Rapid gene content turnover on the germline-restricted chromosome in songbirds

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-510143" > Rapid gene content ...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Schlebusch, Stephen A.Charles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic. (författare)

Rapid gene content turnover on the germline-restricted chromosome in songbirds

Artikel/kapitelEngelska2023

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Springer Nature,2023
electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-510143
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-510143URI
https://doi.org/10.1038/s41467-023-40308-8DOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Songbirds have an extra chromosome with unknown function found only in their germline. This study assembles and compares this chromosome in two closely related nightingale species, finding large differences in genetic content and only one conserved gene with probable essential function. The germline-restricted chromosome (GRC) of songbirds represents a taxonomically widespread example of programmed DNA elimination. Despite its apparent indispensability, we still know very little about the GRC's genetic composition, function, and evolutionary significance. Here we assemble the GRC in two closely related species, the common and thrush nightingale. In total we identify 192 genes across the two GRCs, with many of them present in multiple copies. Interestingly, the GRC appears to be under little selective pressure, with the genetic content differing dramatically between the two species and many GRC genes appearing to be pseudogenized fragments. Only one gene, cpeb1, has a complete coding region in all examined individuals of the two species and shows no copy number variation. The acquisition of this gene by the GRC corresponds with the earliest estimates of the GRC origin, making it a good candidate for the functional indispensability of the GRC in songbirds.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi Evolutionsbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Evolutionary Biology hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Ridl, JakubCharles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic.;Czech Acad Sci, Inst Mol Genet, Prague, Czech Republic. (författare)
Poignet, ManonCharles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic. (författare)
Ruiz-Ruano, Francisco J.Uppsala universitet,Systematisk biologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Univ East Anglia, Sch Biol Sci, Norwich, England.;Univ Bonn, Inst Evolutionary Biol & Ecol, An Immenburg 1, D-53121 Bonn, Germany.;Leibniz Inst Anal Biodivers Change, Ctr Mol Biodivers Res, Adenauerallee 127, D-53113 Bonn, Germany.(Swepub:uu)fraru543 (författare)
Reif, JiriCharles Univ Prague, Inst Environm Studies, Fac Sci, Prague, Czech Republic.;Palacky Univ, Fac Sci, Dept Zool, Olomouc, Czech Republic. (författare)
Pajer, PetrMil Hlth Inst, Mil Med Agcy, Tychonova 1, San Antonio 16001, Czech Republic. (författare)
Paces, JanCzech Acad Sci, Inst Mol Genet, Prague, Czech Republic. (författare)
Albrecht, TomasCharles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic.;Czech Acad Sci, Inst Vertebrate Biol, Brno, Czech Republic. (författare)
Suh, AlexanderUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Systematisk biologi,Univ East Anglia, Sch Biol Sci, Norwich, England.;Leibniz Inst Anal Biodivers Change, Ctr Mol Biodivers Res, Adenauerallee 127, D-53113 Bonn, Germany.(Swepub:uu)alesu519 (författare)
Reifova, RadkaCharles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic. (författare)
Charles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic.Charles Univ Prague, Fac Sci, Dept Zool, Prague, Czech Republic.;Czech Acad Sci, Inst Mol Genet, Prague, Czech Republic. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Nature Communications: Springer Nature14:12041-1723

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Nature Communications (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Schlebusch, Step ...; Ridl, Jakub; Poignet, Manon; Ruiz-Ruano, Fran ...; Reif, Jiri; Pajer, Petr; visa fler...; Paces, Jan; Albrecht, Tomas; Suh, Alexander; Reifova, Radka; visa färre...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Evolutionsbiolog ...

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi; och Genetik

Artiklar i publikationen: Nature Communica ...

Av lärosätet: Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se