SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Grazulis Saulius)
 

Sökning: WFRF:(Grazulis Saulius) > PLBD :

  • Linge, DariusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)

PLBD : protein-ligand binding database of thermodynamic and kinetic intrinsic parameters

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • OXFORD UNIV PRESS,2023
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-506996
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-506996URI
  • https://doi.org/10.1093/database/baad040DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We introduce a protein-ligand binding database (PLBD) that presents thermodynamic and kinetic data of reversible protein interactions with small molecule compounds. The manually curated binding data are linked to protein-ligand crystal structures, enabling structure-thermodynamics correlations to be determined. The database contains over 5500 binding datasets of 556 sulfonamide compound interactions with the 12 catalytically active human carbonic anhydrase isozymes defined by fluorescent thermal shift assay, isothermal titration calorimetry, inhibition of enzymatic activity and surface plasmon resonance. In the PLBD, the intrinsic thermodynamic parameters of interactions are provided, which account for the binding-linked protonation reactions. In addition to the protein-ligand binding affinities, the database provides calorimetrically measured binding enthalpies, providing additional mechanistic understanding. The PLBD can be applied to investigations of protein-ligand recognition and could be integrated into small molecule drug design.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Gedgaudas, MariusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Merkys, AndriusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Sect Crystallog & Cheminformat, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Petrauskas, VytautasVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Vaitkus, AntanasVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Sect Crystallog & Cheminformat, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Grybauskas, AlgirdasVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Sect Crystallog & Cheminformat, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Paketuryte, VaidaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Zubriene, AstaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Zaksauskas, AudriusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Mickeviciute, AurelijaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Smirnoviene, JoanaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Baranauskiene, LinaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Capkauskaite, EditaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Dudutiene, VirginijaVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Urniezius, ErnestasVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Konovalovas, AleksandrasVilnius Univ, Inst Biosci, Life Sci Ctr, Dept Biochem & Mol Biol, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Kazlauskas, EgidijusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Shubin, KirillLatvian Inst Organ Synth, Aizkraukles St 21, LV-1006 Riga, Latvia. (författare)
  • Schiöth, Helgi B.Uppsala universitet,Funktionell farmakologi och neurovetenskap(Swepub:uu)helgschi (författare)
  • Chen, Wen-YihNatl Cent Univ, Dept Chem & Mat Engn, 300 Zhongda Rd, Taoyuan 320, Taiwan. (författare)
  • Ladbury, John E.Univ Leeds, Sch Mol & Cellular Biol, Leeds LS2 9JT, England. (författare)
  • Grazulis, SauliusVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Sect Crystallog & Cheminformat, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Matulis, DaumantasVilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (författare)
  • Vilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Dept Biothermodynam & Drug Design, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania.Vilnius Univ, Inst Biotechnol, Life Sci Ctr, Sect Crystallog & Cheminformat, Sauletekio 7, LT-10257 Vilnius, Lithuania. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Database: OXFORD UNIV PRESS20231758-0463

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Database (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy