashayaev, Igor (författare)
Kenchington, Ellen (författare)
Pettersson, Curt (författare)
Uppsala universitet,Analytisk farmaceutisk kemi
Cárdenas, Paco, 1976- (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap,Farmakognosi
Sipkema, Detmer (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2022-03-01
2022
Engelska.
Ingår i: Scientific Reports. - : NATURE RESEARCH. - 2045-2322. ; 12
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Marine sponges (phylum Porifera) are leading organisms for the discovery of bioactive compounds from nature. Their often rich and species-specific microbiota is hypothesised to be producing many of these compounds. Yet, environmental influences on the sponge-associated microbiota and bioactive compound production remain elusive. Here, we investigated the changes of microbiota and metabolomes in sponges along a depth range of 1232 m. Using 16S rRNA gene amplicon sequencing and untargeted metabolomics, we assessed prokaryotic and chemical diversities in three deep-sea sponge species: Geodia barretti, Stryphnus fortis, and Weberella bursa. Both prokaryotic communities and metabolome varied significantly with depth, which we hypothesized to be the effect of different water masses. Up to 35.5 % of microbial ASVs (amplicon sequence variants) showed significant changes with depth while phylum-level composition of host microbiome remained unchanged. The metabolome varied with depth, with relative quantities of known bioactive compounds increasing or decreasing strongly. Other metabolites varying with depth were compatible solutes regulating osmolarity of the cells. Correlations between prokaryotic community and the bioactive compounds in G. barretti suggested members of Acidobacteria, Proteobacteria, Chloroflexi, or an unclassified prokaryote as potential producers.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Ekologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Ecology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy