Sökning: WFRF:(Björling Alexander) >
Deciphering solutio...
Deciphering solution scattering data with experimentally guided molecular dynamics simulations
-
- Björling, Alexander, 1983 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Niebling, Stephan (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
- Marcellini, M. (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräknings- och systembiologi
-
visa fler...
-
- van der Spoel, David (författare)
- Uppsala universitet,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Beräknings- och systembiologi
-
- Westenhoff, Sebastian, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2015-01-27
- 2015
- Engelska.
-
Ingår i: Journal of Chemical Theory and Computation. - : American Chemical Society (ACS). - 1549-9618 .- 1549-9626. ; 11:2, s. 780-787
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://uu.diva-port... (primary) (Raw object)
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://urn.kb.se/re...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Time-resolved X-ray solution scattering is an increasingly popular method to measure conformational changes in proteins. Extracting structural information from the resulting difference X-ray scattering data is a daunting task. We present a method in which the limited but precious information encoded in such scattering curves is combined with the chemical knowledge of molecular force fields. The molecule of interest is then refined toward experimental data using molecular dynamics simulation. Therefore, the energy landscape is biased toward conformations that agree with experimental data. We describe and verify the method, and we provide an implementation in GROMACS.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Kemi -- Teoretisk kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences -- Theoretical Chemistry (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Kemi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Chemical Sciences (hsv//eng)
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas