Systematic exploration of essential yeast gene function with temperature-sensitive mutants.

Conditional temperature-sensitive (ts) mutations are valuable reagents for studying essential genes in the yeast Saccharomyces cerevisiae. We constructed 787 ts strains, covering 497 (∼45%) of the 1,101 essential yeast genes, with ∼30% of the genes represented by multiple alleles. All of the alleles are integrated into their native genomic locus in the S288C common reference strain and are linked to a kanMX selectable marker, allowing further genetic manipulation by synthetic genetic array (SGA)-based, high-throughput methods. We show two such manipulations: barcoding of 440 strains, which enables chemical-genetic suppression analysis, and the construction of arrays of strains carrying different fluorescent markers of subcellular structure, which enables quantitative analysis of phenotypes using high-content screening. Quantitative analysis of a GFP-tubulin marker identified roles for cohesin and condensin genes in spindle disassembly. This mutant collection should facilitate a wide range of systematic studies aimed at understanding the functions of essential genes.

NATURVETENSKAP Biologi Genetik hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Genetics hsv//eng
NATURVETENSKAP Biologi Biokemi och molekylärbiologi hsv//swe
NATURAL SCIENCES Biological Sciences Biochemistry and Molecular Biology hsv//eng
Alleles
Databases
Genetic
Genes
Essential
Genes
Fungal
Genes
Lethal
Genetic Engineering
methods
Genetic Loci
Genome
Fungal
Mass Spectrometry
methods
Microarray Analysis
methods
Microscopy
Confocal
Mutation
Phenotype
Plasmids
RNA
Messenger
Saccharomyces cerevisiae
genetics
growth & development
Single-Cell Analysis
Temperature
Tubulin
analysis

Vizeacoumar, Franco J (författare)
Bahr, Sondra (författare)
Li, Jingjing (författare)
Warringer, Jonas,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi,Department of Cell and Molecular Biology(Swepub:gu)xwarrj (författare)
Vizeacoumar, Frederick S (författare)
Min, Renqiang (författare)
Vandersluis, Benjamin (författare)
Bellay, Jeremy (författare)
Devit, Michael (författare)
Fleming, James A (författare)
Stephens, Andrew (författare)
Haase, Julian (författare)
Lin, Zhen-Yuan (författare)
Baryshnikova, Anastasia (författare)
Lu, Hong (författare)
Yan, Zhun (författare)
Jin, Ke (författare)
Barker, Sarah (författare)
Datti, Alessandro (författare)
Giaever, Guri (författare)
Nislow, Corey (författare)
Bulawa, Chris (författare)
Myers, Chad L (författare)
Costanzo, Michael (författare)
Gingras, Anne-Claude (författare)
Zhang, Zhaolei (författare)
Blomberg, Anders,1956Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för cell- och molekylärbiologi,Department of Cell and Molecular Biology(Swepub:gu)xbloan (författare)
Bloom, Kerry (författare)
Andrews, Brenda (författare)
Boone, Charles (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för cell- och molekylärbiologi (creator_code:org_t)

Ingår i:Nature biotechnology: Springer Science and Business Media LLC29:4, s. 361-71546-16961087-0156

Om ämnet

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.