SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Wales Nathan)
 

Sökning: WFRF:(Wales Nathan) > The genomic basis o...

The genomic basis of the plant island syndrome in Darwin's giant daisies

Cerca, Jose (författare)
Norwegian Univ Sci & Technol, NTNU Univ Museum, Dept Nat Hist, Trondheim, Norway.
Petersen, Bent (författare)
Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Ctr Evolutionary Hologen, GLOBE Inst, Oster Farimagsgade 5, DK-1353 Copenhagen, Denmark.;AIMST Univ, Fac Appl Sci, Ctr Excellence Omics Driven Computat Biodiscovery, Bedong, Kedah, Malaysia.
Lazaro-Guevara, Jose Miguel (författare)
Univ British Columbia, Dept Bot & Biodivers Res Ctr, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada.
visa fler...
Rivera-Colon, Angel (författare)
Univ Illinois, Dept Evolut Ecol & Behav, Champaign, IL USA.
Birkeland, Siri (författare)
Norwegian Univ Life Sci, Dept Chem Biotechnol & Food Sci, As, Norway.;Univ Oslo, Nat Hist Museum, Oslo, Norway.
Vizueta, Joel (författare)
Univ Copenhagen, Villum Ctr Biodivers Genom, Dept Biol, Sect Ecol & Evolut, Univ Pk 15, DK-2100 Copenhagen, Denmark.
Li, Siyu (författare)
Univ Calif Davis, Dept Plant Biol, Davis, CA 95616 USA.
Li, Qionghou (författare)
Univ British Columbia, Dept Bot & Biodivers Res Ctr, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada.
Loureiro, Joao (författare)
Univ Coimbra, Ctr Funct Ecol, Dept Life Sci, P-3000095 Coimbra, Portugal.
Kosawang, Chatchai (författare)
Univ Copenhagen, Dept Geosci & Nat Resource Management, Rolighedsvej 23, DK-1958 Frederiksberg C, Denmark.
Diaz, Patricia Jaramillo (författare)
Fdn Charles Darwin, Estn Cient Charles Darwin, Santa Cruz, Galapagos, Ecuador.;Univ Malaga, Dept Bot & Plant Physiol, Malaga, Spain.
Rivas-Torres, Gonzalo (författare)
Univ San Francisco Quito USFQ, Colegio Ciencias Biol & Ambientales COCIBA & Exte, Quito 170901, Ecuador.;Univ N Carolina, Galapagos Sci Ctr, USFQ, San Cristobal, Galapagos, Ecuador.;Univ San Francisco Quito USFQ, Colegio Ciencias Biol & Ambientales, Estn Biodiversidad Tiputini, Quito, Ecuador.;Univ Florida, Courtesy Fac, Dept Wildlife Ecol & Conservat, 110 Newins Ziegler Hall, Gainesville, FL 32611 USA.
Fernandez-Mazuecos, Mario (författare)
Univ Autonoma Madrid, Dept Biol, Madrid 28049, Spain.
Vargas, Pablo (författare)
Real Jardin Bot RJB CSIC, Dept Biodiversidad & Conservac, Plaza Murillo 2, Madrid 28014, Spain.
McCauley, Ross A. (författare)
Ft Lewis Coll, Dept Biol, Durango, CO 81301 USA.
Petersen, Gitte (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för ekologi, miljö och botanik,Stockholm Univ, Dept Ecol Environm & Plant Sci, SE-10691 Stockholm, Sweden.
Santos-Bay, Luisa (författare)
Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Ctr Evolutionary Hologen, GLOBE Inst, Oster Farimagsgade 5, DK-1353 Copenhagen, Denmark.
Wales, Nathan (författare)
Univ York, Dept Archaeol, York, N Yorkshire, England.
Catchen, Julian M. (författare)
Univ Illinois, Dept Evolut Ecol & Behav, Champaign, IL USA.
Machado, Daniel (författare)
Norwegian Univ Sci & Technol, Dept Biotechnol & Food Sci, N-7491 Trondheim, Norway.
Nowak, Michael D. (författare)
Univ Oslo, Nat Hist Museum, Oslo, Norway.
Suh, Alexander (författare)
Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systematisk biologi,Univ East Anglia, Sch Biol Sci, Norwich Res Pk, Norwich NR4 7TU, Norfolk, England
Sinha, Neelima R. (författare)
Univ Calif Davis, Dept Plant Biol, Davis, CA 95616 USA.
Nielsen, Lene R. (författare)
Univ Copenhagen, Dept Geosci & Nat Resource Management, Rolighedsvej 23, DK-1958 Frederiksberg C, Denmark.
Seberg, Ole (författare)
Univ Copenhagen, Nat Hist Museum Denmark, Copenhagen, Denmark.
Gilbert, M. Thomas P. (författare)
Norwegian Univ Sci & Technol, NTNU Univ Museum, Dept Nat Hist, Trondheim, Norway.;Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Ctr Evolutionary Hologen, GLOBE Inst, Oster Farimagsgade 5, DK-1353 Copenhagen, Denmark.
Leebens-Mack, James H. (författare)
Univ Georgia, Dept Plant Biol, Athens, GA 30602 USA.
Rieseberg, Loren H. (författare)
Univ British Columbia, Dept Bot & Biodivers Res Ctr, Vancouver, BC V6T 1Z4, Canada.
Martin, Michael D. (författare)
Norwegian Univ Sci & Technol, NTNU Univ Museum, Dept Nat Hist, Trondheim, Norway.
visa färre...
Norwegian Univ Sci & Technol, NTNU Univ Museum, Dept Nat Hist, Trondheim, Norway Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Ctr Evolutionary Hologen, GLOBE Inst, Oster Farimagsgade 5, DK-1353 Copenhagen, Denmark.;AIMST Univ, Fac Appl Sci, Ctr Excellence Omics Driven Computat Biodiscovery, Bedong, Kedah, Malaysia. (creator_code:org_t)
2022-06-28
2022
Engelska.
Ingår i: Nature Communications. - : Springer Nature. - 2041-1723. ; 13:1
Relaterad länk:
https://doi.org/10.1...
visa fler...
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
https://urn.kb.se/re...
https://doi.org/10.1...
https://urn.kb.se/re...
visa färre...
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Many island plant species share a syndrome of characteristic phenotype and life history. Cerca et al. find the genomic basis of the plant island syndrome in one of Darwin's giant daisies, while separating ancestral genomes in a chromosome-resolved polyploid assembly. The repeated, rapid and often pronounced patterns of evolutionary divergence observed in insular plants, or the 'plant island syndrome', include changes in leaf phenotypes, growth, as well as the acquisition of a perennial lifestyle. Here, we sequence and describe the genome of the critically endangered, Galapagos-endemic species Scalesia atractyloides Arnot., obtaining a chromosome-resolved, 3.2-Gbp assembly containing 43,093 candidate gene models. Using a combination of fossil transposable elements, k-mer spectra analyses and orthologue assignment, we identify the two ancestral genomes, and date their divergence and the polyploidization event, concluding that the ancestor of all extant Scalesia species was an allotetraploid. There are a comparable number of genes and transposable elements across the two subgenomes, and while their synteny has been mostly conserved, we find multiple inversions that may have facilitated adaptation. We identify clear signatures of selection across genes associated with vascular development, growth, adaptation to salinity and flowering time, thus finding compelling evidence for a genomic basis of the island syndrome in one of Darwin's giant daisies.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy