SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Andersson Pernilla)
 

Sökning: WFRF:(Andersson Pernilla) > Distinct cytoplasmi...

  • Jauhiainen, Alexandra,1981Karolinska Institutet (författare)

Distinct cytoplasmic and nuclear functions of the stress induced protein DDIT3/CHOP/GADD153

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2012-04-09
  • Public Library of Science (PLoS),2012
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/164512
  • https://gup.ub.gu.se/publication/164512URI
  • https://doi.org/10.1371/journal.pone.0033208DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/164512URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:124736562URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • DDIT3, also known as GADD153 or CHOP, encodes a basic leucine zipper transcription factor of the dimer forming C/EBP family. DDIT3 is known as a key regulator of cellular stress response, but its target genes and functions are not well characterized. Here, we applied a genome wide microarray based expression analysis to identify DDIT3 target genes and functions. By analyzing cells carrying tamoxifen inducible DDIT3 expression constructs we show distinct gene expression profiles for cells with cytoplasmic and nuclear localized DDIT3. Of 175 target genes identified only 3 were regulated by DDIT3 in both cellular localizations. More than two thirds of the genes were downregulated, supporting a role for DDIT3 as a dominant negative factor that could act by either cytoplasmic or nuclear sequestration of dimer forming transcription factor partners. Functional annotation of target genes showed cell migration, proliferation and apoptosis/survival as the most affected categories. Cytoplasmic DDIT3 affected more migration associated genes, while nuclear DDIT3 regulated more cell cycle controlling genes. Cell culture experiments confirmed that cytoplasmic DDIT3 inhibited migration, while nuclear DDIT3 caused a G1 cell cycle arrest. Promoters of target genes showed no common sequence motifs, reflecting that DDIT3 forms heterodimers with several alternative transcription factors that bind to different motifs. We conclude that expression of cytoplasmic DDIT3 regulated 94 genes. Nuclear translocation of DDIT3 regulated 81 additional genes linked to functions already affected by cytoplasmic DDIT3. Characterization of DDIT3 regulated functions helps understanding its role in stress response and involvement in cancer and degenerative disorders.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Thomsen, ChristerGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xtchrc (författare)
  • Strömbom, LindaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg (författare)
  • Grundevik, PernillaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg (författare)
  • Andersson, Carola,1972Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xacarx (författare)
  • Danielsson, Anna,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för onkologi,Institute of Clinical Sciences, Department of Oncology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xdanne (författare)
  • Andersson, Mattias K,1979Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xamatx (författare)
  • Nerman, Olle,1951Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)nerman (författare)
  • Rörkvist, LindaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg (författare)
  • Ståhlberg, Anders,1975Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg(Swepub:cth)xsandw (författare)
  • Åman, Pierre,1953Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi,Institute of Biomedicine, Department of Pathology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xamapi (författare)
  • Karolinska InstitutetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:PLoS ONE: Public Library of Science (PLoS)7:41932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy