SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/220337"
 

Sökning: id:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/220337" > Proteotyping: Prote...

  • Karlsson, R.Göteborgs universitet,University of Gothenburg (författare)

Proteotyping: Proteomic characterization, classification and identification of microorganisms - A prospectus

  • Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2015

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/220337
  • https://gup.ub.gu.se/publication/220337URI
  • https://doi.org/10.1016/j.syapm.2015.03.006DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/245904URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:for swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Modern microbial systematics requires a range of methodologies for the comprehensive characterization, classification and identification of microorganisms. While whole-genome sequences provide the ultimate reference for defining microbial phylogeny and taxonomy, selected biomarker-based strategies continue to provide the means for the bulk of microbial systematic studies. Proteomics, the study of the expression of genes, as well as the structure and function of the resulting proteins, offers indirect measures of genome sequence data. Recent developments in applications of proteomics for analyzing microorganisms have paralleled the growing microbial genome sequence database, as well as the evolution of mass spectrometry (MS) instrumentation and bioinformatics. MALDI-TOF MS, which generates proteomic mass patterns for 'fingerprint'-based characterizations, has provided a marked breakthrough for microbial identification. However, MALDI-TOF MS is limited in the number of targets that can be detected for strain characterization. Advanced methods of tandem mass spectrometry, in which proteins and peptides generated from proteins, are characterized and identified, using LC-MS/MS, provide the ability to detect hundreds or thousands of expressed microbial strain markers for high-resolution characterizations and identifications. Model studies demonstrate the application of proteomics-based analyses for bacterial species- and strain-level detection and identification and for characterization of environmentally relevant, metabolically diverse bacteria. Proteomics-based approaches represent an emerging complement to traditional methods of characterizing microorganisms, enabling the elucidation of the expressed biomarkers of genome sequence information, which can be applied to 'proteotyping' applications of microorganisms at all taxonomic levels. (C) 2015 Elsevier GmbH. All rights reserved.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Gonzales-Siles, LuciaGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg(Swepub:gu)xgonlu (författare)
  • Boulund, Fredrik,1985Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:gu)xboufr (författare)
  • Svensson-Stadler, Liselott,1971Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg(Swepub:gu)xslise (författare)
  • Skovbjerg, Susann,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg(Swepub:gu)xjsusm (författare)
  • Karlsson, A. (författare)
  • Davidson, M. (författare)
  • Hulth, Stefan,1965Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för kemi och molekylärbiologi,Department of Chemistry and Molecular Biology,University of Gothenburg(Swepub:gu)xhulst (författare)
  • Kristiansson, Erik,1978Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology(Swepub:cth)erikkr (författare)
  • Moore, Edward R.B.1954Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg(Swepub:gu)xmooed (författare)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Systematic and Applied Microbiology: Elsevier BV38:4, s. 246-2570723-2020

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy