SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Dunlop Erin S.)
 

Sökning: WFRF:(Dunlop Erin S.) > Proteomic analysis ...

  • Carland, CorinneUniv Penn, Dept Med, Philadelphia, PA USA. (författare)

Proteomic analysis of 92 circulating proteins and their effects in cardiometabolic diseases

  • Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • BMC,2023
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-510119
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-510119URI
  • https://doi.org/10.1186/s12014-023-09421-0DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:153369781URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background: Human plasma contains a wide variety of circulating proteins. These proteins can be important clinical biomarkers in disease and also possible drug targets. Large scale genomics studies of circulating proteins can identify genetic variants that lead to relative protein abundance.Methods: We conducted a meta-analysis on genome-wide association studies of autosomal chromosomes in 22,997 individuals of primarily European ancestry across 12 cohorts to identify protein quantitative trait loci (pQTL) for 92 cardiometabolic associated plasma proteins.Results: We identified 503 (337 cis and 166 trans) conditionally independent pQTLs, including several novel variants not reported in the literature. We conducted a sex-stratified analysis and found that 118 (23.5%) of pQTLs demonstrated heterogeneity between sexes. The direction of effect was preserved but there were differences in effect size and significance. Additionally, we annotate trans-pQTLs with nearest genes and report plausible biological relationships. Using Mendelian randomization, we identified causal associations for 18 proteins across 19 phenotypes, of which 10 have additional genetic colocalization evidence. We highlight proteins associated with a constellation of cardiometabolic traits including angiopoietin-related protein 7 (ANGPTL7) and Semaphorin 3F (SEMA3F).Conclusion: Through large-scale analysis of protein quantitative trait loci, we provide a comprehensive overview of common variants associated with plasma proteins. We highlight possible biological relationships which may serve as a basis for further investigation into possible causal roles in cardiometabolic diseases.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Png, GraceHelmholtz Zent Munchen, Inst Translat Genom, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany. (författare)
  • Malarstig, AndersKarolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden.;Pfizer Worldwide Res Dev & Med, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Kho, Pik FangStanford Univ, Stanford Cardiovasc Inst, Dept Med, Div Cardiovasc Med,Sch Med, Palo Alto, CA 94305 USA. (författare)
  • Gustafsson, StefanUppsala universitet,Klinisk epidemiologi(Swepub:uu)stegu732 (författare)
  • Michaëlsson, Karl,1959-Uppsala universitet,Medicinsk epidemiologi(Swepub:uu)karlmich (författare)
  • Lind, LarsUppsala universitet,Klinisk epidemiologi(Swepub:uu)larslind (författare)
  • Tsafantakis, EmmanouilAnogia Med Ctr, Anogia, Greece. (författare)
  • Karaleftheri, MariaEchinos Med Ctr, Echinos, Greece. (författare)
  • Dedoussis, GeorgeHarokopio Univ Athens, Sch Hlth Sci & Educ, Dept Nutr & Dietet, Athens, Greece. Univ Geneva, Fac Med, Med Sch, Dept Genet Med & Dev, Geneva, Switzerland. Univ Edinburgh, Usher Inst, Ctr Global Hlth Res, Edinburgh, Scotland. Univ Edinburgh, Inst Genet & Mol Med, MRC Human Genet Unit, Edinburgh, Scotland. Karolinska Inst, Cardiovasc Med, Med, Stockholm, Sweden. Univ Cambridge, MRC Epidemiol Unit, Cambridge, England. Cornell Med Qatar Res, Bioinformat Core, Doha, Qatar. Tech Univ Munich TUM, TUM Sch Med, Munich, Germany. (författare)
  • Ramisch, Anna (författare)
  • Macdonald-Dunlop, Erin (författare)
  • Klaric, Lucija K. (författare)
  • Joshi, Peter (författare)
  • Chen, Yan M.Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Bjoerck, HannaKarolinska Institutet (författare)
  • Eriksson, PerKarolinska Institutet (författare)
  • Carrasco-Zanini, Julia (författare)
  • Wheeler, Eleanor (författare)
  • Suhre, Karsten (författare)
  • Gilly, ArthurHelmholtz Zent Munchen, Inst Translat Genom, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany. (författare)
  • Zeggini, EleftheriaHelmholtz Zent Munchen, Inst Translat Genom, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany.;Klinikum Rechts Der Isar, TUM Sch Med, Munich, Germany. Univ Newcastle, Biosci Inst, Fac Med Sci, Newcastle, England. Charite Univ Med Berlin, Berlin Inst Hlth, Computat Med, Berlin, Germany. Queen Mary Univ London, Precis Healthcare Univ Res Inst, London, England. Weill Cornell Med Qatar, Prote Core, Res, Doha, Qatar. (författare)
  • Vinuela, Ana T. (författare)
  • Dermitzakis, Emmanouil F. (författare)
  • Wilson, James (författare)
  • Langenberg, Claudia (författare)
  • Thareja, Gaurav (författare)
  • Halama, Anna (författare)
  • Schmidt, Frank (författare)
  • Zanetti, DanielaStanford Univ, Stanford Cardiovasc Inst, Dept Med, Div Cardiovasc Med,Sch Med, Palo Alto, CA 94305 USA. (författare)
  • Assimes, ThemistoclesStanford Univ, Stanford Cardiovasc Inst, Dept Med, Div Cardiovasc Med,Sch Med, Palo Alto, CA 94305 USA. (författare)
  • Consortium, S C A L L O P (författare)
  • Univ Penn, Dept Med, Philadelphia, PA USA.Helmholtz Zent Munchen, Inst Translat Genom, German Res Ctr Environm Hlth, Neuherberg, Germany. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Clinical Proteomics: BMC20:11542-64161559-0275

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy