SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/217907"
 

Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/217907" > Site-specific progr...

  • Sommer, FelixGothenburg University,Göteborgs universitet,Wallenberglaboratoriet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberg Laboratory,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,University of Gothenburg (författare)

Site-specific programming of the host epithelial transcriptome by the gut microbiota

  • Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2015-03-28
  • Springer Science and Business Media LLC,2015
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/217907
  • https://gup.ub.gu.se/publication/217907URI
  • https://doi.org/10.1186/s13059-015-0614-4DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/217907URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Background: The intestinal epithelium separates us from the microbiota but also interacts with it and thus affects host immune status and physiology. Previous studies investigated microbiota-induced responses in the gut using intact tissues or unfractionated epithelial cells, thereby limiting conclusions about regional differences in the epithelium. Here, we sought to investigate microbiota-induced transcriptional responses in specific fractions of intestinal epithelial cells. To this end, we used microarray analysis of laser capture microdissection (LCM)-harvested ileal and colonic tip and crypt epithelial fractions from germ-free and conventionally raised mice and from mice during the time course of colonization. Results: We found that about 10% of the host's transcriptome was microbially regulated, mainly including genes annotated with functions in immunity, cell proliferation, and metabolism. The microbial impact on host gene expression was highly site specific, as epithelial responses to the microbiota differed between cell fractions. Specific transcriptional regulators were enriched in each fraction. In general, the gut microbiota induced a more rapid response in the colon than in the ileum. Conclusions: Our study indicates that the microbiota engage different regulatory networks to alter host gene expression in a particular niche. Understanding host-microbiota interactions on a cellular level may facilitate signaling pathways that contribute to health and disease and thus provide new therapeutic strategies. RAMS GD, 1963, LABORATORY INVESTIGATION, V12, P355

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Nookaew, Intawat,1977Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)intawat (författare)
  • Sommer, NinaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberglaboratoriet,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Wallenberg Laboratory,University of Gothenburg (författare)
  • Fogelstrand, Per,1971Gothenburg University,Göteborgs universitet,Wallenberglaboratoriet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberg Laboratory,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,University of Gothenburg(Swepub:gu)xfogpe (författare)
  • Bäckhed, Fredrik,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Wallenberglaboratoriet,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Wallenberg Laboratory,University of Gothenburg(Swepub:gu)xbafre (författare)
  • Göteborgs universitetWallenberglaboratoriet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Genome Biology: Springer Science and Business Media LLC161465-69061474-760X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy