More on contamination: The use of asymmetric molecular behavior to identify authentic ancient human DNA

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: WFRF:(Svensson Emma M. 1979 ) > (2007-2009) > More on contaminati...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Malmström, HelenaLinköpings universitet,Uppsala universitet,Evolutionsbiologi,Ancient DNA,Hälsouniversitetet,Institutionen för molekylär och klinisk medicin (författare)

More on contamination : The use of asymmetric molecular behavior to identify authentic ancient human DNA

Artikel/kapitelEngelska2007

Förlag, utgivningsår, omfång ...

2007-01-30
Oxford University Press (OUP),2007
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-96065
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-96065URI
https://doi.org/10.1093/molbev/msm015DOI
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-45961URI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Authentication of ancient human DNA results is an exceedingly difficult challenge due to the presence of modern contaminant DNA sequences. Nevertheless, the field of ancient human genetics generates huge scientific and public interest, and thus researchers are rarely discouraged by problems concerning the authenticity of such data. Although several methods have been developed to the purpose of authenticating ancient DNA (aDNA) results, while they are useful in faunal research, most of the methods have proven complicated to apply to ancient human DNA. Here, we investigate in detail the reliability of one of the proposed criteria, that of appropriate molecular behavior. Using real-time polymerase chain reaction (PCR) and pyrosequencing, we have quantified the relative levels of authentic aDNA and contaminant human DNA sequences recovered from archaeological dog and cattle remains. In doing so, we also produce data that describes the efficiency of bleach incubation of bone powder and its relative detrimental effects on contaminant and authentic ancient DNA. We note that bleach treatment is significantly more detrimental to contaminant than to authentic aDNA in the bleached bone powder. Furthermore, we find that there is a substantial increase in the relative proportions of authentic DNA to contaminant DNA as the PCR target fragment size is decreased. We therefore conclude that the degradation pattern in aDNA provides a quantifiable difference between authentic aDNA and modern contamination. This asymmetrical behavior of authentic and contaminant DNA can be used to identify authentic haplotypes in human aDNA studies.

Ämnesord och genrebeteckningar

NATURVETENSKAP Biologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences hsv//eng
contamination
ancient DNA
authentication
Biology
Biologi
MEDICINE

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

Svensson, Emma M.,1979-Uppsala universitet,Evolutionsbiologi,Ancient DNA(Swepub:uu)emsve020 (författare)
Gilbert, M. Thomas P. (författare)
Willerslev, Eske (författare)
Götherström, AndersUppsala universitet,Evolutionsbiologi,Ancient DNA(Swepub:uu)angot030 (författare)
Holmlund, Gunilla (författare)
Uppsala universitetEvolutionsbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Molecular biology and evolution: Oxford University Press (OUP)24:4, s. 998-10040737-40381537-1719

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Molecular biology and evolution (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Malmström, Helen ...; Svensson, Emma M ...; Gilbert, M. Thom ...; Willerslev, Eske; Götherström, And ...; Holmlund, Gunill ...

Om ämnet

NATURVETENSKAP: NATURVETENSKAP; och Biologi

Artiklar i publikationen: Molecular biolog ...

Av lärosätet: Uppsala universitet; Linköpings universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se