SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Oxelman J.)
 

Sökning: WFRF:(Oxelman J.) > Toward a Self-Updat...

  • Antonelli, Alexandre,1978Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences (författare)

Toward a Self-Updating Platform for Estimating Rates of Speciation and Migration, Ages, and Relationships of Taxa.

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2016-09-10
  • Oxford University Press (OUP),2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/247438
  • https://gup.ub.gu.se/publication/247438URI
  • https://doi.org/10.1093/sysbio/syw066DOI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Rapidly growing biological data-including molecular sequences and fossils-hold an unprecedented potential to reveal how evolutionary processes generate and maintain biodiversity. However, researchers often have to develop their own idiosyncratic workflows to integrate and analyze these data for reconstructing time-calibrated phylogenies. In addition, divergence times estimated under different methods and assumptions, and based on data of various quality and reliability, should not be combined without proper correction. Here we introduce a modular framework termed SUPERSMART (Self-Updating Platform for Estimating Rates of Speciation and Migration, Ages, and Relationships of Taxa), and provide a proof of concept for dealing with the moving targets of evolutionary and biogeographical research. This framework assembles comprehensive data sets of molecular and fossil data for any taxa and infers dated phylogenies using robust species tree methods, also allowing for the inclusion of genomic data produced through next-generation sequencing techniques. We exemplify the application of our method by presenting phylogenetic and dating analyses for the mammal order Primates and for the plant family Arecaceae (palms). We believe that this framework will provide a valuable tool for a wide range of hypothesis-driven research questions in systematics, biogeography, and evolution. SUPERSMART will also accelerate the inference of a "Dated Tree of Life" where all node ages are directly comparable. [Bayesian phylogenetics; data mining; divide-and-conquer methods; GenBank; multilocus multispecies coalescent; next-generation sequencing; palms; primates; tree calibration.].

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Hettling, Hannes (författare)
  • Condamine, Fabien L.Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences (författare)
  • Vos, KarinGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences (författare)
  • Nilsson, R. Henrik,1976Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xnihen (författare)
  • Sanderson, Michael J (författare)
  • Sauquet, Hervé (författare)
  • Scharn, RuudGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xschru (författare)
  • Silvestro, DanieleGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xsilda (författare)
  • Töpel, Mats H.,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för marina vetenskaper,Department of marine sciences(Swepub:gu)xamatl (författare)
  • Bacon, Christine D.Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xbacoc (författare)
  • Oxelman, Bengt,1958Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biologi och miljövetenskap,Department of Biological and Environmental Sciences(Swepub:gu)xoxebe (författare)
  • Vos, Rutger A (författare)
  • Göteborgs universitetInstitutionen för biologi och miljövetenskap (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Systematic biology: Oxford University Press (OUP)66:2, s. 152-1661076-836X1063-5157

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy