Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/173879" >
Distinct transcript...
-
Kanduri, Meena,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine
(författare)
Distinct transcriptional control in major immunogenetic subsets of chronic lymphocytic leukemia exhibiting subset-biased global DNA methylation profiles.
- Artikel/kapitelEngelska2012
Förlag, utgivningsår, omfång ...
Nummerbeteckningar
-
LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/173879
-
https://gup.ub.gu.se/publication/173879URI
-
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-191071URI
-
https://doi.org/10.4161/epi.22901DOI
-
https://lup.lub.lu.se/record/3372412URI
Kompletterande språkuppgifter
Ingår i deldatabas
Klassifikation
-
Ämneskategori:ref swepub-contenttype
-
Ämneskategori:art swepub-publicationtype
Anmärkningar
-
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) can be divided into prognostic subgroups based on the IGHV gene mutational status, and is further characterized by multiple subsets of cases with quasi-identical or stereotyped B cell receptors that also share clinical and biological features. We recently reported differential DNA methylation profiles in IGHV-mutated and IGHV-unmutated CLL subgroups. For the first time, we here explore the global methylation profiles of stereotyped subsets with different prognosis, by applying high-resolution methylation arrays on CLL samples from three major stereotyped subsets: the poor-prognostic subsets #1 (n = 15) and #2 (n = 9) and the favorable-prognostic subset #4 (n = 15). Overall, the three subsets exhibited significantly different methylation profiles, which only partially overlapped with those observed in our previous study according to IGHV gene mutational status. Specifically, gene ontology analysis of the differentially methylated genes revealed a clear enrichment of genes involved in immune response, such as B cell activation (e.g., CD80, CD86 and IL10), with higher methylation levels in subset #1 than subsets #2 and #4. Accordingly, higher expression of the co-stimulatory molecules CD80 and CD86 was demonstrated in subset #4 vs. subset #1, pointing to a key role for these molecules in the crosstalk of CLL subset #4 cells with the microenvironment. In summary, investigation of three prototypic, stereotyped CLL subsets revealed distinct DNA methylation profiles for each subset, which suggests subset-biased patterns of transcriptional control and highlights a key role for epigenetics during leukemogenesis.
Ämnesord och genrebeteckningar
Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)
-
Marincevic, MillarayUppsala universitet,Institutionen för immunologi, genetik och patologi
(författare)
-
Halldórsdóttir, Anna M.
(författare)
-
Mansouri, LarryUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Hematologi och immunologi(Swepub:uu)maman377
(författare)
-
Junevik, Katarina,1965
(författare)
-
Ntoufa, Stavroula
(författare)
-
Kultima, Hanna GöranssonUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)hagor102
(författare)
-
Isaksson, AndersUppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin(Swepub:uu)andeisak
(författare)
-
Juliusson, GunnarLund University,Lunds universitet,Stamcellscentrum (SCC),Avdelningen för stamcellsforskning,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Stem Cell Center,Division of stem cell research,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)stem-gju
(författare)
-
Andersson, Per-Ola,1964
(författare)
-
Ehrencrona, HansLund University,Lunds universitet,Avdelningen för klinisk genetik,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Clinical Genetics,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)med-hen
(författare)
-
Stamatopoulos, Kostas
(författare)
-
Rosenquist Brandell, RichardUppsala universitet,Hematologi och immunologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)richrose
(författare)
-
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin
(creator_code:org_t)
Sammanhörande titlar
-
Ingår i:Epigenetics: Informa UK Limited7:12, s. 1435-421559-22941559-2308
Internetlänk
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Kanduri, Meena, ...
-
Marincevic, Mill ...
-
Halldórsdóttir, ...
-
Mansouri, Larry
-
Junevik, Katarin ...
-
Ntoufa, Stavroul ...
-
visa fler...
-
Kultima, Hanna G ...
-
Isaksson, Anders
-
Juliusson, Gunna ...
-
Andersson, Per-O ...
-
Ehrencrona, Hans
-
Stamatopoulos, K ...
-
Rosenquist Brand ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Genetik
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Klinisk medicin
-
och Hematologi
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Biokemi och mole ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Cell och molekyl ...
-
- MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
-
MEDICIN OCH HÄLS ...
-
och Medicinska och f ...
-
och Medicinsk geneti ...
- Artiklar i publikationen
-
Epigenetics
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Uppsala universitet
-
Lunds universitet