Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-474702" >
Cell-lineage contro...
-
Lu, XiUppsala universitet,Molekylära verktyg
(författare)
Cell-lineage controlled epigenetic regulation in glioblastoma stem cells determines functionally distinct subgroups and predicts patient survival
- Artikel/kapitelEngelska2022
Förlag, utgivningsår, omfång ...
-
2022-04-25
-
Springer Nature,2022
-
electronicrdacarrier
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-474702
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-474702URI
-
https://doi.org/10.1038/s41467-022-29912-2DOI
-
http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:149502998URI
Kompletterande språkuppgifter
-
Språk:engelska
-
Sammanfattning på:engelska
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
De två första författarna delar förstaförfattarskapet.De två sista författarna delar sistaförfattarskapet.
-
The epigenetic regulation of glioblastoma stem cell (GSC) function remains poorly understood. Here, the authors compare the chromatin accessibility landscape of GSC cultures from mice and patients and suggest that the epigenome of GSCs is cell lineage-regulated and could predict patient survival. There is ample support for developmental regulation of glioblastoma stem cells. To examine how cell lineage controls glioblastoma stem cell function, we present a cross-species epigenome analysis of mouse and human glioblastoma stem cells. We analyze and compare the chromatin-accessibility landscape of nine mouse glioblastoma stem cell cultures of three defined origins and 60 patient-derived glioblastoma stem cell cultures by assay for transposase-accessible chromatin using sequencing. This separates the mouse cultures according to cell of origin and identifies three human glioblastoma stem cell clusters that show overlapping characteristics with each of the mouse groups, and a distribution along an axis of proneural to mesenchymal phenotypes. The epigenetic-based human glioblastoma stem cell clusters display distinct functional properties and can separate patient survival. Cross-species analyses reveals conserved epigenetic regulation of mouse and human glioblastoma stem cells. We conclude that epigenetic control of glioblastoma stem cells primarily is dictated by developmental origin which impacts clinically relevant glioblastoma stem cell properties and patient survival.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Maturi, Naga PrathyushaUppsala universitet,Neuroonkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)pnapr938
(författare)
-
Jarvius, MalinUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
(författare)
-
Yildirim, IremUppsala universitet,Neuroonkologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)ireyi255
(författare)
-
Dang, YonglongUppsala universitet,Molekylära verktyg(Swepub:uu)yonda310
(författare)
-
Zhao, LinxuanUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
(författare)
-
Xie, YuanUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)yuaxi268
(författare)
-
Tan, E-Jean,1979-Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)e-jta942
(författare)
-
Xing, PengweiUppsala universitet,Molekylära verktyg(Swepub:uu)penxi331
(författare)
-
Larsson, RolfUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)rolflars
(författare)
-
Fryknäs, MårtenUppsala universitet,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)mafry516
(författare)
-
Uhrbom, LeneUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Neuroonkologi(Swepub:uu)leneuhrb
(författare)
-
Chen, XingqiUppsala universitet,Molekylära verktyg(Swepub:uu)xinch196
(författare)
-
Uppsala universitetMolekylära verktyg
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Nature Communications: Springer Nature132041-1723
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Lu, Xi
-
Maturi, Naga Pra ...
-
Jarvius, Malin
-
Yildirim, Irem
-
Dang, Yonglong
-
Zhao, Linxuan
-
visa fler...
-
Xie, Yuan
-
Tan, E-Jean, 197 ...
-
Xing, Pengwei
-
Larsson, Rolf
-
Fryknäs, Mårten
-
Uhrbom, Lene
-
Chen, Xingqi
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Cancer och onkol ...
- Artiklar i publikationen
-
Nature Communica ...
- Av lärosätet
-
Uppsala universitet
-
Karolinska Institutet