SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Jonmundsson Gudmundur)
 

Sökning: WFRF:(Jonmundsson Gudmundur) > Allele-specific gen...

  • Milani, LiliUppsala universitet,Molekylär medicin (författare)

Allele-specific gene expression patterns in primary leukemic cells reveal regulation of gene expression by CpG site methylation

  • Artikel/kapitelEngelska2009

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2008-11-07
  • Cold Spring Harbor Laboratory,2009
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-98392
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-98392URI
  • https://doi.org/10.1101/gr.083931.108DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • To identify genes that are regulated by cis-acting functional elements in acute lymphoblastic leukemia (ALL) we determined the allele-specific expression (ASE) levels of 2, 529 genes by genotyping a genome-wide panel of single nucleotide polymorphisms in RNA and DNA from bone marrow and blood samples of 197 children with ALL. Using a reproducible, quantitative genotyping method and stringent criteria for scoring ASE, we found that 16% of the analyzed genes display ASE in multiple ALL cell samples. For most of the genes, the level of ASE varied largely between the samples, from 1.4-fold overexpression of one allele to apparent monoallelic expression. For genes exhibiting ASE, 55% displayed bidirectional ASE in which overexpression of either of the two SNP alleles occurred. For bidirectional ASE we also observed overall higher levels of ASE and correlation with the methylation level of these sites. Our results demonstrate that CpG site methylation is one of the factors that regulates gene expression in ALL cells.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Lundmark, AndersUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)andlu294 (författare)
  • Nordlund, JessicaUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)jesno775 (författare)
  • Kiialainen, AnnaUppsala universitet,Molekylär medicin (författare)
  • Flaegstad, Trond (författare)
  • Jonmundsson, Gudmundur (författare)
  • Kanerva, Jukka (författare)
  • Schmiegelow, Kjeld (författare)
  • Gunderson, Kevin L. (författare)
  • Lönnerholm, GudmarUppsala universitet,Pediatrik(Swepub:uu)gudmarlh (författare)
  • Syvänen, Ann-ChristineUppsala universitet,Molekylär medicin(Swepub:uu)anncsyva (författare)
  • Uppsala universitetMolekylär medicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Research: Cold Spring Harbor Laboratory19:1, s. 1-111088-90511549-5469

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy