SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

(WFRF:(Andrén Per E.)) pers:(Welinder Charlotte)
 

Sökning: (WFRF:(Andrén Per E.)) pers:(Welinder Charlotte) > (2013) > Chromosome 19 Annot...

  • Nilsson, C. L. (författare)

Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: A First Report from the Global Research Consortium

  • Artikel/kapitelEngelska2013

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2012-12-18
  • American Chemical Society (ACS),2013

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/174480
  • https://gup.ub.gu.se/publication/174480URI
  • https://doi.org/10.1021/pr3008607DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/3172684URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:kth:diva-119068URI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-196085URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • QC 20130305
  • A first research development progress report of the Chromosome 19 Consortium with members from Sweden, Norway, Spain, United States, China and India, a part of the Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) global initiative, is presented (http://www.c-hpp.org). From the chromosome 19 peptide-targeted library constituting 6159 peptides, a pilot study was conducted using a subset with 125 isotope-labeled peptides. We applied an annotation strategy with triple quadrupole, ESI-Qtrap, and MALDI mass spectrometry platforms, comparing the quality of data within and in between these instrumental set-ups. LC–MS conditions were outlined by multiplex assay developments, followed by MRM assay developments. SRM was applied to biobank samples, quantifying kallikrein 3 (prostate specific antigen) in plasma from prostate cancer patients. The antibody production has been initiated for more than 1200 genes from the entire chromosome 19, and the progress developments are presented. We developed a dedicated transcript microarray to serve as the mRNA identifier by screening cancer cell lines. NAPPA protein arrays were built to align with the transcript data with the Chromosome 19 NAPPA chip, dedicated to 90 proteins, as the first development delivery. We have introduced an IT-infrastructure utilizing a LIMS system that serves as the key interface for the research teams to share and explore data generated within the project. The cross-site data repository will form the basis for sample processing, including biological samples as well as patient samples from national Biobanks.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Berven, F. (författare)
  • Selheim, F. (författare)
  • Lindberg, HenrikLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-hkl (författare)
  • Moskal, J. R. (författare)
  • Kroes, R. A. (författare)
  • Sulman, E. P. (författare)
  • Conrad, C. A. (författare)
  • Lang, F. F. (författare)
  • Andren, Per E.Uppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap(Swepub:uu)perandre (författare)
  • Nilsson, AnnaUppsala universitet,Institutionen för farmaceutisk biovetenskap(Swepub:uu)annil134 (författare)
  • Carlsohn, ElisabetGothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Proteomics,Core Facilities, Proteomics(Swepub:gu)xcelia (författare)
  • Lilja, H. (författare)
  • Malm, JohanLund University,Lunds universitet,Klinisk kemi, Malmö,Forskargrupper vid Lunds universitet,Clinical Chemistry, Malmö,Lund University Research Groups(Swepub:lu)klke-jma (författare)
  • Fenyo, D. (författare)
  • Subramaniyam, D. (författare)
  • Wang, X. D. (författare)
  • Gonzales-Gonzales, M. (författare)
  • Dasilva, N. (författare)
  • Diez, P. (författare)
  • Fuentes, M. (författare)
  • Végvári, ÁkosLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-asv (författare)
  • Sjödin, KarinLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-ksj (författare)
  • Welinder, CharlotteLund University,Lunds universitet,Tumörmikromiljö,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumor microenvironment,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine(Swepub:lu)onk-cbr (författare)
  • Laurell, ThomasLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-tla (författare)
  • Fehniger, ThomasLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-tfr (författare)
  • Lindberg, H. (författare)
  • Rezeli, MelindaLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)elma-mrl (författare)
  • Edula, G. (författare)
  • Hober, SophiaKTH,Proteomik(Swepub:kth)u11qqzc1 (författare)
  • Marko-Varga, GyörgyLund University,Lunds universitet,Avdelningen för Biomedicinsk teknik,Institutionen för biomedicinsk teknik,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Department of Biomedical Engineering,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH(Swepub:lu)akem-gmv (författare)
  • Liu, Huiling (författare)
  • Avdelningen för Biomedicinsk teknikInstitutionen för biomedicinsk teknik (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Journal of Proteome Research: American Chemical Society (ACS)12:1, s. 134-1491535-38931535-3907

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy