Minimal residual disease monitoring in childhood B lymphoblastic leukemia with t(12;21)(p13;q22); ETV6-RUNX1: concordant results using quantitation of fusion transcript and flow cytometry.

Alm, Sofie J.,1988Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine (författare)

The translocation t(12;21)(p13;q22) resulting in the fusion gene ETV6-RUNX1, is the most frequent gene fusion in childhood B lymphoblastic leukemia. In the Nordic Society of Paediatric Haematology and Oncology ALL-2008 treatment protocol, treatment stratification in B-lineage ALL is based on results of minimal residual disease (MRD) analysis with fluorescence-activated cell sorting (FACS). In this study, we determined whether RT-qPCR of the ETV6-RUNX1 fusion transcript can be a reliable alternative for MRD analysis.Seventy-eight bone marrow samples from 29 children at diagnosis and day 15, 29, and 78 during treatment were analyzed for MRD with FACS and with quantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-qPCR). Fusion transcript MRD was defined as the ETV6-RUNX1/GUSB ratio at the follow-up time point (day 15/29/78) divided with the ETV6-RUNX1/GUSB ratio at diagnosis (%).MRD analysis with FACS and with RT-qPCR of ETV6-RUNX1 fusion transcript showed strong correlation. All cases showed concordant results at the treatment stratifying time points day 29 and day 78, when comparing the two methods with a cutoff set to 0.1%.RT-qPCR is a valuable addition and could also be an alternative to FACS in cases where FACS is not achievable for MRD analysis.

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Hematologi hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Hematology hsv//eng
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Klinisk medicin Klinisk laboratoriemedicin hsv//swe
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES Clinical Medicine Clinical Laboratory Medicine hsv//eng
Adolescent
Child
Child
Preschool
Chromosomes
Human
Pair 12
Chromosomes
Human
Pair 21
Core Binding Factor Alpha 2 Subunit
genetics
Flow Cytometry
standards
Humans
Neoplasm
Residual
diagnosis
genetics
Oncogene Proteins
Fusion
genetics
Precursor B-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma
diagnosis
genetics
RNA
Neoplasm
analysis
Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction
standards
Translocation
Genetic

Engvall, C (författare)
Asp, Julia,1973Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine(Swepub:gu)xaspjd (författare)
Palmqvist, Lars,1965Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine(Swepub:gu)xpalla (författare)
Abrahamsson, Jonas,1954 (författare)
Fogelstrand, Linda,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin,Institute of Biomedicine, Department of Clinical Chemistry and Transfusion Medicine(Swepub:gu)xsvlin (författare)
Göteborgs universitetInstitutionen för biomedicin, avdelningen för klinisk kemi och transfusionsmedicin (creator_code:org_t)

Ingår i:International journal of laboratory hematology: Wiley39:2, s. 121-1281751-553X1751-5521

Av författaren/redakt...: Alm, Sofie J., 1 ...; Engvall, C; Asp, Julia, 1973; Palmqvist, Lars, ...; Abrahamsson, Jon ...; Fogelstrand, Lin ...

Om ämnet

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Hematologi

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP: MEDICIN OCH HÄLS ...; och Klinisk medicin; och Klinisk laborato ...

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.