SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

(AMNE:(MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper)) hsvcat:3 pers:(Ohlsson Claes 1965) pers:(Rivadeneira F)
 

Sökning: (AMNE:(MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper)) hsvcat:3 pers:(Ohlsson Claes 1965) pers:(Rivadeneira F) > Low-Frequency Synon...

  • Manousaki, D.McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 1B1, Canada.;McGill Univ, Jewish Gen Hosp, Lady Davis Inst Med Res, Montreal, PQ H3T 1E2, Canada.,Wageningen Univ, Div Human Nutr, NL-6708 WE Wageningen, Netherlands.,McGill University,Wageningen University (författare)

Low-Frequency Synonymous Coding Variation in CYP2R1 Has Large Effects on Vitamin D Levels and Risk of Multiple Sclerosis

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • Elsevier BV,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/258167
  • https://gup.ub.gu.se/publication/258167URI
  • https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2017.06.014DOI
  • https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-334046URI
  • https://lup.lub.lu.se/record/1c614c70-4ef0-4f03-86d1-5da5a25aabeaURI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Vitamin D insufficiency is common, correctable, and influenced by genetic factors, and it has been associated with risk of several diseases. We sought to identify low-frequency genetic variants that strongly increase the risk of vitamin D insufficiency and tested their effect on risk of multiple sclerosis, a disease influenced by low vitamin D concentrations. We used whole-genome sequencing data from 2,619 individuals through the UK10K program and deep-imputation data from 39,655 individuals genotyped genome-wide. Meta-analysis of the summary statistics from 19 cohorts identified in CYP2R1 the low-frequency (minor allele frequency = 2.5%) synonymous coding variant g.14900931G>A (p.Asp120Asp) (rs117913124[A]), which conferred a large effect on 25-hydroxyvitamin D (25OHD) levels (-0.43 SD of standardized natural log-transformed 25OHD per A allele; p value = 1.5 x 10(-88)). The effect on 25OHD was four times larger and independent of the effect of a previously described common variant near CYP2R1. By analyzing 8,711 individuals, we showed that heterozygote carriers of this low-frequency variant have an increased risk of vitamin D insufficiency (odds ratio [OR] = 2.2, 95% confidence interval [CI] = 1.78-2.78, p = 1.26 3 10 x(-12)). Individuals carrying one copy of this variant also had increased odds of multiple sclerosis (OR = 1.4, 95% CI = 1.19-1.64, p = 2.63 3 10 x(-5)) in a sample of 5,927 case and 5,599 control subjects. In conclusion, we describe a low-frequency CYP2R1 coding variant that exerts the largest effect upon 25OHD levels identified to date in the general European population and implicates vitamin D in the etiology of multiple sclerosis.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Dudding, T.Univ Bristol, Med Res Council, Integrat Epidemiol Unit, Bristol BS8 2BN, Avon, England.,University of Bristol (författare)
  • Haworth, S.Univ Bristol, Med Res Council, Integrat Epidemiol Unit, Bristol BS8 2BN, Avon, England.,University of Bristol (författare)
  • Hsu, Y. H.Hebrew SeniorLife, Inst Aging Res, Boston, MA 02131 USA.;Harvard Med Sch, Boston, MA 02115 USA.;Broad Inst MIT & Harvard, Boston, MA 02142 USA.,Harvard Medical School,Broad Institute (författare)
  • Liu, C. T.Boston Univ, Sch Publ Hlth, Dept Biostat, Boston, MA 02118 USA.,Boston University (författare)
  • Medina-Gomez, C.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Voortman, T.Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • van der Velde, N.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Acad Med Ctr, Dept Internal Med, Sect Geriatr, NL-1105 AZ Amsterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Melhus, HåkanUppsala University,Uppsala universitet,Klinisk farmakogenomik och osteoporos(Swepub:uu)hakamelh (författare)
  • Robinson-Cohen, C.Univ Washington, Div Nephrol, Kidney Res Inst, Seattle, WA 98195 USA.,University of Washington (författare)
  • Lind, LarsUppsala University,Uppsala universitet,Kardiovaskulär epidemiologi,University of Pennsylvania,The Children's Hospital of Philadelphia,University of Washington(Swepub:uu)larslind (författare)
  • Nethander, Maria,1980Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Bioinformatics,Centre for Bone and Arthritis Research,Core Facilities, Bioinformatics,Univ Gothenburg, Sahlgrenska Acad, Inst Med,Ctr Bone & Arthrit, Dept Internal Med & Clin Nutr, S-40530 Gothenburg, Sweden.;Univ Gothenburg, Sahlgrenska Acad, Bioinformat Core Facil, S-41390 Gothenburg, Sweden.,Sahlgrenska Academy(Swepub:gu)xnetma (författare)
  • Vandenput, Liesbeth,1974Gothenburg University,Göteborgs universitet,Centre for Bone and Arthritis Research,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition,Univ Gothenburg, Sahlgrenska Acad, Inst Med,Ctr Bone & Arthrit, Dept Internal Med & Clin Nutr, S-40530 Gothenburg, Sweden.,Sahlgrenska Academy(Swepub:gu)xvanli (författare)
  • Noordam, R.Leiden Univ, Med Ctr, Dept Internal Med, Sect Gerontol & Geriatr, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands.,Leiden University Medical Centre (författare)
  • Forgetta, V.McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 1B1, Canada.;McGill Univ, Jewish Gen Hosp, Lady Davis Inst Med Res, Montreal, PQ H3T 1E2, Canada.,McGill University (författare)
  • Greenwood, C. M. T.McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 1B1, Canada.;McGill Univ, Jewish Gen Hosp, Lady Davis Inst Med Res, Montreal, PQ H3T 1E2, Canada.;McGill Univ, Dept Epidemiol Biostat & Occupat Hlth, Montreal, PQ H3A 1A2, Canada.;McGill Univ, Dept Oncol, Montreal, PQ H4A 3T2, Canada.,McGill University (författare)
  • Lorentzon, Mattias,1970Gothenburg University,Göteborgs universitet,Centre for Bone and Arthritis Research,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition(Swepub:gu)xlomat (författare)
  • Psaty, B. M.Univ Washington, Dept Med Epidemiol & Hlth Serv, Cardiovasc Hlth Res Unit, Seattle, WA 98101 USA.;Kaiser Permanente Washington Hlth Res Unit, Seattle, WA 98101 USA.,Kaiser Permanente Research Institute,University of Washington (författare)
  • Rotter, J. I.Los Angeles Biomed Res Inst, Inst Translat Genom & Populat Sci, Torrance, CA 90502 USA.;Harbor UCLA Med Ctr, Dept Pediat, Torrance, CA 90502 USA.,University of California, Los Angeles (författare)
  • Zemel, B. S.Univ Penn, Perelman Sch Med, Dept Pediat, Philadelphia, PA 19104 USA.;Childrens Hosp Philadelphia, Div Gastroenterol Hepatol & Nutr, Philadelphia, PA 19104 USA.,Univ Cambridge, Dept Clin Neurosci, Box 165,Cambridge Biomed Campus,Hills Rd, Cambridge CB2 0QQ, England.,The Children's Hospital of Philadelphia,University of Pennsylvania (författare)
  • Taylor, B.Univ Tasmania, Menzies Inst Med Res, Locked Bag 23, Hobart, Tas 7000, Australia.,University of Tasmania (författare)
  • Lorentzon, Mattias,1970Gothenburg University,Göteborgs universitet,Centre for Bone and Arthritis Research,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition(Swepub:gu)xlomat (författare)
  • Karlsson, MagnusLund University,Lunds universitet,Ortopedi - klinisk och molekylär osteoporosforskning,Forskargrupper vid Lunds universitet,Orthopedics - Clinical and Molecular Osteoporosis Research,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital(Swepub:lu)orto-mka (författare)
  • Jaddoe, V. V. W.Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Tiemeier, H.Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Child & Adolescent Psychiat Psychol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Campos-Obando, N.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Franco, O. H.Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Utterlinden, A. G.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Broer, L.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Mellström, Dan,1945Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Centre for Bone and Arthritis Research,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition(Swepub:gu)xmelda (författare)
  • Ham, A. C.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Ikram, M. A.Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Radiol & Nucl Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Karasik, D.Hebrew SeniorLife, Inst Aging Res, Boston, MA 02131 USA. (författare)
  • de Mutsert, R.Leiden Univ, Med Ctr, Dept Clin Epidemiol, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands.,Leiden University Medical Centre (författare)
  • Rosendaal, F. R.Leiden Univ, Med Ctr, Dept Clin Epidemiol, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands.,Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Generat R Study Grp, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.;Erasmus MC, Dept Epidemiol, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Leiden University Medical Centre,Erasmus University Medical Center (författare)
  • den Heijer, M.Vrije Univ Amsterdam, Med Ctr, Dept Endocrinol, NL-1081 HV Amsterdam, Netherlands.,Amsterdam UMC - Vrije Universiteit Amsterdam (författare)
  • Wang, T. J.Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Cardiovasc Med, Nashville, TN 37232 USA.,Vanderbilt University (författare)
  • Lind, L. (författare)
  • Orwoll, E. S.Oregon Hlth & Sci Univ, Bone & Mineral Unit, Portland, OR 97239 USA.;Oregon Hlth & Sci Univ, Dept Med, Portland, OR 97239 USA.,Oregon Health & Science University (författare)
  • Mook-Kanamori, D. O.Leiden Univ, Med Ctr, Dept Clin Epidemiol, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands.;Leiden Univ, Med Ctr, Dept Publ Hlth & Primary Care, NL-2333 ZA Leiden, Netherlands.,Leiden University Medical Centre (författare)
  • Michaëlsson, Karl,1959-Uppsala University,Uppsala universitet,Ortopedi(Swepub:uu)karlmich (författare)
  • Kestenbaum, B.Univ Washington, Div Nephrol, Kidney Res Inst, Seattle, WA 98195 USA.,University of Washington (författare)
  • Ohlsson, Claes,1965Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Centre for Bone and Arthritis Research,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition,Univ Gothenburg, Sahlgrenska Acad, Inst Med,Ctr Bone & Arthrit, Dept Internal Med & Clin Nutr, S-40530 Gothenburg, Sweden.,Sahlgrenska Academy(Swepub:gu)xohlcl (författare)
  • Mellström, Dan,1945Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Centre for Bone and Arthritis Research,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition(Swepub:gu)xmelda (författare)
  • de Groot, Lcpgm (författare)
  • Grant, S. F. A.Childrens Hosp Philadelphia, Div Human Genet, Philadelphia, PA 19104 USA.;Univ Penn, Perelman Sch Med, Dept Pediat, Philadelphia, PA 19104 USA.;Childrens Hosp Philadelphia, Div Endocrinol, Philadelphia, PA 19104 USA.,University of Pennsylvania,The Children's Hospital of Philadelphia (författare)
  • Kiel, D. P.Hebrew SeniorLife, Inst Aging Res, Boston, MA 02131 USA.;Harvard Med Sch, Boston, MA 02115 USA.;Broad Inst MIT & Harvard, Boston, MA 02142 USA.;Beth Israel Deaconess Med Ctr, Boston, MA 02215 USA.,Harvard Medical School,Beth Israel Deaconess Medical Center,Broad Institute (författare)
  • Zillikens, M. C.Erasmus MC, Dept Internal Med, NL-3015 GE Rotterdam, Netherlands.,Erasmus University Medical Center (författare)
  • Rivadeneira, F. (författare)
  • Sawcer, S.University of Cambridge (författare)
  • Timpson, N. J.Univ Bristol, Med Res Council, Integrat Epidemiol Unit, Bristol BS8 2BN, Avon, England.,University of Bristol (författare)
  • Richards, J. B.McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 1B1, Canada.;McGill Univ, Jewish Gen Hosp, Lady Davis Inst Med Res, Montreal, PQ H3T 1E2, Canada.;Kings Coll London, Dept Twin Res & Genet Epidemiol, London WC2R 2LS, England.;McGill Univ, Dept Med, Montreal, PQ H3G 1Y6, Canada.,King's College London,McGill University (författare)
  • Sella Sj, Journal Of Pediatrics V. P. (författare)
  • Mitchell, Jonathan A.Univ Penn, Perelman Sch Med, Dept Pediat, Philadelphia, PA 19104 USA.;Childrens Hosp Philadelphia, Div Gastroenterol Hepatol & Nutr, Philadelphia, PA 19104 USA.,The Children's Hospital of Philadelphia,University of Pennsylvania (författare)
  • McGill Univ, Dept Human Genet, Montreal, PQ H3A 1B1, Canada.;McGill Univ, Jewish Gen Hosp, Lady Davis Inst Med Res, Montreal, PQ H3T 1E2, Canada.Wageningen Univ, Div Human Nutr, NL-6708 WE Wageningen, Netherlands. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:American Journal of Human Genetics: Elsevier BV101:2, s. 227-2380002-92971537-6605

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy