SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Unge T)
 

Sökning: WFRF:(Unge T) > Structures of Mycob...

  • Henriksson, Lena M.Uppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi (författare)

Structures of Mycobacterium tuberculosis 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase provide new insights into catalysis

  • Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2007
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-96293
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-96293URI
  • https://doi.org/10.1074/jbc.M701935200DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Isopentenyl diphosphate is the precursor of various isoprenoids that are essential to all living organisms. It is produced by the mevalonate pathway in humans but by an alternate route in plants, protozoa, and many bacteria. 1-Deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase catalyzes the second step of this non-mevalonate pathway, which involves an NADPH-dependent rearrangement and reduction of 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate to form 2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate. The use of different pathways, combined with the reported essentiality of the enzyme makes the reductoisomerase a highly promising target for drug design. Here we present several high resolution structures of the Mycobacterium tuberculosis 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase, representing both wild type and mutant enzyme in various complexes with Mn2+, NADPH, and the known inhibitor fosmidomycin. The asymmetric unit corresponds to the biological homodimer. Although crystal contacts stabilize an open active site in the B molecule, the A molecule displays a closed conformation, with some differences depending on the ligands bound. An inhibition study with fosmidomycin resulted in an estimated IC50 value of 80 nM. The double mutant enzyme (D151N/E222Q) has lost its ability to bind the metal and, thereby, also its activity. Our structural information complemented with molecular dynamics simulations and free energy calculations provides the framework for the design of new inhibitors and gives new insights into the reaction mechanism. The conformation of fosmidomycin bound to the metal ion is different from that reported in a previously published structure and indicates that a rearrangement of the intermediate is not required during catalysis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Unge, TorstenUppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi(Swepub:uu)torsunge (författare)
  • Carlsson, JensUppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi(Swepub:uu)jecar425 (författare)
  • Åqvist, JohanUppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi(Swepub:uu)johanaq (författare)
  • Mowbray, Sherry L. (författare)
  • Jones, T. AlwynUppsala universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi(Swepub:uu)alwyjone (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för cell- och molekylärbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Biological Chemistry282:27, s. 19905-199160021-92581083-351X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy