SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Zhao Xun)
 

Sökning: WFRF:(Zhao Xun) > Endothelial cell he...

  • Wang, FeiBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China. (författare)

Endothelial cell heterogeneity and microglia regulons revealed by a pig cell landscape at single-cell level

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-06-24
  • Springer Nature,2022
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-480377
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-480377URI
  • https://doi.org/10.1038/s41467-022-31388-zDOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-315532URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:150079864URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Correction in: Nature communications Vol 13 (2022), article number 6748.DOI: 10.1038/s41467-022-34498-w
  • Correction in: Nature Communications, vol. 13, issue. 1. DOI: 10.1038/s41467-022-34498-w, WOS: 000885370100016, ScopusID: 2-s2.0-85141346712QC 20220707
  • Pigs are valuable large animal models for biomedical and genetic research, but insights into the tissue- and cell-type-specific transcriptome and heterogeneity remain limited. By leveraging single-cell RNA sequencing, we generate a multiple-organ single-cell transcriptomic map containing over 200,000 pig cells from 20 tissues/organs. We comprehensively characterize the heterogeneity of cells in tissues and identify 234 cell clusters, representing 58 major cell types. In-depth integrative analysis of endothelial cells reveals a high degree of heterogeneity. We identify several functionally distinct endothelial cell phenotypes, including an endothelial to mesenchymal transition subtype in adipose tissues. Intercellular communication analysis predicts tissue- and cell type-specific crosstalk between endothelial cells and other cell types through the VEGF, PDGF, TGF-beta, and BMP pathways. Regulon analysis of single-cell transcriptome of microglia in pig and 12 other species further identifies MEF2C as an evolutionally conserved regulon in the microglia. Our work describes the landscape of single-cell transcriptomes within diverse pig organs and identifies the heterogeneity of endothelial cells and evolutionally conserved regulon in microglia.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Ding, PeiwenBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Liang, XueUniv Copenhagen, Dept Biol, Copenhagen, Denmark. (författare)
  • Ding, XiangningBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Brandt, Camilla BlunkAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Sjostedt, EvelinaKarolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Zhu, JiachengBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Bolund, SagaKarolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Zhang, LijingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;BGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • de Rooij, Laura P. M. H.VIB, Ctr Canc Biol, Lab Angiogenesis & Vasc Metab, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Leuven Canc Inst, Dept Oncol, Leuven, Belgium.,BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Luo, LihuaBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Wei, YananBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Zhao, WandongBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Lv, ZhiyuanBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Hasko, JanosAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Li, RunchuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Qin, QiuyuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Jia, YiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Wu, WendiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Yuan, YutingBinzhou Med Univ, Sch Basic Med Sci, Yantai, Peoples R China. (författare)
  • Pu, MingyiBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Qingdao Univ, Coll Basic Med, Qingdao, Peoples R China. (författare)
  • Wang, HaoyuBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Wu, AipingChinese Acad Med Sci, Peking Union Med Coll, Inst Syst Med, Beijing, Peoples R China.;Suzhou Inst Syst Med, Suzhou, Peoples R China. (författare)
  • Xie, LinBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • Liu, PingBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • Chen, FangBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • Herold, JacquelineAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Kalucka, JoannaAarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ, Aarhus Univ Adv Studies AIAS, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Karlsson, MaxKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1hm1ssx (författare)
  • Zhang, XiuqingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (författare)
  • Helmig, Rikke BekAarhus Univ Hosp, Dept Obstet & Gynecol, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Fagerberg, LinnKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1dglfid (författare)
  • Lindskog, CeciliaUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)cecli129 (författare)
  • Pontén, FredrikUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi(Swepub:uu)fredpont (författare)
  • Uhlén, MathiasKTH,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Proteinvetenskap,Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.;KTH Royal Inst Technol, Sci Life Lab, Dept Prot Sci, Stockholm, Sweden.(Swepub:kth)u1dulvmw (författare)
  • Bolund, LarsBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Jessen, NielsAarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Jiang, HuiBGI Shenzhen, MGI, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • Xu, XunBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China. (författare)
  • Yang, HuanmingBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Chinese Acad Sci, Univ Chinese Acad Sci, Inst Basic Med & Canc IBMC, IBMC BGI Ctr,Canc Hosp,Zhejiang Canc Hosp, Hangzhou, Peoples R China. (författare)
  • Carmeliet, PeterAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;VIB, Ctr Canc Biol, Lab Angiogenesis & Vasc Metab, Leuven, Belgium.;Katholieke Univ Leuven, Leuven Canc Inst, Dept Oncol, Leuven, Belgium.;Khalifa Univ Sci & Technol, Ctr Biotechnol, Abu Dhabi, U Arab Emirates. (författare)
  • Mulder, JanKarolinska Institutet,Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Chen, DongshengBGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Suzhou Inst Syst Med, Suzhou, Peoples R China. (författare)
  • Lin, LinAarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark. (författare)
  • Luo, YonglunBGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Aarhus Univ Hosp, Steno Diabet Ctr Aarhus, Aarhus, Denmark. (författare)
  • BGI Shenzhen, BGI Qingdao, Qingdao Europe Adv Inst Life Sci, Lars Bolund Inst Regenerat Med, Qingdao, Peoples R China.;Aarhus Univ, Dept Biomed, Aarhus, Denmark.;BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.BGI Shenzhen, Shenzhen, Peoples R China.;Univ Chinese Acad Sci, Coll Life Sci, Beijing, Peoples R China. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Nature Communications: Springer Nature13:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy