Sökning: WFRF:(Bengtsson Palme Johan 1985) >
Strategies to impro...
Strategies to improve usability and preserve accuracy in biological sequence databases
-
- Bengtsson-Palme, Johan, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Boulund, Fredrik, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Institutionen för biomedicin,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,Institute of Biomedicine,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Edström, Robert, 1987 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
visa fler...
-
- Feizi, Amir, 1980 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Johnning, Anna, 1985 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Institutionen för biomedicin,Department of Mathematical Sciences,Institute of Biomedicine,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Jonsson, Viktor, 1987 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Department of Mathematical Sciences,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Karlsson, Fredrik, 1984 (författare)
- Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Pal, Chandan (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar,Institute of Biomedicine, Department of Infectious Medicine,University of Gothenburg
-
- Buongermino Pereira, Mariana, 1982 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Institutionen för biomedicin,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,Institute of Biomedicine,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Rehammar, Anna, 1978 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper, matematisk statistik,Department of Mathematical Sciences, Mathematical Statistics,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology
-
- Sánchez, José, 1979 (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för matematiska vetenskaper,Core Facilities, Bioinformatics,Department of Mathematical Sciences,Core Facilities, Bioinformatics,Chalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology,University of Gothenburg
-
- Sanli, Kemal (författare)
- Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences,University of Gothenburg
-
- Thorell, Kaisa, 1983 (författare)
- Karolinska Institutet
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2016-09-19
- 2016
- Engelska.
-
Ingår i: Proteomics. - : Wiley. - 1615-9853 .- 1615-9861. ; 16:18, s. 2454-2460
- Relaterad länk:
-
http://dx.doi.org/10...
-
visa fler...
-
https://gup.ub.gu.se...
-
https://doi.org/10.1...
-
https://research.cha...
-
http://kipublication...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- Biology is increasingly dependent on large-scale analysis, such as proteomics, creating a requirement for efficient bioinformatics. Bioinformatic predictions of biological functions rely upon correctly annotated database sequences, and the presence of inaccurately annotated or otherwise poorly described sequences introduces noise and bias to biological analyses. Accurate annotations are, for example, pivotal for correct identifications of polypeptide fragments. However, standards for how sequence databases are organized and presented are currently insufficient. Here, we propose five strategies to address fundamental issues in the annotation of sequence databases: (i) to clearly separate experimentally verified and unverified sequence entries; (ii) to enable a system for tracing the origins of annotations; (iii) to separate entries with high-quality, informative annotation from less useful ones; (iv) to integrate automated quality-control software whenever such tools exist; and (v) to facilitate post-submission editing of annotations and metadata associated with sequences. We believe that implementation of these strategies, for example as requirements for publication of database papers, would enable biology to better take advantage of large-scale data.
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Data- och informationsvetenskap -- Datavetenskap (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Computer and Information Sciences -- Computer Sciences (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
- NATURVETENSKAP -- Biologi -- Annan biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences -- Other Biological Topics (hsv//eng)
Nyckelord
- Annotation
- Databases
- Functional prediction
- Sequencing
- Standards
- Functional prediction
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Bengtsson-Palme, ...
-
Boulund, Fredrik ...
-
Edström, Robert, ...
-
Feizi, Amir, 198 ...
-
Johnning, Anna, ...
-
Jonsson, Viktor, ...
-
visa fler...
-
Karlsson, Fredri ...
-
Pal, Chandan
-
Buongermino Pere ...
-
Rehammar, Anna, ...
-
Sánchez, José, 1 ...
-
Sanli, Kemal
-
Thorell, Kaisa, ...
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Data och informa ...
-
och Datavetenskap
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Bioinformatik oc ...
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
-
och Annan biologi
- Artiklar i publikationen
-
Proteomics
- Av lärosätet
-
Göteborgs universitet
-
Chalmers tekniska högskola
-
Karolinska Institutet