SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/173879"
 

Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/173879" > Distinct transcript...

  • Kanduri, Meena,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine (författare)

Distinct transcriptional control in major immunogenetic subsets of chronic lymphocytic leukemia exhibiting subset-biased global DNA methylation profiles.

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Informa UK Limited,2012

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/173879
  • https://gup.ub.gu.se/publication/173879URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-191071URI
  • https://doi.org/10.4161/epi.22901DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/3372412URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Chronic lymphocytic leukemia (CLL) can be divided into prognostic subgroups based on the IGHV gene mutational status, and is further characterized by multiple subsets of cases with quasi-identical or stereotyped B cell receptors that also share clinical and biological features. We recently reported differential DNA methylation profiles in IGHV-mutated and IGHV-unmutated CLL subgroups. For the first time, we here explore the global methylation profiles of stereotyped subsets with different prognosis, by applying high-resolution methylation arrays on CLL samples from three major stereotyped subsets: the poor-prognostic subsets #1 (n = 15) and #2 (n = 9) and the favorable-prognostic subset #4 (n = 15). Overall, the three subsets exhibited significantly different methylation profiles, which only partially overlapped with those observed in our previous study according to IGHV gene mutational status. Specifically, gene ontology analysis of the differentially methylated genes revealed a clear enrichment of genes involved in immune response, such as B cell activation (e.g., CD80, CD86 and IL10), with higher methylation levels in subset #1 than subsets #2 and #4. Accordingly, higher expression of the co-stimulatory molecules CD80 and CD86 was demonstrated in subset #4 vs. subset #1, pointing to a key role for these molecules in the crosstalk of CLL subset #4 cells with the microenvironment. In summary, investigation of three prototypic, stereotyped CLL subsets revealed distinct DNA methylation profiles for each subset, which suggests subset-biased patterns of transcriptional control and highlights a key role for epigenetics during leukemogenesis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Marincevic, MillarayUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi (författare)
  • Halldórsdóttir, Anna M. (författare)
  • Mansouri, LarryUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Hematologi och immunologi(Swepub:uu)maman377 (författare)
  • Junevik, Katarina,1965 (författare)
  • Ntoufa, Stavroula (författare)
  • Kultima, Hanna GöranssonUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)hagor102 (författare)
  • Isaksson, AndersUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)andeisak (författare)
  • Juliusson, GunnarLund University,Lunds universitet,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)stem-gju (författare)
  • Andersson, Per-Ola,1964 (författare)
  • Ehrencrona, HansLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-hen (författare)
  • Stamatopoulos, Kostas (författare)
  • Rosenquist Brandell, RichardUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)richrose (författare)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Epigenetics: Informa UK Limited7:12, s. 1435-421559-22941559-2308

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy