SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-97942"
 

Sökning: id:"swepub:oai:DiVA.org:uu-97942" > A Gene-Based Geneti...

  • Backström, NiclasUppsala universitet,Evolutionsbiologi (författare)

A Gene-Based Genetic Linkage Map of the Collared Flycatcher (Ficedula albicollis) Reveals Extensive Synteny and Gene-Order Conservation During 100 Million Years of Avian Evolution

  • Artikel/kapitelEngelska2008

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2008-07-01
  • Oxford University Press (OUP),2008
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-97942
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-97942URI
  • https://doi.org/10.1534/genetics.108.088195DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • By taking advantage of a recently developed reference markerset for avian genome analysis we have constructed a gene-basedgenetic map of the collared flycatcher, an important "ecologicalmodel" for studies of life-history evolution, sexual selection,speciation, and quantitative genetics. A pedigree of 322 birdsfrom a natural population was genotyped for 384 single nucleotidepolymorphisms (SNPs) from 170 protein-coding genes and 71 microsatellites.Altogether, 147 gene markers and 64 microsatellites form 33linkage groups with a total genetic distance of 1787 cM. Malerecombination rates are, on average, 22% higher than femalerates (total distance 1982 vs. 1627 cM). The ability to anchorthe collared flycatcher map with the chicken genome via thegene-based SNPs revealed an extraordinary degree of both syntenyand gene-order conservation during avian evolution. The greatmajority of chicken chromosomes correspond to a single linkagegroup in collared flycatchers, with only a few cases of inter-and intrachromosomal rearrangements. The rate of chromosomaldiversification, fissions/fusions, and inversions combined isthus considerably lower in birds (0.05/MY) than in mammals (0.6–2.0/MY).A dearth of repeat elements, known to promote chromosomal breakage,in avian genomes may contribute to their stability. The degreeof genome stability is likely to have important consequencesfor general evolutionary patterns and may explain, for example,the comparatively slow rate by which genetic incompatibilityamong lineages of birds evolves.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Karaiskou, Nikoletta (författare)
  • Leder, Erica H. (författare)
  • Gustafsson, LarsUppsala universitet,Zooekologi(Swepub:uu)larsgust (författare)
  • Primmer, Craig R. (författare)
  • Qvarnström, AnnaUppsala universitet,Institutionen för evolution, genomik och systematik,Zooekologi(Swepub:uu)annaqvar (författare)
  • Ellegren, HansUppsala universitet,Evolutionsbiologi(Swepub:uu)hanselle (författare)
  • Uppsala universitetEvolutionsbiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genetics: Oxford University Press (OUP)179, s. 1479-14950016-67311943-2631

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Genetics (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy