SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

AMNE:(NATURVETENSKAP Biologi Genetik)
 

Sökning: AMNE:(NATURVETENSKAP Biologi Genetik) > Bayesian model and ...

  • Tengvall, Katarina,1980-Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Kerstin Lindblad-Toh (författare)

Bayesian model and selection signature analyses reveal risk factors for canine atopic dermatitis

  • Artikel/kapitelEngelska2022

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2022-12-08
  • Springer Nature,2022
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-490599
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-490599URI
  • https://doi.org/10.1038/s42003-022-04279-8DOI
  • https://res.slu.se/id/publ/123598URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Canine atopic dermatitis is an inflammatory skin disease with clinical similarities to human atopic dermatitis. Several dog breeds are at increased risk for developing this disease but previous genetic associations are poorly defined. To identify additional genetic risk factors for canine atopic dermatitis, we here apply a Bayesian mixture model adapted for mapping complex traits and a cross-population extended haplotype test to search for disease-associated loci and selective sweeps in four dog breeds at risk for atopic dermatitis. We define 15 associated loci and eight candidate regions under selection by comparing cases with controls. One associated locus is syntenic to the major genetic risk locus (Filaggrin locus) in human atopic dermatitis. One selection signal in common type Labrador retriever cases positions across the TBC1D1 gene (body weight) and one signal of selection in working type German shepherd controls overlaps the LRP1B gene (brain), near the KYNU gene (psoriasis). In conclusion, we identify candidate genes, including genes belonging to the same biological pathways across multiple loci, with potential relevance to the pathogenesis of canine atopic dermatitis. The results show genetic similarities between dog and human atopic dermatitis, and future across-species genetic comparisons are hereby further motivated.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Sundström, ElisabethUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)elsun062 (författare)
  • Wang, ChaoUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)chawa410 (författare)
  • Bergvall, KerstinSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences(Swepub:slu)47499 (författare)
  • Wallerman, OlaUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi(Swepub:uu)olwal516 (författare)
  • Pederson, EricUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)eripe452 (författare)
  • Karlsson, ÅsaUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)asaka483 (författare)
  • Harvey, Naomi D. (författare)
  • Blott, Sarah C. (författare)
  • Olby, Natasha (författare)
  • Olivry, Thierry (författare)
  • Brander, GustafUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA(Swepub:uu)gusbr893 (författare)
  • Meadows, Jennifer R.S.Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)jenme818 (författare)
  • Roosje, Petra (författare)
  • Leeb, Tosso (författare)
  • Hedhammar, ÅkeSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för kliniska vetenskaper (KV),Department of Clinical Sciences(Swepub:slu)49648 (författare)
  • Andersson, GöranSwedish University of Agricultural Sciences,Sveriges lantbruksuniversitet,Institutionen för husdjursgenetik (HGEN),Department of Animal Breeding and Genetics(Swepub:slu)50422 (författare)
  • Lindblad-Toh, KerstinUppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA(Swepub:uu)kerli865 (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)
  • Sveriges lantbruksuniversitet

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Communications Biology: Springer Nature5:12399-3642

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy